《黄帝内经》的书名从何而来？
经，《辞源》：“凡道义、法制不可易者，皆谓经”；“书也，古有十三经”。据此，经，是指只能遵循而不可改易的规范或书籍。在医药书籍中除《内经》外，尚有《难经》、《本草经》等。内，一种看法是对待之义，内与外相对而言，丹波元胤《医籍考》所说：“内外，犹《易》内外卦，及《春秋》内外传、《庄子》内外篇、《韩非子》内外诸说，以次第名焉者，不必有深意。”内外除有相对之义，尚有价值品位高低之分，如《庄子》内外篇，一般认为内篇是庄子所著；外篇，可能掺杂他的门人和后来道家的作品。《春秋》内外传，专主解释经义的为内传；广引事例，推演本义的为外传。这样内外就有纯驳，本义与演义的次第之分。另一种看法，张介宾认为：“内者，生命之道也。”两说：一从此书的价值而言；二从内容而言，各有所长。
至于《内经》书名冠以“黄帝”，其义在于“取重”。正如《淮南子》所说：“世俗之人，多尊古而贱今，故为道者，必托于神农、黄帝而后能人说。”
《素问》是什么含义？
对《素问》含义的认识大体有四说：一说，《素问》即问本，探索人与自然的根本性问题。全元起认为：“素者，本也；问者，黄帝问岐伯也。方陈性情之源，五行之本，故曰素问。”二说，平素问答。马莳、吴昆、张介宾等人则认为《素问》之义即“平素问答之书”。其三，认为《素问》是问素女。《云笈七·神仙通鉴》云：“天降素女，以治人疾，帝问之，作素问。”四说，《素问》是问太素。太素是天地宇宙万物形成及人们认识发展的完备阶段。《新校正》按：“《乾凿度》云：‘夫有形生于无形，故有太易、有太初、有太始、有太素。太易者，未见气也；太初者，气之始也；太始者，形之始也；太素者，质之始也。气形质具，而疴疾由是萌生，故黄帝问此太素，质之始也。《素问》之名，义或由此’。”后人认为杨上善《黄帝内经太素》的书名，更接近于“太素者，质之始也”的说法。
《灵枢》的含义是什么？
《灵枢》是演变的书名。西汉时无名，合编于《黄帝内经》十八卷之中。东汉名《九卷》，见于《伤寒杂病论》序中。晋名《针经》，恐与《九针十二原》中“先立针经”之语有关。唐名《九灵经》，清·陆心源《仪顾堂题跋》灵宝注：“以针有九名，改为九灵；又以十二经络分为十二卷。王冰又因《九灵》之名而改为《灵枢》，其名益雅，其去古益远，实一书也。”目前无资料反映王冰命名《灵枢》的含义。明·马莳认为本书是医学之门户，注曰：“正以书为门户合辟所系，而灵乃至圣至元之称。”张介宾从医学效应解，认为：“神灵之枢要，谓之《灵枢》。”
今人钱超尘教授提出“这些解释恐怕都是求之过深，未见符合王冰当时改《九灵》为《灵枢》的原意”。
据陆心源“以针有九名，改为九灵。”“九”言九针，“灵”之义可能指物之不笨拙者，即小巧玲珑。《内经》已体现出针具由原来粗糙的石材的砭石、针石改革为金属材料制作的精细的针具，称之为“微针”、“小针”。“九灵”可能指九种精巧的针具，以此为命名。
“枢”、“骨”在《内经》中又指针具。《灵枢·官能》记载：“左引其枢，右推其肤，微旋而徐推之。”《灵枢·邪客》记载：“左手执骨，右手循之，无与肉裹。”据此，《灵枢》之义可能取之于灵巧的针具，而以此命名其书。