水土保持是山区生态农业建设的第一步。
（1）调整农林牧业的布局。一方面要严格执行水土保持法，禁止在25°以上陡坡地开垦种植农作物，另一方面，要积极采取退耕还林草等水土保持措施，尽快减少土壤侵蚀面积。
（2）植树造林，调整林业种群和群落结构。首先，根据因地制宜，因害设防的原则，在中山、低山要营造水源涵养林，丘陵坡地营造水土保持林，滩涂地营造农田防护林。其次，保护好现有森林，加强对现有林的经营管理，提高林分质量，使其发挥更大的效益。第三，全面推行生态公益林的补偿措施。
（3）山地水土保持与合理开发利用。有效地利用系统中“废弃物”，不仅符合山区自然环境的复杂性和生态系统脆弱性的特点，而且也使山区农业生产的经济效益、生态效益和社会效益大大提高。