孕期滥用药物、接触化学物质或用药不当，将会导致胎儿的器官形态构造异常。尤其是在受孕后第3周到第14周是胚胎发育期，此时期最易致残致畸，孕妇应特别注意。在被调查的33万畸形新生儿中，发现因服药不当所致者为1万余例，为此专家呼吁每位待产妈妈对孕期用药必须予以重视，并列举了容易导致胎儿畸形的药物：
中药方面
妊娠期应用中药禁忌，从药物的性能来说，主要是忌活血破气、滑利攻下、芳香渗透、大热有毒之品。
（1）活血破气类：桃仁、红花、三棱、莪术、泽兰、苏木、刘寄奴、益母草、牛漆、水蛭、虻虫、乳香、没药等等。因血活可使血液循环加速，迫血随气行，气乱则无力固胎。
（2）滑利攻下类：滑石、冬葵子、甘遂、大戟、芫花、薏苡根、巴豆、牵牛子、木通等。此类药物多具通利小便、泻下通府的作用。有伤阴耗气之弊。阴伤则胎失所养，气耗则胎失固摄，胎儿易下坠。
（3）大辛大热类：附子、肉桂、川乌、草乌等，这些药物辛热而燥，辛热走窜迫血妄行，燥能伤津，对胎儿不利，且多有不同程度的毒性，有堕胎之弊。
（4）芳香渗透类：如麝香、草果、丁香、降香等，多辛温香躁，有疏通气机的作用。气行则血行，以致迫胎外出。
（5）有毒之品：如水银、朱砂之类，有直接伤胎、腐胎的作用，当严禁使用。
西药方面
（1）激素类药物：尤其是性激素易引起胎儿器官畸形。乙烯雌酚可使女婴男性化、男婴女性化；孕酮、睾丸酮类激素可使女婴男性化。肾上腺皮质激素也可引起胎儿各种畸形。
（2）各种镇吐药：怀孕早期由于反应性呕吐，如服用镇吐药也有致畸的危险。这类药包括异丙嗪、氯丙嗪、三氟拉嗪、氯苯甲嗪等，可致胎儿心脏发育受阻而患先天性心脏病。
（3）解热镇痛药：这类药可致胎儿软骨发育不全、脑积水、畸形足和先天性心脏病、智商和注意力较同龄人低，同时令胎儿的神经系统和肾脏也受到影响。这类药包括阿司匹林、安乃近、非那西丁，以及含有此类成分的复方制剂。
（4）抗生素类药：如四环素可致胎儿畸形、牙齿变黄，还能引起先天性白内障、长骨发育不全。链霉素和卡那霉素可致先天性耳聋、肾脏受损。氯霉素可致胎儿骨骼机能抑制，致使新生儿肺出血。
（5）抗肿瘤药：如氯甲喋呤、白消安、6-巯基嘌呤和环磷酰胺可致胎儿颅骨骨化不全、腭裂、脑积水、指趾畸形。另有报道，儿童应慎服氟哌酸，理由是此药会影响儿童骨骼生长。那么孕妇也应该慎用此种药。一般来说受孕后第3周到第14周是胚胎发育期，此时期最易致残致畸，孕妇应特别注意。