南瓜根系吸肥吸水能力强，一些难于栽培蔬菜的土地都可种植。它对土壤要求不严格，在贫瘠的山坡地也能生长，但土壤肥沃、营养丰富有利于雌花形成，且雌花与雄花的比例增高。土壤适宜的pH值为6.5～7.5。
南瓜极耐肥，大量施用厩肥效果好。但是在南瓜生长前期如果氮肥过多，容易引起茎叶徒长，头瓜不易坐稳而脱落，而过晚施用氮肥则影响果实的膨大。南瓜苗期对营养元素的吸收比较缓慢，甩蔓以后吸收量明显增加。在头瓜坐稳之后，是需肥量最大的时期，营养充足可促进茎叶生长，有利于获得高产。南瓜对氮、磷、钾三要素的吸收量比黄瓜约高1倍，是吸肥量最多的蔬菜作物之一，在整个生育期内对营养元素的吸收以钾和氮为主，钙居中，镁和磷较少。