荞麦立枯病俗称腰折病，是荞麦苗期的主要病害。一般在间苗后半月左右发生，有时也在种子萌发出土时就发病，常造成烂种、烂芽、缺苗断垄。受害的种芽变黄褐色腐烂。荞麦幼苗容易感染此病，病苗茎基部出现赤褐色病斑，逐渐扩大凹陷，严重时扩展到茎的四周，幼苗萎蔫枯死。子叶受害后出现不规则的黄褐色病斑，而后病部破裂脱落穿孔，边缘残缺。常常造成20％的损失。
其防治方法主要如下：
（1）深耕轮作。秋收后，及时清除病残体并进行深耕，可将土壤表面的病菌埋入深土层内，减少病菌侵染。合理轮作，适时播种，精耕细作，促进幼苗生长健壮，增强抗病能力。
（2）药剂拌种。用50%的多菌灵可湿性粉剂250克拌种50千克效果较好，也可用40％的五氯硝基苯粉剂拌种或搓种，100千克种子加0.25～0.5千克药剂拌种。
（3）喷药防治。幼苗在低温多雨的情况下发病较重，因此，苗期喷药也是防病的有效措施。常用的药剂有65％代森锌可湿性粉刺500～600倍液、复方多菌灵胶悬剂或甲基托布津800～1000倍液，都有较好的防病作用。