大棚栽培金针菇是近几年菇农的创举。选不积水、近水源、方便管理的冬闲稻田，平整土地。做宽1米、长度不限的畦，开宽50厘米、深30厘米的水沟，场地四周以内用毛竹、芦苇等搭盖成三分阳七分阴的大棚。将室内培养好的菌袋撑开袋口，使菌袋直立，然后将菌袋挨个立于畦面上，排放密度为每平方米80袋，袋口也应用报纸或地膜遮荫保湿，再用竹片在畦面做成拱棚或人字形棚，上盖薄膜、草帘。
出菇管理上每天掀开通风两次，使薄膜内有充足的氧气，并有一定浓度的二氧化碳。由于大棚的生态环境适合金针菇子实体生长的条件要求，有的产量要比室内栽培的高25％，而且质量很好。