猪舍发酵床是微生物工程技术在农业特别是养猪业中的典型应用。猪舍发酵床式养猪因环保、生态、省时、省工、省料、肉质好等显著特点受到欧美、德、日、韩等发达国家养猪业界的热烈欢迎，普及面很广，国内也正在大力推广普及。
发酵床式猪圈养猪是利用微生物作为物质能量循环、转换的“中枢”性作用，采用高科技手段采集特定有益微生物，通过筛选、培养、检验、提纯、复壮与扩繁等工艺流程，形成具备强大活力的功能微生物菌种，再按一定的比例将其与锯末或木屑、辅助材料、活性剂、食盐等混合发酵制成有机复合垫料，自动满足舍内牲猪对保温、通气、以及对微量元素生理性需求的一种环保生态型养猪模式。
发酵床式猪舍内，牲猪从出生开始就生活在这种有机垫料上，其排泄物被微生物迅速降解、消化或转化；而猪的粪便所提供的营养使有益功能菌不断繁殖，形成高蛋白的菌丝，被猪食入后，既有利于消化和提高免疫力，还能使饲料转化率提高，出栏相同体重的育肥猪大约可节省饲料20%~30%，同时可以省去大量人工劳动。