一、包埋方法
（一）包埋剂
1．石蜡软石蜡（熔点45℃）适用于质地软的组织（如胎儿组织）。硬石蜡（熔点60℃）适于致密纤维组织、骨等。一般选用熔点56℃的石蜡，对各种组织大致均可适用。气温高的地方不能选用软石蜡，否则蜡块易熔，保存不便。
2．塑料类多聚化合物加入石蜡中，可增加韧性和弹性。
3．二甲基亚砜（DMSO）可加入石蜡中，促进浸蜡过程。在没有真空浸蜡装置时特别适用。
4．橡胶加入石蜡中可增加弹性。特别适用于环状组织，可使切片中组织形状保持不变。
5．蜂蜡与石蜡合用（按10％～20％比例加入），可使组织块韧性均一，弹性增加，切片不起皱。
（二）包埋装置
主要是各种型号的模子（不锈钢或塑料的）。
（三）石蜡包埋技术
镊子加热后，取出浸蜡的组织盒，从中央取出组织块，放在大小合适并已加入部分石蜡的模子底部。将模子从加热板上移到冷却板上，底部石蜡很快凝成一层，轻压组织块，使其位置恰当。同时包埋多块组织时，操作必须迅速，否则组织块位置尚未调整好，石蜡便已完全凝固。然后注入另一部分石蜡，冷凝约30分钟，拆去模子。
（四）火棉胶包埋
火棉胶在以往使用较多，因其对硬组织或易碎组织（眼、神经组织）包埋效果较好。现在由于多种新型石蜡产品的问世，已较少使用。但因为火棉胶包埋过程中不需加热，故对不耐热的组织的浸透包埋仍十分有价值。概括起来，火棉胶包埋的优点是：①组织收缩和变硬极轻（因未加热）；②组织中各成分位置关系保存良好；③对研究体积大的标本、胚胎标本等十分有用。
火棉胶包埋有下列缺点：①时间长，浸透需7～10天；
②易受潮，结果不能凝固，形成的块太软，不能切片；③组织块必须保存在70％～80％酒精中；④切片时，切片刀和组织块都须用70％～80％酒精保持湿润⑤切片较厚，很难切出薄于10微米的切片；⑥包埋中需用易燃品乙醚。
市售火棉胶分干品和湿品（在纯酒精中保持湿润状态）。
干品较好，可直接使用，但价格较贵，湿品须先放在滤纸上入37℃孵箱中过夜，然后才能配制浓度准确的火棉胶液。
干的火棉胶按每100毫升纯酒精加24克的比例加入纯酒精中，浸泡至其溶解。浸泡期间须常搅拌，完全溶解后，加入100毫升乙醚，即得12％火棉胶溶液。用它配制其他浓度的溶液。
配好后的火棉胶溶液须贮存在玻璃瓶中，盖好瓶塞，以防蒸发及受潮。乙醚为易燃品，须加小心。
1．浸透组织切成5毫米以下薄片。固定、脱水后按下列程序处理。
（1）湿法
1）乙醚、纯酒精各等分混合，浸泡24小时；
2）4％火棉胶溶液2～3天；
3）8％火棉胶溶液，2～3天；
4）12％火棉胶溶剂，2～3天；
5）包埋。
（2）干法
1）乙醚、纯酒精各等分混合，浸泡24小时；
2）4％火棉胶溶液2～3天；
3）8％火棉胶溶液，2～3天；
4）12％火棉胶溶剂，2～3天；
5）松柏油、氯仿等份混合，浸24小时；
6）松柏油3份、氯仿l份混合后，浸24小时；
7）松柏油，24小时。
2．火棉胶包埋技术
（1）在深2～3厘米以上的模子中，注入浓火棉胶（12％），再注入组织块，调整好方位。
（2）模子置入钟罩／干燥器中12小时，让火棉胶内的气泡完全消失。真空可以加速其消失。
（3）打开钟罩／干燥器，让火棉胶变干变硬，直至指压无痕迹。模子旁放一氯仿棉球可以加速此过程。
（4）如用湿火棉胶法切片，取出组织块，倒置浸入80％酒精中，切片时再取出。
3．火棉胶常用于包埋较大组织，此时将包埋块固定在硬橡胶或木板上，才能装上切片机
方法如下：
（1）包埋块修成立方形；
（2）硬橡胶或木块表面涂以2％火棉胶，将包埋块紧压 其上，加压至黏合牢固（注意：涂抹前须先将表面打糙）。
（3）切片前1小时，放入80％酒精中使之变硬。
二、 标本包埋的方位
包埋时技术员须仔细检查每一组织块，看清其结构，再决定如何包埋。技术员须具有大体标本结构的基本知识，并随时与医师讨论，这样才能达到显示出所需结构的最终目的。医师要求某一标本按某特定方位包埋时，应作好标记（如表面或切缘可以墨汁标记），或在工作单上写明要求。
（一） 通则
（1）组织块应展平，操作须轻柔。
（2）如组织块中各层结构阻力不等，应使阻力低的部分先接触刀口，阻力大的部分最后切到。以避免硬组织将较软的组织挤开。
（3）组织四周应有不少于2毫米的石蜡，以保证切片时组织有充分的支持。
（二）管状结构（如血管、输卵管）
应使切片为横切面。
（三）上皮结构（皮肤、肠壁组织等）
应使切片能显示各层结构。上皮应位于上面，使切片时最后切到上皮，这样可减少变形。多块组织包于一起时，应排成整齐的一排，上皮均朝向上方。组织块太小时不易辨认上皮，可在组织自动处理机的第二缸纯酒精中加5毫升酒精—伊红贮存液，使各层结构易于辨认。伊红在切片水化时被冲掉，不影响染色。
（四）大而致密的组织块（如子宫壁、甲状腺、骨等）
应使组织与刀口略成角度，以减少阻力，否则易把组织从蜡块中挤出去。这样还可减少刀的振动。
（五）多块小组织、淋巴结等
应排列整齐，但应留有空隙。小的长条形组织应排列成长轴与刀缘平行，减少变形和皱缩。
（六）囊状组织
小囊状组织正中剖开，切面向下包埋。
（七）墨汁标记的表面和切缘
标有切缘者，使切缘在切片上位于一侧；标有表面者，使表面朝上（与刀口相对）。