眼看南风已起，义净不由得着急起来。这天，义净藉机问起了搭船返唐的事情。国王与释迦大德对视一眼，慢慢说道：“实不相瞒，小王与释迦大师已商量过，佛经上说：‘履行仁慈之德，博爱平等为怀。’我室利佛逝虽然比不上大唐，可也是一个礼仪之帮，所以小王想请大师常住此地。大师回大唐是弘传佛法，在这里也是弘传佛法。不知大师意下如何？”
“这？……贫僧十五年前离开广州，已在佛像前表明心志：倘若求得大法，誓回东土传扬，贫僧不敢于尊像前食言。”
“噢！既然如此。小王也不再勉强大师在这里长住下去。只是，还望大师在这里再住些时日，安心译传，待小王准备好之后，再送大师回去不迟。”
义净见国王这样说，只得答应了。
又过去了几天，还是没有消息。这天下午，义净正在静室辑录入印求法僧的事迹，释迦大师突然匆匆进来，说大唐已发生变故，义净暂时回不去了！释迦大师说的变故，就是大唐武皇后将改朝换代，代李唐而自立的事。边远地区不明详情，纷纷传言，都说李唐子孙已在全国各地调动大军，准备讨伐武后。义净听了，心想：在这种动乱的年头回去，难保梵经无失；况且，兵荒马乱的，怎么能安静下来翻译经律？想到这里，只得再三叹息，答应继续在佛逝住一段时间，但反复向释迦大师申明，等形势安定后，就立即回去。
既然眼下不能走，只好做不能走的打算。时不我待。义净略一思索，决定尽快开始译经。但梵书多是刻写在贝叶上，汉文却要用毛笔写在纸上，而且，这里通行的都是梵文、梵语以及昆仑语，即南海洲岛上夷人的语言，连一个精通汉文经义的帮手也找不到，如何着手译经呢？想来想去，只有向国内求援！义净突然想起了当年在广州制旨寺的情形，不由得喜上心头，给广州制旨寺写封信！
半个月后，有一广州商人的船路过佛逝，马上要返回广州。义净一听大喜，忙拿好书信，与小沙弥赶往码头。
这位广州商人对义净毕恭毕敬，他执意请义净上船叙话。等义净上了船，商人将他领进一座舱间，义净一看，原来竟是个小佛堂，供着释迦佛祖和文珠、观音两位菩萨！义净在小佛堂观瞻，赞不绝口。商人却面露神秘之色，拉着小沙弥出去说了会话，然后走了进来，对着义净纳头便拜：“弟子烧了半辈子香，今天有幸拜见活菩萨！”
这是哪里的话！义净忙请商人起身。商人却死也不肯，非得三跪九叩方才站起。随即向舱外吩咐一声，仆从立即捧进许多盘素饭水果，执意请义净用斋。义净无奈，加之也乐于和故乡人多亲近，只好一边用斋，一边问些话。
忽然，义净觉得船好像在动！又惊奇地发现，那个小沙弥怎么好长时间都不见了？义净忙走出舱外，抬眼一看，四周一片碧波，港湾已在数里之外！
那位商人却高兴地说道：“请大师恕弟子没有禀告之罪！弟子早就听说王寺留住活菩萨不放，我大唐的活菩萨岂能久居异邦！弟子已令那位沙弥传话给王寺：我等已接活菩萨回大唐供养了！”
原来是这样！义净真是哭笑不得：“还有经像、舍利子，都在王寺！”
“这？……活菩萨不用担心，下次船过来，弟子一定取回。”
因缘早已前定，既来之，则安之。也罢！先回趟广州，若真的有刀兵之乱，自己亲自买纸笔，找书手，然后返回佛逝译经，待形势安定之后再回来，也不失为一条良策。
半个月后，商船抵达广州。
义净求法归来，制旨寺僧众欢喜不尽，奔走相告。听义净说起请求译经助手共赴佛逝，众人一致推荐了附近峡山寺的贞固律师。此人的年龄、学识、修为，都符合要求，是最佳人选。另外，消息传出后，毛遂自荐的竞蜂拥而至。义净喜不自胜，从中又挑选了两位，一位是道宏，二十多岁；另一位是法朗，也是位年轻的求学僧，仪态端庄，擅长书法。不几天，那位广州商人亲自驾车，送来一车纸和笔、墨、砚等，说如果义净要返回佛逝，仍然由他负责送去。
十月底，北风起，商船扬帆南行，义净带着贞固、道宏、法朗和小沙弥怀业又抵达室利佛逝。
在室利佛逝王寺安顿下来后，义净便率贞固、道宏、法朗和怀业等四人开始了工作。贞固梵文根底很好，对律学也颇有造诣，是义净的得力帮手。道宏和法朗一边学梵文，一边听受抄写经文。小怀业则磨墨展纸，跑前跑后，趁机也学些梵字。
义净一边译传写作，一边也不忘故国情况，时时打探。第二年九月，武后改唐为周，自立为皇帝。又过了一年。武后的大周朝廷派使者来到室利佛逝，重申旧好。随使团来的还有一位大津法师，也打算巡礼西方佛国。大津法师告诉义净，虽然改朝换代，但主要是朝廷内部的事，百姓都还安居乐业。另外，女皇对佛法极为看重，对僧人也很尊敬。义净一听，放心了许多。
仲夏时节，大津法师带着义净这几年在佛逝写的《西域求法高僧传》两卷、《南海寄归内法传》四卷，以及已译出的十卷经论，回到长安。
日月倏忽，转瞬间两年过去，法朗已经因病而亡故，义净实在等不下去了。他打听到国内时局已稳定，便下定了决心：结束二十多年漂泊不定的生活，回东土去，找一个安静的地方，译传律法！
义净将打算告诉了释迦鸡栗底大师，大师明白义净的心愿，不好阻拦，只是希望将怀业留下来。怀业也愿意留在佛逝，随释迦大师学习经教。义净也就痛快地答应了。
武周长寿三年(694)四月，义净带着贞固、道宏，告别了室利佛逝国王，告别了王寺的释迦佛大师和僧众，带着从印度取回的经、像、舍利，登上了返回故国的商船。一个月后，船抵广州，义净再次住进了制旨寺。义净求法归来的消息在广州传开后，旧友新识，以及僧俗四众弟子，纷纷前来拜谒。真容圣像供奉在制旨寺大殿正中，香客云集，布施如山。
广州太守奏禀朝廷：又一位玄奘大师回到了国内！则天皇帝见了奏表，大喜，派使臣星夜兼程赶往广州，宣读诏书：速将义净大师护送至东都洛阳！
证圣元年(695)五月，在朝廷使臣和广州太守的簇拥下，如众星捧月一般，年愈花甲的义净回到了阔别三十多年的东都。
十译经传法遗言垂训
洛阳城里的老百姓们，听说有大法师来到洛阳，连皇帝都准备亲自出迎，早已将城东门挤得水泄不通。人人擎着香炷，个个口诵佛号，争先恐后，都想一睹大师的风仪。从上东门外开始，数十里之内，早已布满无数军兵，维持秩序。洛阳成百座佛寺，都搭制卜车、帐盖，僧众们手持香花，唱着赞呗，齐齐整整地站立两边。正中是朝廷百官相迎，数百面旗幡迎风飘扬。
义净一行来到了上东门前，突然一切都安静下来，只见正中门下，百官闪向两边，现出了当今的大周女皇。她头戴旒冕，身披黄袍，雍容华贵，含笑而立。内侍扶义净下了御车。义净定了定神，从容地走向武则天面前，合十致意。则天见状，也口称弟子，躬身施礼。然后，众内侍又扶义净上了御车，当先入了上东门。这时，又旗幡招展，乐声大起。洛阳城内也到处是卜车、牌坊，所过之处，香烟如云，颂佛号声不断。
车流、人流停在了建春门内的佛授记寺，义净及其带回的舍利、佛经、佛像，都被安置在这所皇家寺院内。随后，敕旨下达：封义净大师“三藏”之号，可立即着手翻译带回的经论，由朝廷提供一切便利。当时有“三藏”之号的僧人全国只有四位，其他三位都是外国的高僧，只有义净是本国人。
就在义净准备翻译带回来的佛经时，这年十月，内侍又奉宣圣旨，请义净三藏移住大福先寺，参预编写大周的《众经目录》，并和于阗高僧实叉难陀等共译《华严经》。这两项工程进行了四年方才完成。
大周久视元年(700)五月五日，东京洛阳大福先寺翻经院内，正在举行一项庄严神圣的仪典。身为大周帝国国立译经场的译主，义净三藏高坐在翻经院大堂的正中，译经场的其他成员，在两侧雁翅般排列。除了一位朝廷官员外，其余都是僧人。