江阴调查搞完以后，史玉柱就开始做了无锡市场，那才是正儿八经的市场了。他先打广告，然后谈经销商。经销商一开始不是很愿意付钱，然后他就一边谈判，那边广告就开始打，有个别大的百货商场终端，史玉柱就直接点货给他们，并且告诉他们，如果卖了结账不要跟他结，跟经销商去结。江阴调查使史玉柱信心倍增，出于感激当地的百姓，第一个月，他把脑白金免费赠送给他们，赢得很好的口碑。接下来，史玉柱要做的就是，依靠良好的口碑及广告宣传，迅速滚动扩张市场。
1998年5月，史玉柱开始打无锡市场。无锡第二个月赚钱了，赚了十几万，又去启动下一个城市。无锡隔了一个月，启动了南京、常熟、常州还有东北的一个吉林。史玉柱就是这样，步步为营，并且依靠强大的广告宣传力度，一时间使脑白金红遍大江南北。全国的市场逐步地拓展开来。由于其出奇的广告效应，脑白金以星火燎原之势迅速占领全国市场，脑白金面市的第三年即2000年便实现销售收入8.01亿元，上缴税收1.01亿元，位居全国同行前列。2001年，销售收入更是突破10亿元，稳居保健品市场榜首。
2001年，在全国人民对诚信的一片期待声中，史玉柱回来了。史玉柱的复出明显带有浓重的商德商誉色彩，或者称为江湖道义色彩。但是还是有人开始怀疑史玉柱的还钱、复出，其实是一个精心“策划”，是个很不错的商业计划的一部分：以还钱作为切入点，挟道义闪亮登场。
脑白金的迅速红遍大江南北，使史玉柱很快有了归还巨人大厦欠款的经济实力。2001年1月，史玉柱以个人名义开始偿还原巨人大厦在香港及内地的楼花欠款，用两亿多的钱挽救了自己的名声。这些钱是从哪里来的？显然是来自脑白金的利润。史玉柱说：“脑白金1999年已经有相当规模，但是那个时候我们还相当低调，实际上我们着手还钱的时候，手边已经有那么多钱了，当时把这笔钱从公司里抽走，公司照常能运转。”
2001年12月14日，史玉柱在接受中央电视台记者采访时再次强调，2001年对他来说最大的事情就是“还债”。并声称：去年底以前，他欠的所有债务就可以还清。那么，史玉柱最终欠了多少债，又还了多少债？巨人集团的债务主要由三部分组成：在香港所卖的楼花、在国内卖的楼花，以及国内法人间的债务。涉及金额分别是9000多万港币、5000多万人民币、1亿人民币左右。
香港那部分业主的钱，史玉柱已经在1月中旬通过香港律师楼还了80%，其他一些没有还的钱主要是现在找不到人了，史玉柱表示自己正全力向他们联系，什么时候找到，什么时候还钱。一定要把钱还了。
至于法人债务一块，史玉柱现在已经完成了80%，其他的一些法人，主要是当时一些代加工伙伴，史玉柱正在全力地去找他们，具体操作方案，多方都在考虑。
社会最为关注的还是国内业主的还款问题。史玉柱说：“偿还国内债务的最后一步，在这个月底就能完成。这次，我们准备了4000万现金，只要人来我们都还。这样，我就完成了我人生两步走的第一步，之后的路才是重新开始。”
对于史玉柱大张旗鼓地还账，原因其实是可以理解，正如史玉柱在接受一家媒体记者采访时也说，“眼前我好像吃亏了，1亿多元现金我付出了，但是这个回报我觉得不止1亿元。”
无债一身轻。2001年2月3日晚上，史玉柱因还债事件而接受采访，他终于堂堂正正地递出了自己的名片，从1997年“巨人倒下”后，他一直没用过名片；他也终于可以摘下自己的墨镜，昂首挺胸在大街上行走了，再也不用担心别人认出他是史玉柱。
脑白金的一炮走红并没有让史玉柱满足，他立刻开始琢磨手中的另外几个产品，降血脂的、抗感冒的、补血的、治疗胃病的，还有维生素。最终，史玉柱决心力推维生素和矿物质的混合物类产品——“黄金搭档”。
2001年，黄金搭档上市，史玉柱为它准备的广告词几乎和脑白金的一样俗气——“黄金搭档送长辈，腰好腿好精神好；黄金金搭档送女士，细腻红润有光泽；黄金搭档送孩子，个子长高学习好。”在史玉柱纯熟的广告策略和成熟的通路推动下，黄金搭档很快走红全国市场。
原来人们骂脑白金的广告恶俗，连年把它评为“十差广告之首”，现在“十差广告”的前二名也是史玉柱的了，因为黄金搭档上来了。史玉柱自我解嘲：“十差广告前两名都是我们的。但是你注意，那个十佳广告是一年一换茬，十差广告是年年都不换。”这两个产品，成了保健品市场上的常青树，畅销多年仍不能遏止其销售额的增长。2007年上半年，脑白金的销售额比2006年同期又增长了160%！
2.巧运作史玉柱借壳上市
“企业大了，第一位的便不是利润，而是企业安全，上市通过法律等各种手段形成制约，相对来说做出错误决策的可能性减小，董事会、股东大会等在组织安排上又多加了几道保护”。
——史玉柱
自从脑白金上市之后，它基本上保持了销售上升的势头，即使在销售额突破10亿元之后，其销售还在缓缓上升。史玉柱不仅创造了脑白金销售的市场神话，而且，他对这神话的延续充满信心。
人们很难设想，在保健品市场如此牛气的史玉柱，在资本市场却完全另外一副模样，低声下气，为一贫如洗的青岛国货打工。
2001年7月27日，ST国货于日前公布了重组方案，其重组已取得了实质性的进展。与此同时，一直伴随着国货重组过程和其股价上涨过程的一个传言也被证实了，就是史玉柱的确将与国货“亲密接触”。2001年年初时频频在媒体露面的史玉柱曾表达过要借壳上市、要东山再起的决心，那么，ST国货也许就是他要借的壳、是他要打造的第二个巨人。
ST国货所处的行业是零售百货业，于1989年在全国同行业中第一批晋升为“国家二级企业”，是青岛的“老字号”。
在ST国货的重组方案中，第一大股东青岛市商业总公司于2000年9月29日与上海华馨投资有限公司签署的《股份转让协议》中，拟转让的2811万股国有法人股，将委托给上海华馨投资有限公司管理，后者拥有该部分股权的除处置权以外的其他全部权利。同时，ST国货将向上海华馨投资有限公司出售部分资产，并购买上海华馨投资有限公司所拥有的无锡健特药业有限公司90%的股权。通过重组，ST国货将整体剥离商业资产和业务，彻底改变公司的主管方向。
史玉柱与国货是这样亲密接触上的：上海华馨投资有限公司占无锡健特药业有限公司90%的股份，另外10%的股份归上海健特生物科技有限公司所有。众所周知，以生产脑白金而闻名的上海健特生物科技有限公司，是史玉柱在“巨人大厦事件”后带着一班旧部来到上海后注册成立的，史玉柱虽然不是上海健特的法人代表，只是作为公司的“策划总监”，但员工都称他为老板，而且许多健特的高层都是史玉柱的老部下。尽管如此，无论是上海华馨、青岛国货还是上海健特仍然不直面回答此次重组与史玉柱的渊源，但是，了解此过程的人士都已深知其中的玄妙。
虽然史玉柱是借上海健特与上海华馨的密切关系再次成功的，但可以肯定的一点是，史玉柱在上海健特既非法人又非股东，与上海健特都没有任何产权关系，更不用说与上海华馨了。国货的声明说的一点都没错。而史玉柱则否认得更艺术，“年底要上市，但目前尚未确定买哪家企业作壳”，他的回答留给大家一个悬念：也许不是国货，当然也有是的可能。
在2001年2月6日的《解放日报》上，经过了一个生死轮回的史玉柱做了个大广告，用两个20多厘米长的大字写着：“感谢”。他还深情地附之于一首小诗作解释：“十年前，巨人创造过辉煌；四年前，巨人跌入低谷；新世纪，巨人从上海复出；感谢上海优良的投资环境、良好的政策环境；感谢上海人民的厚爱。史玉柱真的重新站起来了。”
史玉柱说的这个“要感谢”，谢的是上海和上海人民；还有一个该说“要感谢”的则是国货，谢的是“巨人”史玉柱。
2001年2月初，史玉柱一方面忙着在珠海还债，一方面被卷入这样一个传闻里：史玉柱与ST国货的重组有着紧密的联系、巨人集团要借壳上市、史玉柱要用脑白金给ST国货洗脑，于是，ST国货的股价开始发疯般地上涨。在盯国货的K线图上，从2月底开始，其股价的上涨趋势呈一条45度角上升的斜线，股价则从12元左右上涨，最高时达到25元，翻了一倍还要多。一切行为都那么有条不紊，环环相扣，尽在计划中。
在投资领域，史玉柱确定了两个基本原则：一是不要耗费太多的精力，在主营业务上做到有主有次集中精力，才能做好一件事情，一旦分散精力，很可能会导致许多不必要的问题的出现，到最后可能一事无成。这也是当初史玉柱血的教训之一。二是所投资的行业必须有良好的监管机制，这样就会减少投资者相应的监督成本和精力。
那么在投资领域史玉柱的“主攻”是什么呢？史玉柱确定的目标主要集中在参股银行、保险、证券公司等等。“我们的目标是那些股权比较分散，行业成长性比较好的公司，这些行业的风险性也小很多”。更重要的是，“虽然我们在这个领域不太熟悉，但这个类型的公司都有专人打理，投资人盯着它，人民银行管着它，国家还在监管，只要选目标的时候认真点，问题不是很大。”“现在巨人投资跟很多家公司和金融机构都在谈，有什么消息到时会公布的。”看得出，在这类问题上，史玉柱还是保持了一贯的谨慎。
3.资本新游戏卖掉脑白金
“在四通控股中，生命科技将成为当然的主业，对IT业务的新投资将极为慎重。对现在不赚钱或是微利的公司，都将砍掉，只保留年赢利在1000万元以上的公司。”
——史玉柱
尽管脑白金和黄金搭档都卖得很火，但在“其兴也勃，其亡也忽”的保健品行当，把所有鸡蛋都放在同一个篮子里非常危险。于是，史玉柱开始了他人生下半场的第二件事——资本布局。2003年，史玉柱将脑白金和黄金搭档的知识产权及其营销网络75%的股权卖给了段永基旗下的香港上市公司四通电子。交易总价为12.4亿人民币，其中现金6.36亿人民币，其余为四通电子的可转股债券。
当然，四通电子也有附加的条件：史玉柱必须要保证黄金搭档生物科技的经营业绩，具体来说，就是除税和少数股东权益后的利润，第一年不少于人民币9000万元人民币，第二年不少于1亿7000万元人民币，第三年也不少于1亿7000万元人民币。如果达不到这个业绩，就要按照一定比例对四通电子进行赔偿。此外，史玉柱在五年内不能做与脑白金、黄金搭档的竞争性产品。
这起涉及金额近12亿港元的收购，引起了国内所有主流财经媒体的关注。以深入挖掘公司内幕著称，在财经界有很大影响力的杂志，在以往史玉柱复出引得全国媒体关注之时始终没有对史玉柱进行报道，这一次也拟派记者到安徽怀远史玉柱的老家，探寻史玉柱系公司的奥秘。不过，《财经》杂志最后报道的重心，还是放在了段永基身上。
段永基的确是这一次收购的关键所在。其实，段永基和史玉柱的交情已经持续了多年。最早，是在泰山产业研究院。
“泰山产业研究院”成立于1994年，原名叫作“泰山产业研究会”，1998年才改为现在的名字。这是一个企业家沙龙，它聚集了一批中国民营企业家中的领袖人物，其中包括柳传志、段永基、冯仑等人。“泰山产业研究院”每年召开一次例会，企业家们坐在一起共同探讨民营企业发展中遇到的问题、交流信息、分析企业管理中的问题，并创造合作的机会。
史玉柱是“泰山产业研究院”的发起人之一，当年巨人集团曾承办了第二届年会，即使在史玉柱最困难的时候，他也每年都坚持参加泰山的例会。史玉柱自己认为，他在这里获得的精神支持和经验总结，是他能够复出的重要条件。1996年“泰山产业研究院”举行的活动，主题是谈史玉柱的企业经营。当时史玉柱的巨人公司走下坡路，但外界还不知道，史玉柱主动提出后，大家讨论。但会上没有探讨怎么施以援手的问题，因为这个组织不鼓励。
就企业经营思路而言，“泰山产业研究院”中对史玉柱影响最大的就是柳传志和段永基。柳传志是“泰山产业研究院”的院长，史玉柱的巨人集团陷入困境之后，他曾给史玉柱讲过不少经营企业的道理，比如什么样的企业文化是健康的、实用的。史玉柱复出之后，抛弃了以前巨人集团动辄就提出空洞口号的企业文化，转而在企业文化中强调实用性，就是受了柳传志的影响。
段永基是“泰山产业研究院”的董事长、法定代表人，在史玉柱最困难的时候，他也曾多次给史玉柱打电话，调节他的心情。段永基曾对史玉柱说：“成功经验的总结多数是扭曲的，失败教训的总结才是正确的。”这句话给史玉柱留下了很深的印象。史玉柱复出后，段永基还召集“泰山产业研究院”专门为史玉柱举行了一次名为“战胜挫折，走向成功”的座谈会，并亲任主持。
史玉柱自己曾表示，“我跟柳传志、段永基都聊过。柳传志给了我很多管理上的经验。段永基给我很多宏观理念上的启发。”
当然，在史玉柱复出之后，段永基和他的关系绝不仅仅是提供宏观理念上的启发，从史玉柱踏入资本市场的第一天起，段永基就与史玉柱站在了一起。2001年，上海华馨投资有限公司收购青岛国货得以完成，“青岛国货”更名“青岛健特生物”之后，在新的股东会中，段永基出任独立董事。不仅如此，从2002年开始，由段永基任董事长的中关村证券股份有限公司就一直停留在青岛健特生物的前十大股东名单之中。
可以想见，在史玉柱透过上海华馨投资有限公司，收购青岛国货，从而进入资本市场的过程中，段永基从一开始就参与其中，并为史玉柱提供了咨询和建议。
对于史玉柱这个“资本新丁”来说，能够同“资本老枪”段永基合作，自然是一件幸事。从未踏入过资本市场，在巨人集团时代曾被部下称为“不会用钱”的史玉柱能够在一系列并购中得心应手，熟练地从国内资本市场迈向国际资本市场，只能解释为段永基在这个过程中给予了他相当大的指导和帮助。
不过，做从青岛健特生物独立董事、股东是一回事，拿出十多亿的真金白银收购脑白金和黄金搭档又是另外一回事。