双孢菇属于好气性菌类，不含叶绿素，不能进行光合作用，在生长过程中需要不断吸入氧气，呼出二氧化碳。最适于双孢菇菌丝生长的二氧化碳浓度为0.1％～0.5％。子实体分化和生长阶段的二氧化碳浓度以0.03％～0.1％为宜，如果二氧化碳浓度超过0.1％，易形成盖小、柄长的畸形菇，甚至菇蕾死亡。因此，播种前应采取方法先将堆料的二氧化碳、氨气、硫化氢等有害气体排除。在发菌期保持空气新鲜很重要，应经常通风换气，及时排除有害气体，供给充足的氧气。通风还有利于蒸发，使过湿的环境得到改善。
