转变政府机构职能作为转换国有大中型企业经营机制的“先行者”，袁宝华认为其核心是要正确处理政府与企业，政府与市场的关系。
经济宏观调控
在谈到政府与企业的关系时，袁宝华认为，两者的关系正如一位美国经济学家和一位日本经济记者分别所说的：“政府是航船的舵手，企业是船上的发动机”，“政府是马路警察，企业是汽车司机”，政府管指挥，真正使经济运行的是企业，而非政府。在过去，企业归政府全包，政府像托儿所的保姆，企业像托儿所的小孩子，即使已长大成人，仍然要受保姆的管辖，不让企业施展手脚，这样企业就不可能锻炼成长起来。因此，政企要分开，政府要把经营自主权还给企业，政府的职能应该是建立起国民经济宏观调控体系。政府宏观调控首先要管社会总供给与总需求的平衡，要保证基本平衡，政策上必须把握好利率、汇率、税率的高低等。政策对于建立宏观调控体系非常重要。其次，政府还要掌握好产业政策，防止各产业间的比例失调。就目前而言，中国应大力发展第三产业。总而言之，政府今后要把具体的事情放给企业自主经营，政府应管大事，保证整个国民经济的运行走上持续稳定协调发展的轨道。
促进市场发育
把企业推向市场，建立起市场机制是转换企业经营机制的一个重要内容。在这个过程中政府起着不可低估的作用。袁宝华认为，在处理政府与市场的关系时，政府职能主要表现在两个方面。首先政府要促进市场的发育。市场不发育，企业就没有用武之地。市场的领域是广阔的，不仅包括消费品市场、生产资料市场，还包括金融市场、劳动力市场、信息市场等等。政府要在政策上、行政管理上促进市场发育。目前政府为企业服务最重要的一条是信息服务，过去我们对此重视不够，现在国务院副总理邹家华已提出，将长期封闭的国家计委经济信息中心向社会开放，为社会服务，即所谓“信息共享”。
管理监督市场
再者，政府要在政策、法令、条例的建设上对市场进行管理和监督，以建立起体现“公开、公平、公正”原则的市场竞争机制。现在的市场宏观调控的能力薄弱，市场往往处于无序状态，秩序不好，一些非法手段如给回扣、行贿受贿被不法者使用，使市场存在不平等的竞争。要建立起真正公平的市场竞争机制，税收和价格制度必须改革。目前，国有企业、乡镇企业、外资企业的税赋不平等，外资企业税率为20%～30%，国有企业为55%。因此一些厂长抱怨说：“我是个小媳妇，又是块唐僧肉，谁都可以咬一口。”“我们的企业是责任大、权利小、婆婆多、负担重。”就此情况，国家财政部正考虑，将国有企业税率由55%降至30%。
袁宝华还表示，要实现市场“三公原则”，不仅在税赋上要基本平等，而且要给企业自己定价的权利，即根据国家的法律以及国家规定的幅度自己定价。他透露，国家过去给首都钢铁公司以优惠政策，15%钢材自己定价，其他钢厂只有5%，而现在国家已给其他钢厂百分之十几的自定价格的权利。