八月初一日，公弟国荃克安庆省城，贼党歼焉。初二日，驰奏鲍超一军进援江西，在丰城大获胜仗一摺。奏称：鲍超盛暑鏖兵，所向克捷，立功最伟，请赏赍珍物，以示旌异。随摺保宋国永、陈由立、黄庆等十七员，阵亡知州袁观丰、都司殷雄亮请恤。附片奏报克复安庆省城大概情形，称：楚军围攻安庆，已逾两年，画谋决策，皆胡林翼一人所定，卒得克此坚城，歼除悍贼。臣即日前往部署，其详细情形，另由官文、胡林翼、李续宜会衔具奏。初三日，多隆阿公克复桐城县。初五日，杨公载福派水师克复池州府城，杨公谒辞回籍。初七日，公舟抵安庆。初八日，公与公弟国荃、贞干入安庆城省，巡视城垣，安抚士民，治行馆廨署。搜擒降贼之知县孙润于军前斩之。多隆阿公分军克舒城、宿松、黄梅等县。
初十日，驰报水师克复池州进攻铜陵一摺。附片奏：各营欠饷过多，请旨饬江西每月拨解漕折银五万两，筹清欠饷，并请江西停解各省协饷。所有地丁入款，漕折税，先清本省守兵及臣处征兵欠饷，以免决裂之患。是日，接奉批摺及赞襄政务王大臣咨文，惊闻七月十六日文宗显皇帝龙驭上宾。公恸哭失声，自以十馀年来，受上知遇，值四方多难，圣心无日不在忧勤惕厉之中。现值安庆克复，军务方有转机，不及以捷报博玉几末命之欢，尤为感恸无已。十一日，湖北官军克广济县，旋收复蕲州、蕲水等城。十二日，水师进克铜陵县。十七日，贼扑浙江严州，府城失守。十八日，接奉哀诏。乃设次于安庆城中，率文武员弁成服哭临三日，日三哭。鲍公超追贼至抚州，贼窜贵溪、双港、湖坊、河囗一带，与闽广股匪合并，其数犹众。鲍公追剿，连战破之。二十二日，大破贼于双港，平贼垒八十馀座，擒斩万馀人。二十三日，克铅山县，追剿河囗，贼悉溃窜浙境。江西全省肃清。二十四日，湖北官军克复黄州府城。二十六日，胡文忠公林翼卒于武昌。公闻胡公之卒也，悲悼不已。谓胡公赤心以忧国家，小心以事友生，苦心以护诸将，天下宁复有似斯人者哉！二十七日，专弁赍奏恭慰大孝一摺。官文公奏请以李续宜署湖北巡抚，奉旨调授湖北巡抚彭公玉麟补授安徽巡抚，毛公鸿宾补授湖南巡抚。
九月初二日，公弟国荃督军循江北岸而下，派道员刘连捷等进军庐江县，总兵黄翼升以淮扬水师顺流下驶。初九日，公驰摺奏鲍超一军，追剿江西股匪于湖坊、河囗等处，大获胜仗，克复铅山县城，江西全省一律肃清，阵亡将弁王友得、黄友胜等十一名请恤。随摺保谭胜达、明兴、李文益、刘玉堂等十一员。附奏称提督鲍超转战三省，风驰电掣，骁勇罕匹，请旨授提督实缺，其部将宋国永、陈由立、黄庆、娄云庆、张玉田等，请授总兵实缺，以示奖励。又奏：“臣移驻安庆省城，酌派司道大员分任责成”一摺，附片奏：张运兰奉旨补授福建按察使，例应赴任，该司带勇，徽州防剿吃紧，无人可以接办，请俟军务稍平，再请陛见。
又奏报孙润正法一片。十六日，公弟国荃克泥汊囗贼垒。十九日，克神塘河贼垒。
官文公会奏安庆克复情形。奉上谕：“曾国藩调度有方，著加恩赏加太子少保衔。”钦此。又奉上谕：“官文等另片奏曾国荃等于围攻安庆时，智勇兼施。道员曾国荃著赏加布政使衔，以按察使记名，遇缺题奏，并加恩赏穿黄马褂，以示优奖。
候选训导曾贞干著免选本班，以同知直隶州知州尽先选用，并赏戴花翎“等因。
钦此。又奉上谕：“官文等奏请将殉难道员予谥等语。候选同知曾国华前在三河殉难，今其兄曾国藩、其弟曾国荃、曾贞干率师剿贼，克复安庆。一门忠义，深堪嘉尚。曾国华着加恩予谥，以彰忠烈。”钦此。二十日，公弟国荃克复无为州城。二十一日，公作《劝诫浅语》十六条，营官、僚属、委员、绅士各四条。二十二日，查阅城上防守兵勇，巡视城堞及城外营垒。二十三日，公弟国荃克运漕镇。时外洋轮船由上海驶至汉囗者渐多，上下往来，一日千里，奸商往往雇民船载货，系于其后，拖带以行，借免课税厘金，亦或借以资贼。公咨行通商衙门，称盐茶为货税大宗，饷源所赖，请照会上海洋商，毋得揽带民船货物。寿州练总苗沛霖亦捻匪之党，前岁与李世忠先后受抚，督师胜保公叠次奏保，补授四川川北道，加布政使衔。李世忠升任江南提督，帮办军务。苗沛霖与在籍办团之员外郎孙家泰等为仇，率其党围攻寿州。巡抚翁同书屡出谕之，苗沛霖不退。孙家泰等自杀，苗沛霖攻陷寿州。袁公甲三派李世忠以兵击之。诏命公移得胜之军分讨苗逆。二十九日，公弟国荃克东关贼垒，前后所克城镇，派军扼守，乃还安庆。
是月浙江之贼陷绍兴、处州二府城，其馀州县属邑，蹂躏殆遍。
十月初一日，公弟国荃还至安庆，商定增募湘勇直捣金陵之计。湖北官军克随州城。初三日，颁发捐输章程。扎派委员，按填给。札饬水师营官严拿游勇。
出示抚恤殉难员绅家属，被难流亡之士民招集复业，清房产争讼。左公宗棠军至广信。公调鲍超一军回皖，进军青阳，调朱品隆、唐义训等军进剿石埭，规复宁国。初六日，接奉遗诏，设次行礼。公弟国荃回湘增募湘勇六千人。初十日，彭公玉麟至安庆见公。彭公时奉安徽巡抚之命，具疏力辞。十四日，公具摺奏陈湖北抚臣胡林翼忠勤尽瘁，勋绩最多，乞饬付国史馆，查照施行。又驰摺奏报水陆各军克复铜陵县、无为州、运漕镇并沿江要隘三处，随摺奏保王明山、黄翼升、李朝斌等二十员。附片奏官军攻克运漕以后，本可直捣金陵，惟深入腹地，人数单薄，应令曾国荃添募湘勇六千，替出各城防守之师，进剿巢和，与下游都兴阿一军联络剿办，易于得势。又奏保知府陈补安庆知府一摺。附片奏前办皖南军务张芾所有文卷簿领，均因徽郡失陷，毁焚无存，请免造报。又片奏称：军兴十载，凡地方查办馈贼资粮受伪官职之案，徒为奸吏讼棍讹索之柄，江西新建县候通选判程迪昌迭次以馈贼重罚诬告善良，请将程迪昌革职严办，以儆刁风。又片奏皖南督办团练在籍编修宋梦兰、知府张韶南与其子张同生均以积劳病故请恤。
浙江杭、湖两郡，久被贼扑，岌岌不保，公咨商左公宗棠由广信进军衢州，以援浙江，调派张运兰防徽之军及江西东境防守之师，均归左公调遣。江苏官绅栖保上海县。十六日，钱公鼎铭由轮船赴安庆，见公痛哭，以请援师，且呈递官绅公函。谓吴中有可乘之机，而不能持久者三端：曰乡团、曰枪船、曰内应是也；有仅完之士而不能持久者三城：曰镇江、曰湖州、曰上海是也。公见而悲之。时饷乏兵单，楚军无可分拨，与李公鸿章筹议，期以来年二月济师。十八日，奉上谕：“钦差大臣两江总督曾国藩著统辖江苏、安徽、江西三省，并浙江全省军务。所有四省巡抚提镇以下各官，悉归节制。浙江军务，著杭州将军瑞昌帮办，并著曾国藩速饬太常寺卿左宗棠驰赴浙江，剿办贼匪。浙省提镇以下各官，均归左宗棠调遣。”钦此。二十六日，专摺奏谢天恩加宫保衔。又代奏弟国荃、贞干谢恩晋秩一摺。又奏谢弟国华奉旨予谥恩一摺。是月湖北全境肃清，官文公调派成大吉等军进驻霍山，以规寿州。刘公蓉奉旨署四川布政使。
十一月初二日，公巡视安庆城垣，度地拟建试院一区，令上下江分闱乡试，既而不果。多隆阿公收复三河镇。十四日，奉到节制四省之旨，旋又奉酌保封疆将帅人才之旨，又奉察看江苏巡抚薛焕、浙江巡抚王有龄能否胜任据实具奏之旨。
公自以任大责重，值时事之艰难，弥觉惕然不敢自安。十六日，驰摺奏左宗棠一军定议援浙，请将广信、徽、饶诸军统归节制，以一事权。该处一切军情，即由左宗棠自行奏报，以昭迅速。信郡钱粮。河囗、景德镇金，拨归左宗棠经收。
其防剿进止，均由左宗棠相机办理。又具摺奏保江西署藩司李桓留办粮台，并请敕效军机处记名，以藩、臬两司遇缺题奏。又具摺奏保道员万启琛署理安徽按察使、李榕署理江宁盐巡道，均随同驻安庆，筹办善后事宜。附片奏新授衢州镇总兵朱品隆现调令会合鲍超一军，进攻宁国，暂难赴任。又片奏：两江政务殷繁，现在行营一无成案可查，所有刑名钱谷及盐员武职补缺与地方寻常事件，应由臣衙门循例具题者，请暂行展缓，抑或改题为奏，以归简易。是日，又奏水陆各军攻克赤冈岭、菱湖贼垒克复安庆省城三案出力员弁开单请奖一摺。又奏克复休宁、黟县及徽州府城迭次攻剿各岭隘出力员弁开单请奖一摺。又奏行营采访忠义第四案，附片奏刑部主事柯铖之母柯王氏骂贼殉难，请建专坊。又查明柯氏一门殉节者五名，列为第五案。二十五日，奏辞节制浙江省一摺。奏称：臣自受任两江以来，祁门被困，仅得自全；至于安庆之克，悉赖鄂军之功，胡林翼筹画于前，多隆阿苦战于后，非臣所能为力。江苏乃职分应办之事，尚无一兵一卒达于苏境。
乃蒙宠遇非常，节制四省，自顾菲材，实难胜任。左宗棠之才，实可独当一面，即无庸臣兼统浙省，苟恩虑所能到，才力所能及，必与左宗棠合谋，不分畛域，不必有节制之名，而后尽心于浙事也。又具摺复奏查明苏浙两省抚臣优劣情形，奏参候补盐运使金安清请即革职。附片奏保道员李鸿章可膺封疆重寄，现在臣处统带水军，请酌拨陆军数千人，驶赴下游，以资援剿，又奏保提督鲍超功绩甚伟，请赏穿黄马褂，以示旌异。又片奏常州一郡士尚节义，多可用之材，就所知者，奏保周腾虎、刘翰清、赵烈文、方骏谟、华衡芳、徐寿六员名，请量材录用。二十六日，奉到大行颁赏遗念衣服一箱。公拜领行礼谢恩。浙江贼攻扑徽州，左公宗棠派军援剿。公调朱品隆回军援徽。是月贼攻杭州，张忠壮公玉良阵亡。贼分陷宁波、台州各府城。二十八日，杭州省城失守，将军忠壮公瑞昌、巡抚王壮愍公有龄、总兵饶壮勇公廷选等皆死之。
十二月，鲍公超击贼于青阳，屡破之，进攻县城未克。张公运兰病甚回籍，其弟运桂代领其军守徽州。朱品隆军至，击贼破之。十七日，奏遵旨筹商苗沛霖剿抚情形：该练逆迹昭彰，断无再抚之理。现楚军剿办粤逆，难以同时并举，须俟庐州克后，与袁甲三临淮之师联络，乃可并力剿苗。彭玉麟素统水师，舍舟登陆，用违其长，且江面太长，照料非易。该抚两次奏请开缺，应请旨另简大员接任皖抚，俾得乃领水师，于南北大局，两有裨益。又奉遵旨派员赴上海押解革员何桂清来京候讯一片。又奏得鲍超一军攻克安庆贼垒肃清江西全省两案出力员弁开单请奖一摺。十八日，恭接登极诏书。是日，驰奏：浙江省城失守，徽郡被围，臣奉援浙之命，赴救莫及，请交部严加议处。谨通筹全局，力图补救之策，分条陈奏：其一，浙江全省惟衢州一府可以图存，左宗棠一军，先固江皖边防，再筹进剿；其一，请敕下闽浙督臣庆端速派劲旅，严守浦城，俾贼不得由闽境而窜江西；其一，请调广西臬司蒋益沣带领所部五六千人迅赴浙江，随同左宗棠筹办防剿，道员陈士杰带勇驰赴安庆，听候调遣，并请将该二员补授苏、浙两省实缺；其一请饬下闽广督抚，粤海关、闽海关按月筹拨银十三万两，解交左宗棠军营。
附片奏团练一法，不能剿大股悍贼，请将江南团练大臣裁撤。又奏左宗棠一军乐平、建德、德兴等处大捷，出力员弁，汇案请奖。附片奏布政使衔道员王开化积劳病故，请照布政使例从优赐恤予谥。奉旨予谥贞介。二十六日，朱品隆等大破贼于徽州，左公宗棠分军破贼于大鳙岭。徽境肃清。二十七日，奉到上谕：“曾国藩奏接奉节制江、浙等四省军务沥陈恳辞一摺，谦卑逊顺，具见悃忱真挚，有古大臣之风，深堪嘉尚。江浙军情，本属相关一气，凡该大臣思虑所到，谅无不协力同心，相资为理。节制一事，该大臣其毋再固辞。”钦此。侍郎宋公晋奏请饬川、楚、江、皖五省会剿粤逆，诏公与官文、李续宜等详议。公会奏称：增兵必先增饷，非一省所能为力，必须五省合力筹划，众志一心，方于事有实济。现拟咨商各省详议饷数。是月公弟国荃奉旨赏加头品顶戴，左公宗棠授浙江巡抚，沈公葆桢授江西巡抚，李公桓授江西藩司，暂署巡抚，彭公玉麟以兵部侍郎候补。
诏公酌保皖抚。安庆复后，公至省城，招徕士人，修葺敬敷书院，每月按期课试，校阅文艺，其优等者捐廉以奖之。于嘉惠寒士之中，寓识拔才俊之意。皖中人士，莫不感奋。公札司道设立善后局，安抚遗黎，清查保甲，刊发《劝诫浅语》十六条。分设谷米局及制造火药子弹各局，委员司之。又设内军械所，制造洋枪洋炮，广储军实。委员查核民田，分别荒熟。其已垦者，暂令按亩出钱四百文，以助军饷，谓之抵征。除日，派忠义局委员协同街团绅士施放钱米，以赈饥民。
是岁亲王僧格林沁与兵部侍郎胜保，皆奉旨授钦差大臣，督师剿办捻匪。内阁学士毛昶熙，奉旨督办河南团练。提督冯子材办镇江军务，以副都统魁玉为帮办。