1649年2月4日，当爱丁堡收到查理一世上断头台的消息时，苏格兰国会便宣布侨居荷兰的查理一世之子为英国国王，称查理二世。1650年查理二世与苏格兰长老会派在荷兰布列达签订协议。查理二世同意把长老会教扩大到英格兰、爱尔兰，废除同爱尔兰签订的一切条约，克伦威尔苏格兰内政由苏格兰国会自行解决。1650年6月查理二世到达苏格兰，苏格兰成为王朝复辟的基地。英国国会任命克伦威尔为远征苏格兰军队总司令，费利特伍德和蓝白为副司令。克伦威尔集结1．6万军队，1650年7月22日越过特维德河，进入苏格兰。苏格兰任命戴维德·列斯特为总司令，军队2．6万人。7月末，英军接近苏格兰首府爱丁堡，爱丁堡工事坚固，英军无力攻城。列斯特用小规模战争消耗英格兰兵力。到8月末，克伦威尔只得退兵登巴尔，只剩1．1万军队。苏格兰追击英军到登巴尔。苏格兰军队不仅占领了登巴尔丘陵，而且切断英军的退路。歹嘶特认为，英军可能从海上逃跑，把军队从丘陵撤到平原。克伦威尔利用这个机会，于9月3日拂晓发动突然袭击。苏格兰军队处于丘陵与河水之间，运动极不方便，很快陷于混乱状态。苏格兰军战死3000人，被俘1万人。英军伤亡不到80人。登巴尔战役是克伦威尔以少胜多的典型战役之一。克伦威尔进军爱丁堡。到1650年底，英军已占领了整个苏格兰平原。苏格兰保王党于1651年1月1日在苏格兰北部为查理二世加冕，宣布他是苏格兰国王。
查理二世在苏格兰集结军队，入侵英格兰。1651年9月3日，克伦威尔军队与查理二世军队会战于瓦塞斯特。战斗持续3小时，查理二世全军覆没，死3000人，被俘9000人，全部军官被俘，查理二世一人逃往法国。1651年底，苏格兰大多数城市投降。1654年苏格兰合并英格兰，在英国国会里保留苏格兰30个席位。