伊塔佩库鲁河发源于巴西马拉尼昂州内格拉山（海拔640米）以东约50千米处，河流先向东流，在科利纳斯附近折向东北至卡希亚斯，然后向北流，在罗萨里奥附近注入大西洋圣马科斯湾，流域位于南纬3°02′—6°50′，西经43°07′—45°53′之间。该河全长1200千米，流域面积4．5万平方千米。伊塔佩库鲁河的主要支流有阿尔佩卡塔斯河、巴尔塞罗斯河和塔普伊奥河等。伊塔佩库鲁河流域地势南高北低，源头河流及上游干、支流的海拔在200米—500米之间，中、下游的干、支流海拔多在200米以下。
