金福菇的遗传和变异是菌种选育的基础。变异是适应不同的 环境需要，变异通过遗传而获得相对稳定。菌种选育因而有 两方面内容：一是利用自然或人工方法，促使菌种产生变异 ；二是要通过选育，把有益的变异遗传下来，培育出高产速 生的优质菌种。
自然选育是结合生产进行的一种育种方法，金福菇容易发生 变异，在栽培生产过程中会在群体中发现变异的子实体，这 个子实体如果在适合的培养环境中，就会逐渐地显示出它的 生长优势，这种没有经过任何人工处理，然后分离出来的选 育方法就是自然选育。金福菇的自然选育通常采用生长良好 的子实体进行组织分离，这样通常能把优良性状传给后代。