特殊工时制是对一些生产和工作有淡、旺季之分，任务轻重随机性很大的用人单位，无法实行标准工时制和计件工时制，也无法保证劳动者每周至少休息一天，而实行的其他工时制度的统称。特殊工时制主要有不定时工时制和综合计算工时制。
《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》规定，企业因生产特点不能实行《劳动法》第三十六条、第三十八条规定的，可以实行不定时工作制或综合计算工时工作制等其他工作和休息办法。
《国务院关于修改〈国务院关于职工工作时间的规定〉的决定》规定，在特殊条件下从事劳动和有特殊情况，需要适当缩短工作时间的，按照国家有关规定执行。因工作性质或者生产特点的限制，不能实行每日工作8小时、每周工作40小时标准工时制度的，按照国家有关规定，可以实行其他工作和休息办法。
《〈国务院关于职工工作时间的规定〉问题解答》对此作出进一步解释，对于因工作性质或生产特点的限制，实行不定时工作制或综合计算工时工作制等其他工作和休息办法的职工和企业都应根据《中华人民共和国劳动法》和《国务院关于职工工作时间的规定》的有关条款，在保障职工身体健康并充分听取职工意见的基础上，采取集中工作、集中休息、轮休调休、弹性工作时间等适当的工作和休息方式，确保职工的休息休假权利和生产、工作任务的完成。同时，各企业主管部门也应积极创造条件，尽可能使企业的生产任务均衡合理，帮助企业解决贯彻《国务院关于职工工作时间的规定》中的实际问题。
此外，根据《劳动法》《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》的规定，用人单位若实行特殊工时制，须按规定程序，报经劳动保障行政部门批准。中央直属企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制等其他工作和休息办法的，经国务院行业主管部门审核，报国务院劳动行政部门批准。地方企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制等其他工作和休息办法的审批办法，由各省、自治区、直辖市人民政府劳动行政部门制定，报国务院劳动行政部门备案。
对于实行不定时工作制和综合计算工时工作制等其他工作和休息办法的职工，企业应根据《中华人民共和国劳动法》第一章、第四章有关规定，在保障职工身体健康并充分听取职工意见的基础上，采用集中工作、集中休息、轮休调休、弹性工作时间等适当方式，确保职工的休息休假权利和生产、工作任务的完成。