症状：苗期、伸蔓期到结果期都可发生，开花坐果期和果实膨大期是发病高峰期。幼苗发病，子叶萎蔫或全株枯萎，呈猝倒状。开花结果后发病，病株叶片逐渐萎蔫，似缺水状，中午更为明显，早晚尚能恢复，数日后整株叶片呈褐色腐烂，稍缢缩，茎基部纵裂，裂口处有时溢出琥珀色胶状物，将病茎纵剖，可见维管束呈黄褐色。在潮湿环境下，病部表面常产生白色及粉色霉状物，即病菌分生孢子。
病菌及发病规律：该病由真菌侵染所致，病原菌可在土壤中、病残体上、未经腐熟的肥料中及种子上越冬。病原菌在土壤中能存活5年左右。可借种子带菌进行传播。病原菌从南瓜根部侵入为害，根部受伤或有线虫为害的伤口，有利于病原菌侵染。在24℃～28℃，相对湿度大于90％时，易发病。土壤偏酸，土质黏重，地势低洼，田间管理粗放，偏施氮肥及施用未经腐熟的有机肥，秧苗老化，大水浇灌或土壤过分干旱，连作，有线虫为害，都可加重枯萎病发生。