自然栽培分为菌床栽培和原木栽培两种。菌床栽培是将菌丝 已走透的菌床埋入土中，并覆土，入秋即可收获。通常是利 用温室栽培中已出过一潮菇的废菌床。原木栽培是利用短木 条、木块，装袋，灭菌，接种，培养，并让其走透菌丝后埋 入土中，覆薄土。自然栽培的灰树花较温室内栽培的肉质厚 韧，子实体表面色较深，香味较浓。
（1）菌床的栽培。①菌床（袋）。制作、培养同上，也可利 用已出过一潮菇的废菌床。菇场选择阴度80％左右的林地或 搭盖荫棚。②埋菌床。埋菌床时间7～8月，菌床去掉塑料袋 后，2～3个菌床紧靠一起埋一穴，一畦二穴，穴距20厘米 ×20厘米，表面盖土3～5厘米厚，圆锥形，再盖枯叶2厘米， 保持表层土壤湿润。③管理。夏天因气温高，水分蒸发快， 要经常检查土壤湿度，土壤水分不足要洒水，清除表面土的 杂草。原基形成后需盖薄膜，提高湿度，并防止下雨时土溅 菇上。④采收。子实体原基形成后经过15～20天生长即可成 熟采收。
（2）原木栽培。①选材。选用陈旧树枝条，锯成长15厘米 ，浸水，使枝条含水量达75％。②装袋。选用17厘米×33厘 米×（0.04～0.055）毫米聚丙烯袋，袋内部空隙用木屑填满 ，袋口套环加盖。③灭菌。常压100℃保持8～10小时；高压 121℃保持2小时。④接种培养。接种适期为12月至翌年4月。 接种后在15℃～20℃环境中培养，菌丝生长会快些，4月以后 培养，自然气温即可。⑤埋土。时间为5～6月，去掉菌袋塑 料，单个或两个合在一起埋一穴，一畦两穴，穴距20厘米 ×20厘米，盖土厚度3～5厘米，穴顶呈圆锥形，再盖树叶2厘 米。⑥管理。采收方法同上，原木栽培可收获3～5年。因此 ，采收完，环境要清理干净，防止病虫发生。