苹果轮纹病主要危害枝干（俗称粗皮病）和果实（俗称轮纹烂果病）。随着高度感病的富士系苹果广泛栽植，该病危害日趋严重，烂果率可高达70％。烟台市农业科学院研究表明，50％多霉清可湿性粉剂防治苹果轮纹病优于其他常用药剂，多霉清是由多菌灵和乙霉威复配而成，乙霉威与多菌灵存在负交互抗性。
50％多霉清1 500倍液对苹果轮纹病菌菌丝生长抑制率达100％，高于70％甲基托布律可湿性粉剂800倍液。病菌从苹果花后10天到果实成熟可不断侵染果实，但幼果期由于果内含糖量低、酚类物质含量较高，病菌处于潜伏状态，果实近成熟期开始出现病果。因此防治苹果轮纹病在谢花后1周就要及时喷药。经济、有效的适宜浓度是1 200倍液。
根据雨日分布情况多次喷药，其防治效果优于相同喷药次数的70％甲基托布津可湿性粉剂800倍液，保果效果极为明显。在褐斑病发生较重果园，应与波尔多液交替使用，达到防低成本，兼治褐斑病的目的。