赵构建立起南宋，不管怎样，宋朝的国祚算是延续了下来。逃过一劫的赵构成了南宋的开国皇帝，是为宋高宗。
建炎元年五月（公元1127年5月5日）宋高宗传召给李纲，让他到应天府出任宰相。
御史中丞颜岐对高宗说道：“李纲向来主张抗金，金人对他极其痛恨，不宜任他为相。”
右谏议大夫范宗尹附和说：“李纲名浮于实，有震主之威，不可为相。”
高宗却另有想法。他分析了眼前的形式，现今文武官员中绝大多数对金人有着强烈的仇恨，自己的政权初建，要稳定人心，必须得让一位主战派代表出来稳定局面，李纲就是不二人选。于是，他坚持了自己的想法。
李纲接到任命，赶到南京应天府。他竭尽思虑，为高宗筹划重整朝纲，组织抗金。
李纲反对向金人投降，主张“一切罢和议”。
得到赵构在南京应天府（今商丘）即位的消息，张邦昌立即带着王时雍、徐秉哲等人从东京开封启程，赶往应天府。
到了应天府，张邦昌见到高宗赵构，不由分说，便即伏地叩头，连说：“微臣死罪，微臣死罪！”
赵构道：“爱卿何罪之有？朕知道爱卿乃是事出无奈，受金人摆布，绝非你本愿。金军一退，爱卿就主动还政，而且设法保护了列祖列宗的陵寝宗庙，对国家有功。”顿了一顿，继道：“为了嘉奖爱卿，朕封你为太保、同安郡王。”
赵构这样对张邦昌，李纲可不干了。在李纲看来，张邦昌完全是“大逆之徒”，怎么能封为王爵？天底下没有这个道理。
气急败坏的李纲给高宗赵构上书，说道：“张邦昌服侍道君皇帝，渊圣皇帝即位后还被封为太宰，朝廷对他的恩泽可谓浩大，废立之事，如果张邦昌能死节，金人未必不会被感动得折服悔罪，进而同意立赵氏为帝，但他并没有那样做，而是当真建立了金人的傀儡政权。昔日汉朝宗室刘盆子被赤眉军立为伪帝，在光武帝即位后带十多万人投诚，也不过免于一死罢了。如今张邦昌以臣易君，罪大于刘盆子，朝廷既不正其罪，反而尊崇，岂有此理？不光要惩办张邦昌、王时雍、徐秉哲等首恶之徒，城陷时身在东京的大臣、官员，全都应该问以叛逆之罪！必须这样，才能表彰忠节，天下人才会满意！”
由于李邦彦、吴敏等主和派的中流砥柱早被罢免流放，因此高宗的政权中以主战派为主，其代表李纲的意见不能不重视。
李纲的意见固然需要重视，赵构却也觉得他的想法太过偏激。赵构便问门下省侍郎吕好问说，卿当时也在城中，应当知道当时的情况，你认为应该如何处理？
吕好问答道：“臣确实亲历其事。当时阿附金军、助纣为虐的有罪之臣，不过十多个而已，岂可以把其他大臣统统说成是叛逆？”
赵构很看重吕好问，原因是开封陷落的时候，吕好问是兵部尚书。张邦昌登基时，前来出席典礼的金人曾经在南薰门谈论说“康王是我大金的眼中钉，应当派五千骑兵将其除去”，吕好问听见，就连忙派人秘密向赵构报信，说“大王如果觉得手下兵力可以抵挡，就邀击之，否则请速速远避。还有，大王若不自立为帝，恐怕有人不当立而立”。赵构认为他对自己很忠心。他的意见，赵构十分重视。
谢克家、耿南仲二人在金兵包围东京的时候也在开封城中，而且两人曾经弹劾过李纲，李纲想趁机置二人于死地，所以才用“惩罚叛逆”来刺激赵构，并声称若不依从他，他就辞去宰相。这一点，李纲是有私心的。
惩罚叛逆，本来就是立国的大义。李纲的观点固然过于偏激，但也不无道理。遭到空前惨烈的亡国之祸，对于曾经与金人合作的通敌分子，应该不分主从，尽行处罚才是。赵构却另有盘算，他认为自己的政权才刚刚建立，正好可以借机培植心腹，岂能听由宰相威胁？但他又不好正面反驳李纲，便说道：“如今王业艰难，正是纳污含垢之时，不好骤行峻法。”
最终，赵高采取了折中办法，将张邦昌降职流放潭州（今长沙）。
还记得那个华国靖恭夫人李氏吗？她深怕自己原来在开封皇宫中亲近张邦昌的事情败露，竟然来了个先下手为强，写了一份供词交给宰相李纲。供词中说，张邦昌被金人扶持成傀儡皇帝，之后目中无人，胆大妄为，居然将本宫奸污。
李纲拿着李氏的供词去见高宗。赵构再也没法保张邦昌了，只得将他赐死。
为了加强抗金斗争的力量，李纲推荐坚决抗战的老臣宗泽出任东京留守，去开封整修防御设施；又力主设置HB招抚司和河东经制司，支持两河军民的抗金斗争，并推荐张所、傅亮分别任HB招抚使、河东经制副使。他还针对北宋以来军政腐败，赏罚不明等情况，颁布了新军制二十一条，着手整顿军政，并建议在沿江、沿淮、沿河建置帅府，实行纵深防御。
李纲整顿军政的措施，有助于宋朝廷支撑局面，宋高宗起初尚能接受。然而，他主张坚决抗金及反对投降活动，却为宋高宗及汪伯彦、黄潜善所不容。高宗认为，加强下防御是可以的，非要同金人打仗，那可万万不行。
对金人已然十分忌惮的宋高宗见李纲越闹越凶，便将他调任尚书左仆射兼门下侍郎，同时委任黄潜善接任右仆射兼中书侍郎，以牵制李纲。接着，高宗又罢免张所、傅亮，撤销了HB招抚司及河东经制司，蓄意破坏李纲的抗金部署。
李纲原本打算一展抱负，没想到朝廷掌握着主要权利的这些人对金人怕得要死的丑态，他深感无奈。
是啊，人家不来打咱们就求之不得了，你难道还要惹是生非吗？
李纲向高宗提出辞职。
公元1127年八月，上任仅仅七十多天的李纲就遭罢相，提举杭州洞霄宫。
宋高宗赵构不敢惹金人，金人却不会放过他。