床式生料栽培金针菇仅限于北方寒冷地区。此法具有栽培工艺简单，适于大规模、机械化生产的优点。但是，床栽易感染杂菌而且产量也不稳定，栽培不当损失很大。
床式生料栽培可在室内也可在人防工事、地道等场所进行。要求栽培场所干净，远离仓库、鸡舍，四周无杂菌繁殖；人防工事、地道要求有两个以上的洞口和一定高度，房屋要求门窗齐全，以便出菇期遮光。人防工事、地下室内要安装长1米、宽0．6米的通风窗，以利于控制二氧化碳浓度。地道及地下室内，每隔5米安装15瓦灯炮1只（最好安装在顶部），在出菇期可进行光诱导，使子实体向上生长。
栽培场所在栽培前，应先用2％敌敌畏和5％石灰水澄清液喷洒地面和四周。
栽培床宽以80厘米左右为宜，长度不限。人行道宽60厘米，以便于操作管理。床上铺塑料薄膜，宽为床面的二倍再加100厘米，即260厘米，目的是便于出菇时撑高30～60厘米。
床式生料培养，棉区一般采用棉籽壳，非棉区采用高粱壳、葵花籽皮等制作培养料，辅料不论是麸皮、米糠、玉米粉均可（同时加入1％石膏、过磷酸钙和0．1％多菌灵），但生料栽培使用的辅料要少，一般在10％以内，因辅料多，营养丰富，容易引来杂菌孳生，害虫为害。
床式生料栽培，气温在5℃～15℃之间最好，如果气温超过15℃污染率明显上升。
床式生料栽培所用菌种以深色菌种为宜，因为深色菌种的抗病虫能力较强。菌龄以40～50天较好，菌龄太长，影响发菌。
播种方式采用层状覆盖播种和混合播种相结合。播种量要求在10％左右，如遇温度较高时，应适当增加5％的播种量。接种后盖地膜大约10天，菌丝开始生长。如有些地方菌丝还没萌发，可轻轻抖动薄膜通气。一般情况下经过40～60天菌丝即可全部长满。此时，相对湿度要提高到85％以上，每天掀开薄膜通气10分钟。当床面黄水出现时，则意味着原基即将形成。这时应将薄膜支撑起来，高度为离料面12～15厘米。温度控制在10℃～12℃，湿度85％以上。每天增加通风次数达2～3次，揭膜通风1～2次，每次20分钟。1周以后，原基便大量发生，此时需遮光。随着菌柄的伸长，薄膜也要随着升高。当子实体长到1～2厘米长时，开始控制薄膜内二氧化碳浓度（0．114％～0．152％），使之抑制菌盖开伞，促进菌柄伸长。严格按要求管理，可培养出产量高质量好的金针菇。
床式生料栽培一旦菇蕾出现后很快生长，4～7天即可达10～15厘米长，10天后达25厘米长。要获得一级菇，必须在4～7天内采收。
北方过去一到冬天就得把蔬菜贮藏在地窖以备冬季食用，现在用塑料大棚栽培蔬菜，地窖的使用率大大降低。把闲置的地窖用来栽培金针菇是个理想的场所，既充分地利用地窖，使之产生效益，又可生产出金针菇，丰富淡季蔬菜，满足消费者的要求，一举两得。地窖一般设通风窗，冬季（1～2月份）最低温度0℃～1℃，稍加温可达8℃以上，夏季（7～8月）最高温度为20℃左右，春秋两季在8℃以上、16℃以下。一般金针菇栽培周期3个月，这样，利用地窖可全年连续生产。