大球盖菇病虫害的发生大多数都在产菇期间，喷洒药剂时， 若不注意使用方法，沾染在子实体上，则会造成大球盖菇污 染。现在各国对食品中的残余农药检验都非常严格，大球盖 菇中含有某些金属离子“迹量”就不能进入市场。因此，在 栽培过程中，万不得已才使用农药。使用农药要注意下列几 点：
第一，禁止将剧毒的有机汞剂或有机磷剂，如西力生、赛力 散等，用于菇床消毒或拌培养料。
第二，应选用高效低毒、残效期短、对人畜和大球盖菇菌丝 无害的农药，特别是植物杀虫剂和微生物杀虫杀菌剂，如除 虫菊、鱼藤精、烟草、苏云金杆菌、白僵菌等。
第三，残效时间很长、不易分解以及有刺激性臭味的农药， 如六六六、滴滴涕等，也不能用于菇床消毒。
第四，菇床上有子实体时，不能直接喷药，一般要在采收一 批菇后，结合整理菇床进行喷药。万不得已时，也要先把床 面上的子实体采摘完，再进行喷药，喷完农药后，要再喷1次 清水。
第五，配制农药时，应该先熟悉使用方法和使用浓度，以免 发生药害。滥用农药，有时会在覆土层或培养料表面形成一 层有毒物质，影响菌丝生长，造成大球盖菇减产。