制种场房一般包括配料室、接种室、培养室、灭菌室、冷却室、菌种贮存室、洗涤间和原料仓库等。
（1）配料场所。用于配制培养基和进行装瓶（袋）作业。最好远离接种室，防止在拌料时原料中粉末携带杂菌进入接种室内，造成接种时感染杂菌。
（2）灭菌室。用于放置灭菌设备。要求离接种室近，最好与冷却室、接种室相连在一起，使灭菌后的料瓶（袋）尽量不与外界空气接触，防止空气中的杂菌附着在料瓶（袋）上。
（3）冷却室。用于对灭菌后的料瓶（袋）进行冷却。要求便于散热，在窗口上安装排风扇，同时安装微孔膜来过滤空气中的杂菌。有条件的可在室内墙壁上安装吸热材料来加快冷却。
（4）接种室。接种室要求干净、干燥、密闭，面积和空间不要太大，最好有缓冲走道或缓冲间。窗门上应安装双层玻璃，门缝隙要小并安上海绵方条。室内高度在2.5米左右，面积为10平方米为宜。在室内安装合适大小的紫外线杀菌灯和照明灯，还应配备操作台、接种工具、消毒药品以及接种所需的其他物品。
（5）培养室。用于培养菌种。要求干净、干燥、通风、保温、光线暗。一般民房都可作为培养室，大小由生产菌种的规模而定。培养室内放置菌种架，菌种架可用角铁焊制，也可用竹木搭建。