（1）种蛋的运输。种蛋运输前应包装良好，防震防碰。包装盛器要坚实，能承受一定的压力，一般用纸箱或塑料制的专用种蛋箱盛放。装蛋时，蛋与蛋之间要隔开，以防直接接触而碰撞。装箱时，蛋要竖放，钝端朝上，每箱（筐）要装满。在运输过程中，应尽量避免日晒雨淋，冬季要保暖防冻。运输时要求平稳，严防强裂震动引起蛋壳或蛋黄膜破裂，损坏种蛋。长途运输要尽量缩短运输时间，到达目的地后要及时开箱检查，剔除破蛋，尽快消毒装盘入孵。
（2）种蛋的保存。种蛋要求保存在清洁、整齐、无灰尘、无老鼠的蛋库内，最好能安装空调，以保持恒温。种蛋保存的适宜温度为12℃～15℃。保存时间在1周以内以14℃～15℃最好，超过1周时以11℃～12℃为好。保存种蛋的环境湿度以相对湿度70％～75％较为理想，这种湿度与鸭蛋的含水率较接近，蛋内水分不会大量蒸发。种蛋保存一般以钝端（大头）向上为宜，以便气室保持适当的位置。如种蛋保存时间超过一周时，应每天翻蛋一次，使蛋位转动角度达90度以上，以防蛋黄与蛋壳粘连。种蛋保存时间不能过长，一般不应超过7天。保存时间越长，种蛋质量越差，孵化率越低。