「丁巳」咸丰七年，公四十七岁。
正月，公在南昌。初五日，吴公坤修克奉新县城，毕刚毅公金科由饶州率军剿贼于景德镇，遇伏阵亡。十七日，奏报吴坤修一军迭获胜仗，克奉新县城。随摺奏保吴坤修请以道员用，并保杜霖、孔广晋二员，阵亡勇弁陈有才、余瑞林请恤。又奏报江西官军克建昌、武宁二县，湖北援军收复瑞昌、德安，湖南军收复新喻、永宁等县城。附片奏：九江南北两岸水陆至二万馀人之多，臣即日拟由瑞州前往九江料理联络，惟现患目疾，请赏假一月，即在军营调理。是日拜摺后，出至奉新，督带吴坤修一军赴瑞州。扼扎府城东面，始合长围，掘堑周三十里，以断贼之接济。西安将军福兴奉旨领兵千人，由浙江赴江西会剿，于是月抵南昌。
二月初四日，公由瑞州回至南昌，会商军务。初九日，仍还瑞州营。竹亭公以初四日薨于里第。十一日讣至瑞州，公大恸，仆地欲绝。次日赴告南昌及湘军各营，设次成服。十六日，驰摺奏报丁忧开缺，奏称：微臣服官以来，二十馀年未得一日侍养亲闱。前此母丧未周，墨襄事，今兹父丧，未视含殓。而军营数载，又功寡而过多，在国为一毫无补之人，在家有百身莫赎之罪。瑞州去臣家不过十日程途，即日奔丧回籍。查臣经手事件，以水师为一大端。提督杨载福、道员彭玉麟，外江、内湖所统战船五百馀号，炮位至二千馀尊之多。此非臣一人所能为力，合数省之物力，各督抚之经营，杨载福等数年之战功，乃克成此一枝水军。请旨特派杨载福总统外江、内湖水师事务，彭玉麟协理水师事务，该二人必能了肃清江面之局，并请饬湖北抚臣、江西抚臣每月筹银五万两，解交水营，以免饥溃。仍恳天恩，准臣在籍守制，稍尽人子之心。合家感戴皇仁，实无既极！
抑或赏假数月，仍赴军营效力之处，听候谕旨遵行。江西巡抚文俊公派委督粮道李桓至瑞州营，李公续宾之弟续宜，自九江驰赴瑞州唁公。二十一日，公与公弟国华自营启行。二十九日，抵里门。越数日，公弟国荃自吉安营奔丧回籍。湖南巡抚骆公秉章奏报公丁父忧一摺。奉上谕：“该侍郎现在江西督师，军务正当吃紧。古人墨从戎，原可夺情，不令回籍。惟念该侍郎素性拘谨，前因母丧未终，授以官职，具摺力辞，今丁父忧，若不令其奔丧回籍，非所以遂其孝思。
曾国藩著赏假三个月，回籍治丧，并赏银四百两，由湖南藩库给发，俾经理丧事。
俟假满后，再赴江西督办军务，以示体恤。“钦此。三十日，具呈骆公请代奏报奔丧到籍日期。
三月初一日，奉上谕：“曾国藩奏丁忧回籍请派员督办军务一摺，业经降旨赏假三个月，回籍治丧。所有曾国藩前带水师兵勇，著派提督衔湖北郧阳镇总兵杨载福就近统带，广东惠潮嘉道彭玉麟协同调度。所需兵饷，并著官文、胡林翼、文俊源源接济，毋使缺乏。该侍郎假满后，著仍遵前旨，即赴江西督办军务，以资统率。”钦此。安徽官军溃于桐城，皖北之贼大炽。官文公檄调李****督军援皖。二十六日，公具呈骆公，请代奏谢恩赏假并银两。
四月，贼酋陈玉成由安徽纠党犯鄂境，蕲、黄以北各州县城皆扰陷，李公续宜由瑞州分军回鄂以击贼。江西吉安、临江、瑞州等府城，久攻未克，贼酋石达开率贼党往来江、楚境，为城贼之援。骆公秉章檄调王鑫老湘营三千人，赴江西为雕剿游击之师。
五月，石逆大股援吉安，王公鑫驰往奋击，大破之。二十二日，公以假期将满，具摺奏沥陈下情，恳请终制：臣在京十四年，在军五年，祖父母、父母先后见背。生前未伸一日之养，没后又不克守三年之制，寸心愧负，实为难安。臣恭阅邸抄，大学士贾桢丁忧，皇上赏假六个月。旋因贾桢奏请终制，奉旨允其所请。
臣葬事未毕，恳照贾桢之例，在籍终制。
闰五月，奉上谕：“曾国藩奏沥情恳请终制一摺。曾国藩在江西军营闻丁父忧，前经降旨赏假三个月，回籍治丧。俟假满时，再赴江西，督办军务，以示体恤。并据该侍郎奏称，假期将满，葬事未毕，吁准在籍终制。曾国藩本以母忧守制在籍，奉谕帮办团练，当贼氛肆扰皖、鄂，即能统带湖南船勇，墨从戎。数载以来，战功懋著，忠诚耿耿，朝野皆知。伊父曾麟书因闻水师偶挫，又令伊子曾国华带勇远来援应，尤属一门忠义，朕心实深嘉尚。今该侍郎以假期将满，陈请终制，并援上年贾桢奏请终制蒙允之例。览其情词恳切，原属人子不得已之苦心。惟现在江西军务未竣，该侍郎所带楚勇，素听指挥，当兹剿贼吃紧，亟应假满回营，力图报效。曾国藩身膺督兵重任，更非贾桢可比。著仍遵前旨，假满后即赴江西督办军务，并署理兵部侍郎，以资统率。俟九江克复，江面肃清，朕必赏假，令其回籍营葬，俾得忠孝两全，毫无馀憾。该侍郎殚心事主，即以善承伊父教忠报国之诚，当为天下后世所共谅也。”钦此。初三日，奉竹亭公葬于湘乡二十四都周壁冲山内丙山壬向为茔。李元度驻贵溪御贼，屡有功，专弁诣公函商军事。公复书谓：江西军务，刻不去怀。所以奏请终制者，实以夺情两次，乃有百世莫改之愆。至所自愧憾者，上无以报圣主优容器使之恩，下无以答诸君子患难相从之义。常念足下与雪芹皆有极不忘者。前年困守江西，贼氛环逼，雪芹之芒鞋徒步，千里赴援；足下之力支东路，隐然巨镇。鄙人自读礼家居，回首往事，眷眷于辛苦久从之将士，尤眷眷于足下与雪芹二人。（雪芹，彭公玉麟字也。）
王公鑫击贼于宁都州永丰县境，皆大破之。
六月初六日，公具摺恭谢天恩，请开兵部侍郎署缺。又具摺沥陈历年办事艰难竭蹶情形：臣处一军，概系募勇，虽能奏保官阶，不能挑补实缺。将领之在军中，权位不足以相辖，大小不足以相维。臣居兵部堂官之位，而势权反不如提镇。
此其一端也。筹饷之事，如地丁漕折，劝捐抽，均需经地方官之手，臣职在军旅，与督抚势分主客，难以呼应灵通。此又一端也。臣办团之始，仿照通例，刻木质关防，文曰“钦命帮办团防查匪事务前任礼部右侍郎之关防”。四年八月，剿贼出境，湖南巡抚咨送木印一颗，文曰“钦命办理军务前任礼部侍郎关防”。
五月正月换刻，文曰“钦差兵部侍郎衔前礼部侍郎关防”。秋间又换刻，文曰“钦差兵部右侍郎之关防”。臣前后所奉寄谕，援鄂援皖，筹备船炮，肃清江面，外间皆未明奉谕旨，时有讥议。关防更换既多，往往疑为伪造。如李成谋已保至参将，周凤山已保至副将，出臣印札，以示地方官而不见信，反被诘责。甚至捐生领臣处实收，每为州县猜疑。号令所出，难以取信。此又一端也。三者其端甚微，关系甚大。臣处客寄虚悬之位，又无圆通济变之才，恐终不免贻误大局。目下江西军势，无意外之虞，无所容其规避，若果贼氛逼迫，当专摺驰奏，请赴军营，不敢避难。若犹是平安之状，则由将军福兴、巡抚耆龄两臣会办。事权较专，提挈较捷。臣在籍守制，多数月尽数月之心；多一年，尽一年之心。疏入，奉上谕：“曾国藩以督兵大员，正当江西吃紧之际，原不应遽请息肩。惟据一再陈请，情词恳切。朕素知该侍郎并非畏难苟安之人，着照所请，准其先开兵部侍郎之缺，暂行在籍守制。江西如有缓急，即行前赴军营，以资督率。此外各路军营，设有需才之处，经朕特旨派出，该侍郎不得再行冫卖请，致辜委任。”钦此。王公鑫破贼于广昌，又破贼于乐安。贼回窜吉安。周凤山等军败溃。胡公林翼督军于黄州击贼，连破之。王刚介公国才阵亡于黄梅。
七月，楚军攻克瑞州府城，刘武烈公腾鸿阵亡。耆龄公檄调普承尧等移师公攻临江府。
八月初四日，王壮武公鑫卒于乐安营次。其老湘营一军，以张运兰、王开化分领之。十四日，奉上谕：“昨据给事中李鹤年奏曾国藩自丁父忧后，迭蒙赐金给假，褒奖慰留。此后墨从戎，宜为天下所共谅，岂容以终制为守，经再三冫卖请，请饬仍赴江西，及时图报等语。军务夺情，原属不得已之举。朕非必欲该侍郎即入仕途，然如该给事中所奏，亦可见移孝作忠，经权并用，公论自在人心。现在江西军务，有杨载福统带，虽无须曾国藩前往，而湖南本籍逼近黔、粤，贼氛未息，团练筹防，均关紧要。该侍郎负一乡重望，自当极力图维，急思报称。
所有李鹤年原摺，著钞给阅看。“钦此。李公续宜引军渡江，至黄州，会鄂军克蕲水、广济、黄梅，击小池囗贼垒，破平之。湖北全境肃清。胡公林翼至小池囗，督诸军合攻九江。
九月初八日，官军水陆齐举，克湖囗县城，攻破梅家州贼垒，内湖、外江水师始合。初九日，公具摺复奏：臣两奉谕旨，现在江西军务，办理得手，自可无庸前往。湖南目下全省肃清，臣仍当暂行守制。如果贼氛不靖，应须团练筹防之处，届时商之抚臣，奏明办理。臣自到籍以来，日夕惶悚。欲守制，则无以报九重之鸿恩；欲夺情，则无以谢万世之清议。惟盼各路军事日有起色，即微臣寸心亦得以稍安。附片奏称：此后不轻具摺奏事，前在江西经手未完事件，拟函致江西抚臣耆龄，请其代奏。疏入，奉朱批：“江西军务渐有起色，即楚南亦就肃清，汝可暂守礼庐，仍应候旨。大臣出处，以国事为重，抒忠即为全孝，所云惧清议之訾，犹觉过于拘执也。”钦此。十三日，杨公载福督水师，破小姑山贼卡。二十一日，克彭泽县，拔其伪城，乘胜而下，连克望江、东流，直抵安庆城外。进克铜陵县，又拔其伪城二座，逐北千里，遂与定海镇之红单船相接。红单船见楚师旗帜，大惊以为神。杨公分银米火药以饷下游船兵，皆大感服，仍率水师回泊湖囗。自公在衡州创立舟师，苦战四载，至是克奏奇功，肃清江面之势成矣。胡公林翼以水面一军，本自公建立，杨公载福、彭公玉麟皆经公识拔于风尘之中，所统将弁，皆公旧部。遂于二十四日在九江营次，驰奏起复水师统将以一事权一摺。奉上谕“曾国藩丁忧后，奏派杨载福总统内湖、外江水师，彭玉麟协同办理。
业经明降谕旨，允其所请。朕因该侍郎恳请终制，情词恳切，且江西军务渐有起色，是以令其暂守礼庐“等因。钦此。湘军之攻吉安也，公弟国荃所部湘勇曰吉字营。夏间周凤山之败，公弟国荃方在籍，而吉字营独全军而退，保守安福。于是江西巡抚耆龄公奏请起复曾国荃治军吉安，旋令总统吉安各军。公居礼庐，念江西援军连失刘腾鸿、王鑫二劲将。于国荃之行也，反复训诫，以和辑营伍、联络官绅与夫攻战之法，至数千言，并令辞总统之任。
十月，公弟国荃抵安福，约会各军，并集吉安城外。
十一月，石达开纠贼党由皖入江，犯湖囗。李公续宜击破之。贼由饶、抚疾趋吉安，官军合力迎击，破贼于吉水县之三曲滩，城围遂合。
十二月初八日，楚军克临江府城。刘公长佑因病回籍，其所部勇，并归萧公启江总统，而以刘公坤一分领之，进攻抚州。张公运兰等进军建昌府。于时江西西路，仅吉安、九江两城未复而已。公治军五载，粮台无定处，经涉三省，头绪繁多。公于读礼之次，酌拟报销大概规模。于是月具摺咨江西巡抚附奏。奏称：臣处一军，未经奏派大员综理粮台，亦无专司之员始终其事。越境剿贼，用银渐多，历时既久，散漫难清。拟将水陆各军，分为数大款，在臣处领饷之月日截清起讫，归臣处报销。至若经手人员，如同知陶寿玉、知府李瀚章、道员裕麟、厉云官、礼部员外郎胡大任、甘晋等，经臣前后派委，分处江、楚各省，俟江西军务将毕，即饬该员等为臣办理报销事件，造册送部。如有款目不符，著赔追缴之处，皆臣一身承认，不与该员等相干。请旨饬部核议施行。附奏报邓辅纶捐造战船请叙一片，请注销李新华捐案一片。
是岁安徽之贼与河南之捻匪相结，党众炽盛。安徽巡抚福济罢职，以李****署理巡抚。钦差大臣都统胜保与副都御史袁甲三，均驻皖豫之交，督办军务，又以翁同书为安徽巡抚。十一月，德兴阿公克瓜洲，张公国梁克镇江府。
「戊午」咸丰八年，公四十八岁。
正月，公在里第卜宅兆，将谋迁葬。公过罗忠节公家、刘武烈公家，慰其老亲，抚其孤子。又至刘公蓉家，小住二日，畅谈忘倦。江西巡抚耆龄公奏委公弟国荃总理吉安攻剿事务。
二月，行小祥礼，公弟国华除服。公与弟国华议立家庙，祀曾祖以下，置祭田四十六亩，庙中庋藏御赐衣物若干事，诰命十一轴，祖考遗念衣履、几砚、宗器、祭器若干件，书籍数千卷，分条记注于簿。公之为学，雅重礼典，国朝尚书徐公乾学《读礼通考》，秦文恭公蕙田更为《五礼通考》，二书皆公素所服膺。
自上年奉讳家居以来，日取二书，昕夕研校，读之数反。凡几延奠祭，必参考古今，衷于至是而后已。