防治白叶枯病应以推广种植抗病良种为基础，清除菌源，以秧田防治为重点，合理肥水管理，加强预测预报，及时施药，才能收到良好的防治效果，达到丰产增收的目的。
（1）推广抗病品种。推广抗病品种是防治白叶枯病最经济、易行、安全而有效的措施。20世纪60年代中期至70年代初，太湖稻区，由于晚粳稻农垦58的大面积推广，白叶枯病明显变轻。洞庭湖稻区，80年代以来由于推广抗病的以IR26、IR30、IR36等作恢复系选配的杂交稻组合如汕优6号、威优6号、威优64及常规稻BG90-2为主体亲本的扬稻系列及湘早籼3号、湘早籼6号，湖北鄂早6号、湖北鄂早7号抗病品种，病害造成的损失逐年下降。珠江三角洲稻区，80～90年代除推广抗病的杂交稻外，还推广了青华矮6号、晚华矮1号、特青、特三矮、胜优2号等一批抗病品种。2000年以来，育种家将野生稻中抗向叶枯病的基因导入水稻品种中，育成一批抗谱广、抗性持久的品种，加以推广，使近年白叶枯病的流行程度明显变轻。
（2）杜绝菌源。选留优良种子：选择无病或病轻田块选留稻种，以减少种子上的带菌量，减轻病害的发生。种子处理：精选去杂，选留籽粒饱满、发育充分的优质种子，播种前进行药剂浸种。浸种药剂的选用可根据当地药源情况而定，处理方法：强氯精300倍液浸种，先清水预浸12小时，后药水浸，早稻24小时，晚稻12小时；中生菌素，100毫克／千克，水温58℃下浸种48小时；10％叶枯净，200倍液，浸种24～48小时。此外，药剂缺乏时仍可用1％石灰水浸种，早、中稻浸2～3天，晚稻浸1～2天。浸种水面要高出种子3厘米左右，使种谷始终浸没在石灰水中，不要搅动，并加盖避免阳光直射。
（3）加强栽培管理。施肥要注意氮、磷、钾的配合，基肥应以有机肥为主，后期慎用氮肥；绿肥或其他有机肥过多的田，可施用适量石灰和草木灰。要浅水勤灌，适时适度搁田，严防秧苗淹水，铲除田边杂草，这些都有减轻发病的作用。
（4）药剂防治。根据预测预报的结果，或经系统调查发现田间发病中心后，要及时用药防治。防治白叶枯病可用下列药剂：①叶枯净（杀枯净）：10％可湿性粉剂200倍液，每次每亩喷药液100千克；②敌枯唑（叶枯灵）：50％可湿性粉剂1000倍液，每次每亩喷洒100千克；③中生菌素：使用浓度为15毫克／千克，每次每亩喷洒75～100千克；④噻枯唑（叶青双，川化018）：20％可湿性粉剂800～l000倍液，喷洒60～75千克。用药次数可根据病情发展，每隔5～7天，连续施药1～3次。为了延缓病菌抗药性的发展，对药剂要进行合理轮换使用，以延长药剂的使用寿命和确保它们的防治效果。目前，已在田间检测到噻枯唑的抗性菌株，这些菌株对敌枯唑表现交互抗性，且抗药性稳定，而对叶枯净不表现交互抗性，因此应将噻枯唑或敌枯唑与叶枯净轮流使用，不能单独长期使用单一种药剂或与之有交互抗性的药剂。