一、征服意大利
在婚后的第三天，拿破仑便告别约瑟芬，赶赴意大利军团赴任。
意大利长期以来一直是西班牙波旁王室和奥地利哈布斯堡王室互相角逐的战场。哈布斯堡王室统治着该地区的北部，他们在那里占领着富饶的米兰公国和曼图亚大要塞等封地。意大利半岛的南部连同西西里岛，则是在西班牙波旁王室的后代费迪南四世的统治下。这两个王室所属的地域大都处于中世纪的死气沉沉的状态中，政治上处于极软弱无力的地位。早在前几年拿破仑就对意大利的政治及军事状况做过分析研究，觉得在此开战将有利可图。1795年夏，拿破仑在巴黎“测绘局”工作时，曾精心制定过入侵意大利皮埃蒙特的作战计划。虽然那个计划因热月政变而夭折了，但现在他当上了意大利军团司令，这个计划便可以着手实行了。
拿破仑到达意大利军团所在地尼斯。他首先依法树威，整顿军风军纪。一天，有一位中尉带着几个士兵前来向新司令申冤。他们的东西被另一部分士兵强盗般地哄抢了，并且遭受了残暴的殴打。这伙士兵本想伺机报复，但遭到了中尉的制止，他提议向新来的司令官讨公道，而不去自己报复。
拿破仑早就了解军团内由于纪律废弛，几成游匪，并且形成了习惯。军队没有法纪，谈不上权威和教育。他利用这一典型案例，发布了如下命令：
“马上查清抢劫行动中的士兵名单，按军法论处，并且不论出身贵族还是平民，一律不准讲情，一视同仁，严惩不贷。对那位来访中尉，给予嘉奖，并提升上尉，以示全军。”
拿破仑又对胆敢嘲笑他个子矮小的身材高大的奥热罗说：“将军，我的个子是比你们矮，但如果你们因而蔑视我的话，我将马上砍下你们的头，消除这个差别。”
拿破仑手下有五个师，师长分别是马塞纳、拉阿尔普、奥热罗、塞律里埃和梅尼尔将军。这些人都是能征惯战的老将，但普遍不重视军风军纪，对新来的司令官也颇为不恭。他们不久即发现，拿破仑是绝对不可冒犯的。他对你的一切，包括一些见不得人的心理活动几乎都了如指掌。新司令几乎洞悉行军作战的一切细节，糊弄他是要受到惩罚的。自己除了在身材和年龄上可以与之相比外，在其他方面绝对无法与之争锋，惟一的办法是服从。何况接踵而至的是一连串胜利的荣誉呢。
对士兵，拿破仑除加强纪律性以外，最拿手的是激发他们的公民荣誉感和自尊心。他对士兵演说道：
“士兵们，你们没有衣服穿，吃的也不好，政府欠下你们很多东西，可是它什么也不能发给你们。你们在这些悬崖峭壁间显示出来的勇气和坚韧力量是令人惊叹的，可是这并没有给你们带来任何荣誉，他们的光辉并没有照到你们身上。我想带你们到世界上最富饶的国家里去，富饶的地区和繁华的大都市将受你们的支配。你们在那儿将会得到尊敬、荣誉和财富。意大利军团的士兵们！难道你们的勇敢精神和坚韧力量不够吗？”
拿破仑还说，你们目前是普通的士兵，但未来的将军、元帅将产生于你们中间。不想当将军的士兵不是好士兵，每个士兵的背包中都有一柄元帅的节杖，问题就在于你们自己是不是勇敢作战，去把理想变为现实。
拿破仑的战争动员使这些饥饿的士兵们有了奔头和盼头，使他们恢复了人的尊严和荣誉感。
拿破仑的举止行动在官兵的心目中都留下了极为深刻的印象。他的充沛精力和干净利落的命令赢得了马赛纳的敬佩。在他那闪烁着卓越智慧的目光下，身材魁梧而又趾高气扬的奥热罗，也不免有些畏缩了。4月初，法国的增援部队赶到了，从而使意大利方面军的总兵力增加到493万人，形成了兵力上的优势。
4月10日，奥军的攻势开始进行。皮托利的7个营进攻沃尔特里的色尔弗尼，法军却在11日从容不迫地撤回萨沃纳。拿破仑在此对15日的攻势作了最后部署。11日，拿破仑来到桑托尼奥发现奥军7个营正在进攻据守坚固阵地的兰普恩，而在瓦泰诺泰以西却未见有其他敌军。拿破仑于是口授命令：命拉阿尔普次日上午从正面向阿根陶攻击；马塞纳率部连夜疾进到瓦泰诺泰以西的阿尔塔山脊，于次日拂晓向阿根陶右后方发起进攻。法军的攻击一经实施就大获成功。4月12日清晨，阿根陶在晨雾中发现自己已被包围，只经一场短促战，其部下便一下溃散，并仓皇撤退到了东北方的阿奎。
在瓦泰诺泰初战得胜后，拿破仑即命拉阿尔普据守夺取的这个地盘，一面下令马塞纳命其挥戈北上往克罗和代戈推进，以对付奥军接兵，命奥热罗率部向卡凯尔运动，再折向东勒斯摩，而塞律里埃则从加里希奥直下塔纳河谷以威胁切瓦。同时，拿破仑将司令部移至卡凯尔，并撤掉了梅尼尔的师指挥职务，又将该师的4个旅各拨两个分别给了马塞纳和奥热罗。4月12日下午，拿破仑从前线发布了如下战报：共和国万岁！今天，4月12日，马塞纳将军所率师与拉阿尔普将军所率师一起攻击了据守在瓦秦诺泰重要阵地的奥军，该军达13万人，由博利厄将军本人以及阿根陶将军和罗卡维纳将军所指挥。结果共和军彻底击败了奥军，打死打伤敌人约3000人。这段公报其实不十分准确，奥地利指挥官博利厄当时并不在战场，罗卡维纳则只是阿根陶的一个旅长。但不管怎样，这次首战的胜利已奠定了整个战役的结局。
到了4月13日，奥热罗率部向据守在米勒斯摩的皮埃蒙特军进攻，奥军普罗韦拉将军的独立旅和皮埃蒙将军的一个掷弹兵营阻住了其去路。双方激烈战斗，最后普罗韦拉因弹尽粮绝而被迫投降。
就像在敌人中间插进了一把楔子，拿破仑成功地扩大了奥军与皮埃蒙特军之间的间隙。此后，他又再次组织部队，对阿根陶在代戈的一个后卫部队从坚固阵地发起进攻。马塞纳军从正面进击，拉阿尔普则涉水渡过博尔米达河攻击奥军后方，结果俘获2600名奥军，阿根陶的残部从斯比格罗峡谷向北逃往阿奎。
拿破仑暂时击败其主要对手后，就转而集中对付撒丁军。他命令奥热罗从正面攻击设在切瓦的撒丁军营部，侧面由塞律里埃和马塞纳进行突击。18日，法军各路纵队开始行动，谁知赶到切瓦时，却发现敌营早已撤空。原来，驻守的柯里已乘黑夜命部队退守到了科沙格里亚河畔的坚固阵地。柯里手下有12万人。19日，法军从正面进攻受挫。21日，拿破仑调其兵力组织最后围攻，由于塞律里埃从敌军右翼进行迂回包抄成功，柯里被迫率部溃退。法军进而抵达皮埃蒙特平原，其骑兵师乘胜追击溃退的撒丁军，撒丁国王不得不派特使在凯拉斯科会见拿破仑。
4月28日，拿破仑与撒丁王国的部队单独签订了停战协定。5月15日法国与撒丁王国又在巴黎签订了和约，而且和约内容对撒丁王国是极其苛刻的。接下来只需要单独对付奥地利军队了。拿破仑步步紧逼，奥地利军队节节后退，一直到了洛迪，法军需要渡过阿达河，但这个重要据点有1万奥军防守。5月10日，发生了著名的洛迪战役，拿破仑又一次冒着生命危险冲锋在前。双方在一座桥附近展开了激烈的战斗，拿破仑带领掷弹营冒着奥军封锁桥头的密集炮火向前冲击，直至拿下这座桥，收缴了15门大炮。同时，拿破仑乘胜追击，于15日攻下了米兰，在六七月份又攻下了一系列城市和乡村。所到之处，他肆意抢夺一切有价值的东西，如大炮、火药、枪支，还有艺术品等。尽管意大利保持中立立场，但法国士兵的抢劫行为遭到意大利居民的报复，有数名法国士兵被杀，随之而来的是拿破仑军队对当地居民的血腥的屠杀和更为残酷的洗劫。
二、征战埃及
1797年12月10日，拿破仑从意大利凯旋而归。在巴黎的督政府为他举行了近乎奢华的欢迎仪式。
这天，卢森堡宫内筑起了花台，上面放置着象征和平与自由的神像，牌楼上，挂满了拿破仑从意大利虏获的敌方旗帜。将官们分立在花台两旁，身着彩衣的姑娘们手捧鲜花，静立恭候着拿破仑的到来。
11点钟，拿破仑到了，他穿着佩有绿色棕榈勋章的法兰西学院礼服，国家各大团体竞相向拿破仑致敬，法兰西学院已把他捧上了天，封他为学院院士。约瑟芬挽着他的胳膊，身穿希腊式的宽大长裙，黑花绣边，浑身珠光宝气。外交大臣塔列朗退着走路，为他升道。
他频频挥动着双手向人们致敬。欢迎会上，塔列朗的致词是非常热烈的，他歌颂了拿破仑在意大利的丰功伟绩后，邀请拿破仑讲话。
拿破仑用高亢的声音致谢词：“各位督政、各位将士！法兰西人民为了保证自由、和平与平等，必须同欧洲诸多君主作战。为了获得一部充满理性的宪法，需要战胜18个世纪以来的政治陋习与偏见。在共和之年宪法的指导与各位的奋斗下，已经战胜了这些困难。宗教、封建主义和人权主义在欧洲已经盛行了20个世纪，而今缔结的和平条约，开创了民主与自由的新纪元，我们已经建立了一个伟大的国家。意大利是欧洲文化的发源地之一，由于法军的胜利，使意大利人民的自由灵魂已从古罗马共和时代的坟墓中苏醒。和约的签订，不仅使法国人民获得了幸福，也使全欧洲人民获得了自由与平等。”
巴拉斯最后上台讲演，他称赞拿破仑为法国人民雪耻洗辱，恢复了法兰西民族的自我尊严。
一个月过去了。波拿巴的门庭渐渐冷落下来。他只偶然去官方世界混混。他出席法兰西学院的各种会议。但更经常的是呆在胜利街的寓所里，俯身读书和研究地图。他接待几个至爱亲朋，他的兄弟，他的军官，还有几位政界朋友。他感到苦恼，他怕他的光荣被磨损掉。
“在巴黎，贵人多忘事，什么记忆也保不住。”他对布尔里埃纳说，那阵子他正闲极无聊，烦腻透了。“假如我长期这样无所事事，我就完蛋了。”
但是，他每次在大庭广众中出现，人群立刻爆发出欢呼声。然而他却忧心忡忡地说：“算了，假如我走上断头台，人们也会一样争先恐后挤到我的前面来。”
拿破仑到北部诸港曾作过短暂的视察，他认为，暂时不能轻举妄动北征英国。他想通过远征埃及以威胁通往印度的道路，以强迫顽敌屈膝投降。而且东方早令他心往神驰，想入非非。亚历山大和恺撒的功业老在脑子里盘旋。拿破仑想步其后尘，在尼罗河的滚滚波涛中寻找他们的踪迹，为自己建立一个地中海帝国……他的准备工作既秘密又仔细。不仅仅是征伐作战问题，而是涉及到建立一个国家，建立一个法兰西的大计，他将喝令沙漠后退。扩大法兰西的版图。
督政府因急想摆脱这位讨厌的将军，就供给他黄金、士兵和船只。1798年5月4日，在约瑟芬、杜罗克及拉瓦莱特的陪同下，拿破仑离开了巴黎。5月8日到达土伦。拿破仑在出发前，精心地重新组建了东方军团。贝尔蒂埃是他的参谋长，他的弟弟路易、继子欧仁、上校马尔蒙、缪拉和朱诺及中校迪罗志、上尉拉瓦莱特则组成了参谋班子。
拿破仑在登船前夕，向部队发表了动人心弦的演说：“各位将士：我与你们同甘共苦地并肩作战已经很久，以前的战斗中各位勇敢善战，都是最优秀的军人。在意大利战役后，我没有忘记大家，给了大家一定的财富。这次远征埃及，我希望各位继续努力，如果成功，我会给大家更高的奖赏！”
这支远征队最显著的特征也许是它含有一支由167位科学家、技术和文化专家所组成的考察团。他们是去调查研究埃及的自然资源和古代文物的。他们之中有博物学家、物理学家、化学家、地图测绘人员、工程师、考古学家和艺术家。
在征集这支队伍时，拿破仑得到了他的科学顾问和朋友蒙日的大力协助。他们之间的关系类似第二次世界大战期间，彻韦尔勋爵与丘吉尔首相之间的关系。
1798年5月19日，拿破仑率领大船队从土伦启航了。这支船队由300余艘运输船组成，装载了25万名步兵、3000名骑兵、3000名炮兵和工兵。布律埃斯中将指挥的13艘大型战舰和6艘快速炮帆船负责护航。
拿破仑乘坐的是布律埃斯的旗舰“东方号”。航行途中，来自科西嘉、热那亚和契维塔韦基亚等地的船队也先后加入进来。
这次远征，法军将保密工作做得很好，仅有少数几位高级军官知道他们正驶往埃及。官方直到最后一刻还称他们是英吉利军团的左翼。有关其航行的消息，两周后才传到英国，而且即便在那时，皮特首相还以为法军要在爱尔兰登陆，倒是皇家海军非常警惕。
当时，圣文森特勋爵的地中海舰队正封锁着西班牙港口加的斯，因为那里停泊着一个西班牙海军中队。5月2日，他派纳尔逊海军中将进入地中海去搜索并击毁法国的船队。纳尔逊的舰队最后是由14艘战列舰、2艘快速炮帆船和一艘海岸炮舰组成的。假如它能截住拿破仑的舰队，便一定能轻而易举地重创法国远征军。
但受到风暴和逆风的影响，纳尔逊直到拿破仑早已驶远后才到达土伦。由于他与自己的快速炮帆船分开了，这就不利于他在辽阔的地中海搜索及躲避它的敌人。拿破仑这支庞大的船队在英国舰队行踪不明的情况下，去驶向公海，实际上是一种莽撞的冒险行为，尽管这次行动成功了，也不过属于一种侥幸。
半个多月后，拿破仑的船队平安到达马耳他岛，岛上的马耳他骑士团只象征性的作一下抵抗就逃跑了。拿破仑在这个岛上逗留了一个星期。临走，又留下沃布瓦将军与4000名士兵驻守，大部队则继续远航。6月30日，拿破仑的船队抵达埃及水域。
在长达一个多月的远航中，法军士兵们在船上由于拥挤，食物补给又不足，沿途吃尽了苦头，许多人都晕了船。到达埃及海岸时，拿破仑派一艘炮舰先行抵达亚历山大港，在那里找到了法国领事马戛龙，从他的口中得知，英军纳尔逊的舰船两天前曾到过亚历山大，为此拿破仑感到很不安。他怕一旦遇到英军舰队，法国船队就会吃亏。所以决定立即在亚历山大港西公开阔滩头登陆。为此布律埃斯将军曾力劝他不要这样做，因为岸边水太浅，不适宜登陆，这位将军主张在离亚历山大港14英里的阿布基尔湾去登陆，那里有隐蔽的锚地和滩头，但拿破仑担心英舰会随时来袭击，便坚持下令在小渔村马拉布特附近登陆，该村离亚历山大港仅8英里。
当时的亚历山大，仅有16万人。是一个破旧的小镇，法军登陆的时候，该镇守军还无知觉。拿破仑的部队只登陆了4000人。因为滩头水浅，又刮北风，部队登陆缓慢而又艰难，火炮及给养均未能带上。登陆后，拿破仑即率这4000人向亚历山大进发，法军冲进这个镇时，只以伤亡300人的代价就很快占领了这个港口。