李时珍医学智慧的结晶《本草纲目》是我国药学宝库中一颗闪闪发光的明珠。它收药之多，规模之大，质量之高，在当时是空前的。全书共190万字，52卷，记录了包括动物、植物和矿物等药品共1892味，其中总结民间经验增加的有374种，并附有历代药方11096个，以及1110幅插图。根据药物的性质，李时珍又把它们分别列为火、水、土、金、草、谷、菜、果、木、服器、虫、鳞、介、禽、兽、人等16部，每部又分若干类，共62部。它的主要成就如下：
第一，纠正了历代本草相沿的许多错误，系统地整理、总结了当时我国医药学发展的新成就。如把实际是两种药物被混为一物的葳蕤与中萎分清，把被误列为草类的生姜、薯蓣（yù）归为菜类，等等。
第二，提出了当时最先进的药物分类法。把收录的全部药物分成16个部分，每部再分，共62部。分动物、植物、矿物分类。在植物学上，依据植物的生态和习性进行分类，采取“析族区类”的办法；在动物学上，按动物由低级向高级进化的顺序排列起来；在矿物方面，按照从无机到有机的顺序排列。便于查找。
第三，系统地记述了各种药物的知识。对各种药物的记述，包括校正、释名、集解、正误、修治、气味、主治、发明、附录、附方等项，从药物的历史、形态到功能、方剂等，叙述很细。丰富了本草学的知识。
第四，纠正了一些反科学的见解。如关于食水银、雄黄可以成仙这种说法的批判，对于“草子可以变鱼”的更正。
第五，丰富了世界科学宝库。它不仅对药物学有详细记载，而且综合了大量的科学资料，在植物学、动物学、矿物学、物理学、天文、气象等方面都有广泛的论述，作出重要贡献。
第六，辑录保存了大量古代文献，在原书佚失的情况下，由于《本草纲目》的摘录，得以保存下来。
《本草纲目》是一部不朽的巨典，近四百年来，已在我国翻印了30多次，得到世界人民的高度评价。
无私正直，人格高尚
李时珍行医后，社会上出现了一股迷信方士邪说，相信灵丹妙药，追求长生不死的风气。
昏庸腐朽的明世宗（嘉靖皇帝）朱厚熜，梦想永坐帝位，长生不死。在1543 年以后，他干脆不理朝政，在宫中立祭坛，设炼丹所，成年累月召集一些方士寻求“神仙方术”炼制“仙丹”。他给方士加官晋爵，把一个当过黄梅县吏的方士陶仲文封做所谓“真人”，又加给许多高级官衔和显耀爵位。
这些方士到处设坛炼丹，逼老百姓进贡更多的钱财、珍奇药物和土特产品，无恶不作、欺压百姓。
各地的皇族、官僚、乡绅纷纷效仿，甚至朝中大臣有的也戴起方士帽，穿起方士服，以讨皇帝欢心。
在这种风气下，一些医生投其所好，终日谈论“灵芝仙鹤”、“天仙地仙”的邪说，许多人也服食丹药，一时间，一些“九转丹”、“六一泥”之类的丹药充斥医药界。
李时珍非常看不惯这些医生的口是心非、阿谀奉承的嘴脸。他尊重科学、不顾权势、冒着惹祸杀身的危险，挺身而出，公开揭露服食丹砂的害处，痛斥方士的邪说，反驳方士的胡言乱语，表现出高尚的人格。
灵芝，历来被方士吹得神乎其神。李时珍指出：灵芝不过是一种可以吃的菌类，它是用“腐朽余气生出来的，没有什么神奇”，说它是祥瑞的仙草，更是荒唐无稽。
针对一些人把丹砂、水银、砒霜、铅锡之类合在一起，炮制“仙丹”。
李时珍指出，丹砂和水银很有害，水银含在丹砂里面，是极毒的东西。人吞下去，就会“入骨钻筋，绝阳蚀脑”中毒而死。他还引证前人的例子说：宋朝学者沈括的一个表兄，误将一块丹砂当成丸药吞下，过后就糊里糊涂，不省人事，一夜就死了。唐朝的一个官僚信了方士柳沁的邪说，服了他的丹砂，结果便血四年而死。他还引述宋代医家寇宗爽的话说：人的躯体是血肉生成的，靠吃水谷得到营养。不吃五谷杂粮、蔬菜水果，而吃非但肠胃不能消化反而毒害人体的丹砂水银，怎么不自找死路呢？
有些医生与他争辩，并从《名医别录》、《雷公炮炙论》、《升炼丹药秘诀》一类书中，找到理论根据。
李时珍反驳说：是的，古代医书是很有价值的，古代医学家也值得我们佩服。但是，他们的思想中的错误，是不能坚持的。李时珍又说：“巴豆，本是毒药，用得得法却可以去大病，不得法就会误人性命。可是陶弘景这位我佩服的先辈却说，人吃了一颗巴豆就会死，老鼠吃了却可以肥到30斤重。
我不相信。还有唐慎微讲，菌桂合了龟脑子，吃七年，可以在水上步履如飞，也令人不信服。这些其实仅仅是上了道书的当，与医学上的真理是不能相容的。”
李时珍还指出，“伏翼”就是蝙蝠，有的地方又叫夜老鼠，有人认为它是“仙鼠”，入药服用，可以“令人肥健长生寿千岁”，这实在荒唐。他指出，伏翼白天倒悬在洞窟里睡眠，傍晚外出飞行活动，只不过是一种捕食蚊虫的动物而已，服用它令人不死的说法，实际是方士骗人的话，是没有道理的。
公元1567 年，嘉靖帝吞服丹药送了命。新皇帝穆宗继位后，把怒气完全发在方士身上，大肆逮捕，处死方士，废坛醮、撤炼丹所。这样一来，没有人敢讲炼丹服药的事了，一些医生吓得连炼丹用过的雄黄等药也不敢提了。
李时珍再次坚持真理，以科学的态度对待炼丹术。主张炼丹术要为医药学服务。他运用炼丹方法，亲自试验，学会了许多炼制化学药物的方法。他说：“水银的确不能吞服，但是它治病的功用是不可抹杀的。”他就研究过用水银合猪油治疗某些皮肤病。
李时珍的坚持真理正义的态度，表现了他不畏强权、崇尚科学的高尚品格。他不顾个人安危，勇敢地反对方士的斗志，不仅受到人们的称赞，更使人肃然起敬。
李时珍高尚的品质还表现在他同情贫苦病人，仁德待人方面。
李时珍常常免费为穷人治病，他知道，疾病对穷人的威胁有多大，他就尽自己所能，竭尽全力帮助这些穷人。有时这些人带一只南瓜或几尺布就算诊费。李时珍不仅尽心帮他们治病，而且常常在衣食住行等方面帮助他们渡过难关。
李时珍在楚王府做奉祠正的几年，他治好了楚王儿子的病，楚王全家非常感动。王妃为了表示感激之情，亲自拿了金银锦帛来报谢，李时珍坚决不肯接受，表现了高尚的情操。在王府里也树立起威信，使他可以进行著述《本草纲目》的工作。
李时珍在楚王府期间，念念不忘老百姓的生活，他常去外面给人治病。
常去蛇山观音阁，许多走不进王府大门的病人，都跑到那里去请他治病。
李时珍心中装着危难中的病人，所以他才能不畏任何艰难险阻，以一种医生的责任感以及对病人的同情心，顽强地同困难作斗争，写下了巨典《本草纲目》。
李时珍还蔑视功名利禄，一心一意做有益于人类的事。
李时珍经过三次科考，都失败了，但他并没有就此沉沦，而是以一种乐观的态度选择一项更加有益的职业。他的选择不是以社会地位的高低、功名利禄的多少为尺度的，而是以是否对人们的生活更有价值来选择的。
他的这种轻薄功名而重视社会价值，对人生始终抱有乐观进取的态度是令人敬佩的。
他不仅自己这样还鼓励身边的人也要乐观向上。
一次，李时珍去看望罢官回家隐居的吴明卿。吴明卿，字国伦，是当时的文坛名士，明“后七子”之一，曾经因不满奸臣严嵩，不满官场上的腐败风气，罢官隐居。看到闲居家中的吴明卿，他曾做一首诗《吴明卿自河南大参归里》：
青锁名藩三十年，虫沙猿鹤总堪怜。
久孤兰杜山中待，谁遣文章海内传？
白雪诗歌千古调，清溪日醉五湖船。
鲈鱼味美秋风起，好约同游访洞天。
这首诗的大意是：一位享有盛名的人物，辗转官场数十年，由于朝廷昏暗，忠奸不辨，突然一朝罢职，成了牺牲品，实在令人惋惜。可是，你总是独处家中，企图洁身自好，这么一来，又有谁去写诗作文流传于世呢？你满腹才华，应当像李白那样吟阳春白雪之歌，咏流传千古之调；你应当和朋友们出去游玩，饮美酒，荡轻舟，饱览大自然的无限风光，借以消愁遣兴。等到秋天，正当鲈鱼肥美的时候，我们相约几位同伴，一起到五湖去观赏那“洞天福地”的胜景吧！
从李时珍的这篇访友赠慰之作，可以看出，一方面，他对吴明卿的遭遇感到愤愤不平，一方面又不同意他消极的处世态度。他赞赏吴明卿的才华，勉励他虽然在官场上失败了，但却可以在文坛上大显身手，这种态度正与他本人完全一致。他在科举场上的失意，反而促成了他在科学上的伟大成功。
表现出他对于权势利禄的傲然轻蔑。
而且，李时珍以医学发展为己任，他为了这功在当代，利在千秋的巨著，为了更多的受疾病煎熬的人们，断然离开庸碌无为的官场。这是1557 年的事，他被推荐到京都太医院任院判，但他并没有把功名利禄放在心上，他把更多的精力放在太医院所属的寿药房、御药库以及那里收集的大量医学书籍上，他没有追随那些庸碌的医生去讨好奉迎皇帝，而是埋下头来为《本草纲目》的修订，做了大量的准备工作。任职仅仅一年，他便辞职回到清静的蕲州，去全心全意地在医学海洋里遨游。
李时珍行医不分贵贱，不阿谀奉承权贵，不受分外之财，而是恪守医德、治病救人，劝人为善。
一次，他去荆府富顺王处看病。富顺王朱厚焜特别溺爱他的小儿子，想废掉现在做世子的大儿子（按照明朝诸王世袭的规定立为世子者将继承王位）。刚好世子得了病，富顺王把李时珍请去，李时珍知道他的意思，看完病后开了一个处方，特意取名“附子和气汤”。这是借“附子”与“父子”的谐音，规劝富顺王以父子之大义为重，不要以好恶行事。李时珍的崇高品德和以医行义的巧妙方法，使富顺王深受感动，终于放弃了原来的错误想法。
李时珍还常与穷苦百姓生活在一起，不耻下问地向农民、渔夫、卖药人请教，与他们同吃、同住，一起研究草木的生长状况和特性效用。他谦虚求教，讲究礼貌，再加上他勤奋刻苦，不辞辛苦，终于获取了别人得不到的各种知识、各种医药单方，为丰富《本草纲目》的内容做出了积极的努力。
李时珍在科学上是个坦坦白白的人。如果有什么问题自己没有搞清楚他就直截了当地说不了解，没见过，决不掩饰，表现出对科学的严肃认真的态度。
例如《旧唐书》上曾记载一种食蛇的鼠，李时珍既没有见到过，也没能查到更多的有关资料。他就老老实实地承认自己难以断定《旧唐书》所载是否可靠，只好留待后人去研究。他在“食蛇鼠”一目下写到：“按《唐书》云：罽（jì）宾国（今阿富汗东北一带）贡食蛇鼠，喙尖尾赤，能食蛇，有被蛇螫者，以鼠嗅而尿之即愈。今虽不闻说此，恐时有贡者，存此以备考证。”
李时珍所讲的这种食蛇鼠，很可能是今天我国云南和印度、缅甸一带所产的蛇獴（měnɡ）。蛇獴又名獴哥，四肢短小，很像鼬（yòu）鼠，善捕毒蛇，对蛇毒有一种特殊的抵抗力。
在四百年前的封建时代，李时珍能这样坚持实事求是，科学、诚实的态度值得人们学习。
李时珍离开我们将近四个世纪了，但是他勤奋治学的动人事迹，坚持正义、仁德诚恳的高尚品格以及他对医药科学的杰出贡献是不朽的，他把自己的一生献给了医学。人民永远纪念这位伟大的科学家。