检测肝功能的方法虽然很多，但至今尚无一项特异性试验能对某一肝脏疾患的病因、病变程度作出准确的反映，也没有任何一项检查能单独反映肝脏的病变而不受其他因素的影响。再加上肝脏有较强的再生和代偿能力，当病变范围不大、时间不长时，肝功能检查可无异常，故肝功能检查正常并不能说明肝脏没有病变。因此在选择肝功能检测项目及判断检测结果时，应做全面考虑并结合临床症状具体分析。在具体选择应用肝功能检查时应注意以下几点：
（1）了解肝细胞有无病变及其程度
当临床怀疑肝炎或已确诊为急性肝炎需进一步了解病变程度时，可作转氨酶（ALT或AST）、复方碘试验、尿三胆试验、血清凡登白试验和胆红素定量检测。如为慢性肝炎，除以上试验外还可检测白蛋白/球蛋白比值（A/G），必要时检测血清蛋白电泳。如患者无黄疸且其他肝功能正常而不能排除轻度肝损害者，可通过检测磺溴酞钠滞留试验（BSP）来帮助诊断。
（2）判断黄疸的类型及其程度
当出现黄疸时，首先应检测血清总胆红素、一分钟胆红素和间接胆红素定量、凡登白试验、尿三胆试验、血清ALT及TTT（麝香草酚浊度试验）试验来区别为何种类型的黄疸。如疑为肝脏肿瘤或肝外梗阻引起的黄疸，则进一步检测碱性磷酸酶（ALP）。
（3）检测原发性肝癌
除常规肝功能试验外，可进行甲胎蛋白（AFP）、γ-谷氨酰转肽酶（γ-GT）、碱性磷酸酶（ALP）等测定，以帮助临床诊断。
（4）观察治疗效果、药物筛选及判断预后
根据病情选择某几项肝功能试验并定期复查做动态观察，可在一定程度上反映治疗是否有效。如急性肝炎病情好转时ALT由增高恢复到正常，而ALT长期波动或持续升高，则提示肝炎有转化为慢性肝炎的趋势等。
（5）手术前的肝功能检查
在各项大手术前，一般要检测血清ALT、TTT、A/G，必要时检测血浆凝血酶原时间以了解肝脏情况，做好术前准备。
（6）排除肝外因素干扰
某些肝外疾病也可致肝功能异常，如肾病综合征、恶性肿瘤等导致血浆总蛋白和白蛋白减少，甲状腺功能亢进时可有血清胆固醇降低，而服用某些药物或外伤等均可导致血清转氨酶升高。因此在选择肝功能试验及分析结果时，应排除肝外因素的干扰。