藏獒养殖场中一般应当至少保持3个以上公獒家系和9个以上的母獒家系，称为保持血统。
保持家系血统的意义，是为了避免近交，防止退化。有资料说明，藏獒作为一个原始的地方犬品种，曾经历了严酷的自然条件的磨炼和藏族牧民严格的人工选择，犬群中隐性不良基因的频率应该是不高的。在该犬种群中目前仅发现和报道存在髋关节脱位与上下颌咬合错位的隐性基因遗传。但近交所产生的影响是多方面的，特别是近交有可能造成群体内优良基因的丢失，会对藏獒品种资源的保护和选育造成严重影响。在有一定规模的藏獒养殖场，如果没有专门的目的就应努力控制和防止近交。其中一项十分有效的措施，是尽可能按照犬群公、母比例的要求，多留不同血统的种公獒，最好达到每只公獒代表一个血统。不同家系或血统的犬往往可能在某一方面有独到之处，提倡保持血统，实际上就是保持了不同的犬只类型，为进一步加强人工选种、选配，促进藏獒品种资源保护奠定了基础。