白灵菇菌丝经旺盛生长后，生长速度渐渐减慢。其原因是白灵菇菌丝生长期间要进行呼吸，吸入氧气放出二氧化碳，释放热量。发菌场所如果通风不良，会造成空气中氧气不足，二氧化碳积累。
因此，发菌场所要经常通风换气，保持空气新鲜，氧气充足，通风时要注意对温度和湿度的影响，气温高时在早晨和夜间通风，下雨天减少或不通风。还可以通过拍打及揉捏菌的方法增氧，促进空气交换。经过补充氧气后，菌袋温度会再次升高，注意控制袋温不超过25℃。经30天左右菌丝便长满菌袋，菌丝发满袋后，不会立即出菇，菌丝须经过生理成熟期。
通风可以使发菌场地的空气状态接近外界空气，但过多的通风是不必要的，只要保持必需的通风量就可以了。发菌场所需不需要通风，可以凭人的感觉来判断，只要人感觉不发闷、呼吸正常就可以，当人觉得闷时必须通风。
白灵菇菌丝生长阶段不需要光照，光线过强，会对菌丝体生长产生抑制作用，使菌丝体生长速度下降，菌丝扭结形成菌皮，不仅消耗营养，对出菇也不利。因此，在发菌场所要注意蔽光，在无光的条件下，菌丝生长快而且健壮。