制定切实可行的防疫隔离制度，能有效地控制传染源、切断传播途径，有利于控制疫病的发生。
（1）鹿场的建设及管理。①鹿场应设在有利于隔离的地方，要远离交通要道和居民区，并在鹿场周围建造围墙。鹿场入口要建消毒池和更衣室。②鹿舍要固定工作人员和用具。③保持鹿舍清洁卫生，及时清扫粪便，定时消毒食槽、饮水器。④鹿舍内的垫草、粪便和废弃物应送往远离鹿舍的地方发酵或进行无害化学处理。
（2）鹿群的防疫隔离。①每天检查鹿群的健康状况，发现病鹿及时隔离治疗，死鹿要焚烧或深埋。②引进鹿种要隔离观察至少1个月，方可入场饲养。
（3）人员和车辆的防疫隔离。①非工作人员不准进入饲养区，工作人员进入饲养区要更换消毒过的工作服及鞋帽。②原则上禁止车辆进入生产区，确需进入时要对车辆进行严格消毒。
（4）疫情隔离与封锁。发生传染病时，对病鹿、可疑感染鹿、假定健康鹿要区别对待，严格隔离饲养。①严格隔离。病鹿应在彻底消毒的情况下，移入隔离圈，要有专人饲养，严加护理和治疗，不许越出隔离场所。可疑感染鹿，无明显的症状，但与病鹿或其污染的环境有过明显接触的，这类鹿应在消毒后另地看管。假定健康鹿，一切正常，且与前两类鹿及污染的环境没有明显的接触，应与前两类鹿分开饲养，同时立即进行紧急免疫接种。②严密封锁。当暴发某些传染病时，还应严格划区封锁并采取具体措施。在封锁区边缘设立明显标志，设置监督岗哨，禁止易感动物通过封锁线。对于病死的鹿的尸体应深埋，做好杀虫灭鼠工作，禁止从疫区输出鹿和污染的饲料等。疫区和受威胁区的易感动物应及时做预防接种，建立防疫带。在最后一头病鹿痊愈、急宰和捕杀后，经过一定封锁期，再无疫病发生时，经全面终末消毒后解除封锁。