（1）木屑。无论是阔叶树或针叶树的木屑都可以利用。木屑是栽培金针菇的主要原料，它能增加培养料的孔隙度，贮存空气，提高培养料的透气性，供给菌丝生长发育所需要的氧气。同时，能把水分吸附在木屑颗粒中，起到保湿作用，保证菌丝和子实体生育阶段所需要的水分。
以木屑作为栽培金针菇的原料时，应该注意到金针菇菌丝分解木屑的能力弱，同时，木屑含有树脂和单宁等有害物质。因此，使用的木屑最好是存放久的陈旧木屑，或是把木屑在使用前堆积在室外，经过一段时间的雨淋日晒，使有害成分流失或分解掉后再用。堆积的时间因木屑的种类而异，含树脂、单宁多的树种，其木屑堆积的时间越长越好；而山毛榉之类的无臭味木屑堆积太久会腐烂，效果反而不好；柳杉等的木屑堆积3个月，松树、落叶松、板栗树等的木屑以堆积一年较好。
木屑中含氮量低，只有0．4％～0．5％。因此，以木屑为主料配制培养料时需要添加含氮量较高的麸皮、米糠、玉米粉或大豆粉之类的辅料，添加量以不少于25％左右为宜。木屑中含糖量亦低，为了满足金针菇菌丝生长阶段所需要的糖分，应在木屑培养料中添加1％的糖。
（2）棉籽壳（棉籽皮）。这是栽培金针菇理想的培养料，有人称其为万能培养基。棉籽壳营养丰富，质地蓬松，保湿、通气性能好。据分析，棉籽壳含多缩戊糖22％～25％，粗纤维68．6％，木质素29％～32％，粗蛋白质6．85％，粗脂肪3．1％，粗灰分2．46％，磷0．13％，碳66％，氮2．03％。但要选用无霉变、无结块，未被雨水淋湿的新鲜棉籽壳，使用之前最好在太阳下摊开曝晒1～2天，制种前一天下午先将棉籽壳预湿，让其吸足水分。
（3）甘蔗渣。甘蔗渣是甘蔗制糖后剩余的废料，它含有粗纤维48％，粗蛋白质1．4％，粗灰分2．04％，可代替木屑用于栽培金针菇。必须选用新鲜色白、无发酵酸味、无霉变的甘蔗渣，一般应取用糖厂刚榨过糖的甘蔗渣及时晒干放干燥处备用。没有充分晒干、久积堆放的甘蔗渣，会结块、发黑变质，不宜使用。使用前将甘蔗渣用粉碎机粉碎成麸皮状后再进行配料。
（4）玉米芯。玉米芯资源丰富，是非棉区栽培金针菇较好的原料。据分析，玉米芯含粗纤维28．2％，粗蛋白质2％，粗脂肪0．7％，粗灰分20％，钙0．01％，磷0．08％。应选用当年新鲜、干燥、无霉变的玉米芯，因玉米芯中含可溶性糖分也较多，极易引起发霉变质，故应存放在通风干燥处，防止雨淋受潮。在使用之前应在太阳下曝晒2～3天，然后粉碎成麦粒大小的颗粒，经过堆积发酵处理后再配料。玉米芯中氮的含量较低，在配料时应增加麸皮或米糠的用量，以弥补氮量不足，才能取得较好的产量。
（5）稻草。近年来，在南方水稻区菇农采用稻草栽培金针菇获得较好的产量。稻草含有粗纤维，含碳45．39％，氮0．63％。栽培金针菇，应选用新鲜、干燥、清洁、无霉烂的稻草，多年陈旧的稻草不宜使用。稻草质地坚硬，含有大量蜡质，在使用之前除需曝晒2～3天外，还要切短（2～3厘米长），用清水或0．5％石灰水浸泡半天，或用粉碎机粉碎成麸皮状粉末，再配入含氮素多的麸皮、米糠、玉米粉等一起使用。
（6）甜菜废丝。是甜菜肉质直根切丝后浸去水溶性糖分的残余物。北方甜菜产区原料丰富，可用作栽培金针菇的培养料。甜菜废丝含粗纤维56．5％，粗蛋白质9．2％，粗脂肪0．08％，粗灰分10．42％，磷0．12％。选用制过糖的鲜甜菜丝，也可将其晾晒干后再使用。含水分太高的甜菜丝，应先晾晒一下，使其含水量适度时再使用。甜菜废丝的木质素、纤维素含量较少，如果含水量多会影响培养料的透气性。使用甜菜丝作为培养料，应搭配20％左右的木屑或棉籽壳，并添加20％左右的麸皮或米糠，以改善培养料的透气状况和降低培养料的含水量。
（7）醋糟。是酱油厂制醋剩余的下脚料，营养丰富，可为金针菇分解利用。应选用新鲜的醋糟，否则易孳生杂菌。醋糟酸度大，使用时必须调节pH值使其在5～6．5间。据资料介绍，每100千克醋糟中需加入石灰2～3千克进行中和。
（8）芦苇叶。我国芦苇叶资源十分丰富，可作为栽培金针菇的原料。据分析，芦苇叶中含粗纤维30．1％，木质素24．4％，粗蛋白质8．64％，粗脂肪2．1％，碳水化合物41．2％，与棉籽壳的营养成分近似。使用之前将芦苇叶粉碎成稻糠样粉末或切碎（1～2厘米长），使用时用热水拌料后堆闷半天，让其充分吸水后与其他辅料拌匀。
（9）麦秸。麦秸资源丰富，含碳47．08％，含氮0．63％，可用来作为栽培金针菇的原料，但质地坚硬，表面有一层蜡质影响吸水性能。使用时必须切成小段，用1％石灰水浸泡一昼夜，使其软化后再用水冲洗、沥干；也可粉碎成粗糠样粉末使用。
（10）其他秸秆大豆壳、高粱壳、油菜籽壳、葵花籽皮以及花生壳等均可作为金针菇的培养料。据测定，大豆壳和葵花籽皮粗纤维含量分别为45．1％和49．8％，粗蛋白质为3．0％和5．29％，粗脂肪为0．9％和2．96％，粗灰分为4．29％和1．25％，磷为0．06％和0．08％。大豆壳还含有钙。但选用的原料必须是无霉变、无腐烂的，同时要粉碎后才能使用。