荞麦花为有限和无限的混生花序，顶生和腋生，簇状的螺状聚伞花序，呈总状、圆锥状或伞房状，着生于花序轴或分枝的花序轴上。花多为两性花，单被，花冠状，常为5枚，只基部连合，花色因品种而异，有绿色、黄绿色、白色、玫瑰色、红色、紫红色等。雄蕊不外伸或稍外露，常为8枚，成两轮（内轮3枚，外轮5枚）。
荞麦花密集成簇，每簇由25～30朵花组成，梗较长，花较小，直立或下垂，每株有花300～500朵，生长良好时，一株可达1500～2000朵。
苦荞花较小，无蜜腺，无香味，白色或淡绿色，花朵着生比较稀疏，自花、异花均可授粉结实；甜荞花较大，有香味，花朵密集，基部蜜腺发达，一般为6～8个，能分泌蜜汁，引诱昆虫传粉。
甜荞花器有两种类型：一种类型植株的花是短雄蕊长花柱，长花柱伸出雄蕊之上；另一种类型植株的花是长雄蕊短花柱，短花柱缩于雄蕊之下，这种异型花的特点与授粉结实有密切关系。虽然甜荞花有两种类型，但同一植株只有一种花型。在大田栽培情况下，两种花型的植株均有，且数量大致相等。有时也出现雌、雄蕊等长的花，但不能结实。