该病是由灰飞虱传播的一种病毒病，水稻播种后，灰飞虱在病麦上吸毒后再传到水稻秧苗上。发病轻重或流行与否主要取决于灰飞虱发生数量、带毒率、感病品种、种植面积和气候条件等因素。毒源的多少，主要看越冬作物（大麦、小麦）条纹叶枯病发生的轻重。若冬春季灰飞虱成活率高、繁殖数量大，则传毒的概率就高。粳稻较籼稻易感病，秧苗期和本田分蘖期较易感病。因此，应采取以防治灰飞虱为主的综防措施。
（1）推广优质抗病品种，提倡连片种植，减少插花田。
（2）适当推迟水稻播栽期：通过推迟播栽期，避开灰飞虱迁移高峰期，可减轻秧田的药剂防治压力，如江苏沿江、苏南等有条件的地区通过推迟播栽期（常规水育秧于5月20日前后播种），避开灰飞虱成虫迁入高峰，可显著减轻病害发生程度。
（3）推广肥床旱育秧技术：因灰飞虱具趋水趋嫩绿性，秧苗旱育，植株健壮，灰飞虱迁入量明显比水育秧田少，加强肥水管理，促进水稻健株分蘖，提高秧苗抗病能力。同时，铲除田边杂草，减少毒源。
（4）坚持防治秧田期、保护本田期，防治早稻田、保护晚稻田的原则。重点做好药剂浸种工作，使用吡虫啉、锐劲特等有效药剂浸种，压低秧田灰飞虱虫量，减轻发病率。同时，应掌握在5月底灰飞虱迁入秧田高峰期、6月上旬二代孵化高峰期，每亩用5％锐劲特悬浮液30～50毫升或10％吡虫啉可湿性粉剂20克防治。另外，对秧田周围50米范围内的田块一并喷药防治，减少虫口基数。