细读药师佛的十二大愿，在感受药师佛慈悲之心的同时，还能得到诸多养生启示。如，第四大愿、第五大愿、第六大愿、第七大愿、第九大愿都在指向个人修养方面。在佛教看来，尚未开悟的众生都会有各种烦恼困扰骚乱身心，特别是贪、嗔、痴等，相互混合而产生繁杂的四万八千种不同烦恼。而心理方面如此多的烦恼，就会导致生理方面有四百零四种的传统疾病和失调，使身体受到病苦之乱。药师佛的愿力就是为救济一切众生的病苦。
神秘而伟大的药王城
据藏医传说：药王门杰拉是释迦牟尼的化身，他曾在药王塔嘎尔普等天庭侍医、君希普等众位医仙、梵天等外道诸神和观音等诸菩萨，传讲医学。所传讲的内容流传到世间即成为《四部医典》。
药王城坐落在非常遥远的地方，是一座由宝石、金银、白珍珠、红珍珠、蓝琉璃构成的正方形无量宫。正座无量宫的宫墙有五层，并设有有四个门，东门由持国天王守护，南门由增长天王守护，西门由广目天王守护，北门由多闻天王守护。无量宫内装饰着各种药物宝石，望楼、房檐上悬挂着五种用天上宝石制成的璎珞，五种用菩提宝石制成的金顶、佛幢和屋脊，光彩夺目，清澈透明。
药王城的南面是阳光普照的锥顶山，那里长满主治寒性病的各种热性药物；药王城的北面是雪峰山，那里生长和存在着主治热性病的各种寒性药物；药王城的东面是香茅山，那里生长着七种诃子；药王城的西面是马拉亚山，那里生长着六种良药（肉豆蔻，小肉蔻，草果，滑石粉，草红花和丁香）及寒水石、五灵脂，还有温泉和五种药水（治疗隆病，赤巴病，培根病，双型混合病及三型混合病的药水）。
药林上空，群鸟欢歌；药林四周，躯体内存佳药的象、熊、麝等群兽伏卧。无量宫正中陈放着镶嵌各种宝石的宝座，宝座由神狮、神象、天马、鲲鹏、孔雀驮伏，座上端坐着正在传讲医学的药王门杰拉——药师琉璃光佛。当药王门杰拉传医学时，又化身为古、松、土、元丹、赤列五位热白益西，并通过这五位化身神仙的相互问答揭示医学奥秘。
《四部医典》：藏医学中的不朽经典
《四部医典》是藏族著名医家宇妥.元丹贡布于8世纪下半叶撰写完成的一部藏族医药学经典著作，也是世界医药学名著。由于本书内容丰富，具有较普遍的实践意义，因而受到藏族人民的普遍欢迎。
《四部医典》的正文是以两位仙人对答的形式，用9字韵体藏文叙述的。全书共计156章，四部分组成，即《根本医典》6部，总论人体生理、病理、诊断及治疗；《论说医典》31章，介绍人体生理解剖、病症分类和治疗原则；《秘诀医典》92章，阐述临床各科疾病之诊断和治疗；《后续医典》27章，主要论述脉诊和尿诊、各种方剂药物的配伍、药物的炮制、功能、给药途径及外治法，如放血、艾灸、火灸、外敷、拨罐等。
《四部医典》总共收载方剂430方，单药1002种，根据药物来源、质地、生境、入药部位的不同，分为贵重药类、宝石类、土类、木类、精华类、平地产类（指作物类）、草类、动物药等八大类。并对药物的性味、炮制作了记载。作者认为药物的生长与五行（土、水、火、风、空）有密切关系；并将药物分为热性与寒性两类，热症用寒性药治之，寒症用热性药治之，这与中医用药理论类同。
全书从生理到病理，都贯串着隆、赤巴、培根三大因素，五脏六腑，寒热气血等理论，具有藏族的民族特色，其中有一些疾病是高原所特有的，有些病名至今未能找到中医或西医学中相匹的病名，藏医中关于胚胎学的认识，认为是由父精母血的结合，逐渐发展起来，并且由简单到复杂，最后形成胎儿。藏医在胚胎学方面的认识在世界生物学史上是很先进的。
另外，《四部医典》中还有80幅彩色曼唐，绘制这些曼唐的目的，就是为了让此书更通俗易懂，对初习的学童和渊博的学者都便于理解。曼唐就是医药学挂图。
《四部医典》在成书过程中，作者在总结本民族医学经验并吸收和借鉴了汉族医学、古印度和大食医学的部分理论和医药成果。成书后，历经各代藏医学家的修定、补充、注释、整理而愈趋详细完善。直至公元12世纪，经老宇陀的十三世后代宇陀·萨玛元丹贡布全面的修订，成为后世的通行本。
《四部医典》是一部对藏医发展具有深远影响的奠基之作，是藏医药学的必读课本和医药经典，也是研究藏医药学的理论基础。历代医家都把它作为行医指南，是藏医的必修教科书，其学术地位相当于汉族之《黄帝内经》。
藏医的基础学说
五源学说
五源学说又称为五元学说，它认为物器界（器世）及人和一切生物（情世）产生的根源为土、水、火、风、空，称之为五源。这种学说起源于印度，是古印度的一种朴素唯物主义认识论。土、水、火、风是构成世界万事万物的四种基本物质，空是物质存在、增长和运动的空间，.它们之间相互资生、演变、发展，并进行抽象推演、演绎、归类，用以解释物质世界的结构和运动形式，这便是五源学说。
五源学说很早应用于佛教哲学，以后应用于寿命吠陀医学，藏医药学在形成过程中将它移植到藏医药理论中，广泛应用于生理功能、病理变化、疾病诊断、防病治病及药物方剂等很多方面，正如《四部医典》后续部说：“众生身由四源成，疾病缘由四源起，药物性味四源定，身病药皆四源生。”
五行学说
五行指的是木、火、土、金、水，五行学说就是以它们的属性和相互资生、制约的复杂关系来归类、演绎、解释物质世界的构成和事物变化。藏医运用五行学说来解释人体、生理、病理及其与外在环境的相互关系，进行辩证论治。藏医将五行学说主要应用于脉诊学，其他方面藏医多用五源学说。藏医早在公元8世纪末，从中医编译而成的《月王药诊》中移植过来，在藏医经典著作《四部医典》中有详细的阐述并有所发展。
藏医将五行（金、木、水、火、土）与人体的心、肝、脾、肺、肾之脉象联结起来，称之为五行脉。即金主肺脉，木主肝脉，水主肾脉，火主心脉，土主脾脉。按五行相生（金生水、水生木、木生火、火生土、土生金）的原则，若在心脉上（火主心脉）出现了脾脉（土主脾脉）跳动，即为正常脉（火生土）。与此相反出现了五行相克的脉（金克木，木克土，土克水，水克火，火克金）则为病脉，如在心脉出现了肺脉（金主肺脉）跳动，则为病脉（火克金）。
藏医也认为不同的时令季节，人体的脉象也有所变化，这些都跟五行有着密切关系。即将一年分为四季，每季属七十二天，在两季交替之间有十八天，这样将一年分为五个七十二天，然后冠之以五行联系。即春季七十二天属木，为万物生长季节，肝胆属木，亦属旺盛季节，故木主肝（胆）脉；夏季七十二天属火，是心活动的旺盛季节，心属火，故火主心脉；同样道理，秋季七十二天属金，金主肺脉；冬季七十二天属水，水主肾脉；春末夏初、夏末秋初、秋末冬初、冬末春初各有十八天，四个交替时节共七十二天属土，土主脾脉。
藏医药的理论体系
藏医药学的理论有：五行、六味、八性、十七效。
藏医学认为药物与五行有关，药物的生长源于五行，即土、水、火、气、空。即土为药物生长之本源；水为药物生长之汁液；火为药物生长之热源；气为药物生长运行之动力；空为药物生长之空间。五行缺一，特别是空缺少，药物则无生机。这一精辟论述，阐明了药物生长与自然环境的辩证统一关系，这就是当今所说的生态环境对植物生长的特殊性。
另外，藏医认为药物的味、性效亦源于五行，土性强的药物具有强筋骨，增生体力，滋补强身之效，可治龙病。这种药物味甘，具有重、稳、钝、柔、润、干之性，根及根茎类药材大都属于土性。
水性偏强的药物具有使七大物质基础（即饮食精微、血、肉、脂肪、骨、骨髓、精）聚集，具有增生肌肉之效，可治赤巴病，这种药物味涩、酸，具有寒、凉、润、稀、钝、软、柔之性，。皮类和时类药材大都属于水性。
火性偏强的药物具有促进七大物质基础成熟，助消化，促吸收，增生体热，荣润肤色，可治培根病，这种药物味辛、涩。大部分花类、种子类药材都属火性。
气性偏强的药物具有强筋骨，通经活络，增生体温，收敛疮疡，促进七大物质基础运行，这种药物味苦、涩、咸。皮类药材大都属于气性。
空性强的药材，具有四性的通性，其功效通行全身无阻，舒胸宽腹，遍及肢体，适用于一切疾病。果类和种子类药材大都属于空性。
除将根、茎、叶、花、果实、种子、皮类药材分属五大外，还将其药材的颜色和五行联系。即黄色或淡黄色者为土，白色者为水，红色者为火，绿色者为气，蓝色者为空：于是可根据药材的颜色来考虑其属性，决定其味、性、效。
六味，即甘、苦、酸、辛、咸、涩。甘味具有增强体力，补气固本，荣润肤色，开窍舒胸，生肌愈疮，干黄水之功效。苦味具有清血热、赤巴热，健胃舒胸，增生腹肌之功效。酸味具有健胃消渴，增生体温，生培根之效，对赤巴有益。辛味具有增生胃温，健胃消积，镇静催眠，驱杀肠胃寄生虫，荣润肤色之效。咸味具有熄风镇静，消肿化积，消烦渴，增生体力，生血，生赤巴，干黄水，下死胎之效；但对麻风病、痘疹、疮疖有害。涩味具有通淋止泻，复苏开窍，荣润皮肤，驱虫之效。
另外，还有三化味，即服药后在体内经吸收，其原来药物之味发生变化。如甘、咸味转化为甘味，辛、涩、苦转化为苦味；酸味吸收后仍为酸味。因此，甘、酸、苦称之为三化味．
八性，系指藏药具有八种性能，即寒、热、轻、重、钝、锐、润、糙。药性重、润、寒、钝者可治龙病、赤巴病；药性轻、糙、热、锐者可治培根病。
十七效，就是藏药有十七种功效，即寒、热、温、凉、干、稀、润、糙、轻、重、稳、动、钝、锐、柔、燥、软。十七效是藏医遣药组方的理论基础，每种药都有其固有的性、味、效，而在临床上具体应用时，则应根据其功效配伍组方，组方原则是以十七效为对治，即寒与热为一对治，寒性病用热药治之，热性病用寒性药治之，在一对治中，一为药性，一为病性，互为对治。同理，温与凉、钝与锐、稳与动、润与糙等均互为对治，这是藏医辨证施治用药的理论基础。