民国时期，对各轮船局采取注册领照并予保护的措施，所以船商纷纷置船设局，请准注册，呈示保护。轮局对外要公布简章，登报开业，以利服务。民国十六年至二十六年日军侵占苏州前，是苏州轮运业的兴盛时期。轮局纷纷开业，轮船四通八达，连一些偏僻的小镇都已通航。先后成立通商恒记内河轮船转运公司、苏锡轮船公司、苏丰玉记轮船公司、惠通轮船局、东利汽船公司、保兴汽船公司、通裕轮船公司、汇源商号等。民国二十三年2月，以苏州为中心的航线有55条，通航里程337公里。日军侵占苏州时，原有轮局损失惨重，一时难以复业，而一批汉奸、地痞、流氓渗人轮业，新办的轮局应运而生。抗日战争胜利后，苏南城乡经济一度繁荣，新老开业的轮局多达85家，开班通航的轮船有92艘。
苏州解放后，1949年12月，建立苏南建华运输公司苏州营业处，是第一家公营轮局机构。1951年1月，调整为华东内河轮船公司苏州分公司；4月，筹组行业指导委员会，对私营轮局进行全面整顿，分线组织联营。1956年初，苏州私营轮运行（局）有19家，轮船8艘，公私合营后全部并人江苏省内河轮船公司苏州支公司953年更名），对外称公私合营苏州轮船公司。1962年公司撤销，改为苏州轮船营业处。1966年又改为江苏省航运公司苏州区公司。1971年4月，改为苏州地区轮船运输公司。1972年轮船公司迁址人民桥，金阊区内遂无客运业务。
【航线】清末，戴生昌、大东、老公茂、招商内河等轮局相继开航苏州至上海、杭州、嘉兴等航线，轮船逐渐驶人苏州城乡内地，航线逐步增至16条，其中始发或途径今金阊区辖境的航线有苏州——上海线小汽船起航于阊门（或盘门），绕城南出黄天荡，经唯亭、昆山至上海。苏州——镇江线小汽船起航于阊门外吊桥，沿运河经浒墅关、望亭、无锡、常州、丹阳到达镇江。
苏州——常熟线小轮船起航于阊门外吊桥，绕齐门，由元和塘过陆墓、蠡口、吴塔到达常熟。
另外，还有起航于阊门外的苏州至黄埭线。
民国元年至七年，苏州有轮局21家，开辟13条航线。二十三年，有轮船局33家,57艘轮船，以苏州为中心构成航线33条，重叠航程1565公里。至民国二十六年日军侵占苏州前夕，客运航线已发展到42家，重叠航程1704公里。以苏州为中心主要构成11条主干线，其中以苏州杭州线、苏州嘉兴线、苏州常熟线在交通地位上最为重要。日军侵占苏州后，轮船业陷于停顿。尔后，伪江苏省政府令颁轮局复业，至民国二十九年苏州有轮局和划船局55家，航线恢复到25条。抗日战争胜利后，轮局有所恢复，通航干支线42条，轮局68家，轮船92艘，航线重叠里程1797公里。
1949年9月，苏州航政处对航线进行全面调查登记，核发临时通行证。1950年共有干支线35条、重叠航程1856公里。此时，新辟通往浒浦、后桥、青浦、沙头、黎里、油泾等地9条航线。市轮船公司于1950年2月开辟苏州至杭州的日班航线，到1955年共经营5条客运航线：苏州杭州线、苏州常熟线、苏州沙溪线、苏州北周庄线和代理无锡轮船公司的苏州常州线。公私合营后，由市轮船公司统一管理各条航线。到1966年，实有航线24条。1972年，市轮船公司迁至南门，金阊区内已无客运航线。
六、货运
苏州内河木帆船水运业务，可追溯至春秋时期的“吴船”。唐宋以后，苏州手工业发达，已成为重要的商品集散地，木帆船成为载货和搭客的重要交通工具。直至清末民初，才出现小轮船运输业，但木帆船运输仍占有较大比重。
苏州解放后，1949年8月成立苏州航政办事处，着手对散居的木帆船开展登记检查和发证工作。1951年7月，组建5个木帆船联营社，只联合生产，不共负盈亏；以后，又将联营社撤并为8个大组，从事苏州市的水上货运业务。1956年2月，合作化高潮时，先后成立12个木帆船运输合作社，实行船只折价人股，按股分红，劳力评分，按分计酬。1959年7月正式成立苏州市航运公司。1962年贯彻“调整、巩固、充实、提高”的方针，航运公司解体，建立航运联社。1963年，航运联社与运输联社合并，成立交通运输联社，实行交通局与运输联社的两块牌子、一套班子的合署办公。1970年8月，撤销交通运输联社，重建苏州市航运公司，隶属市交通局领导。公司直接从事轮队运输，下属分设：长途站、短途站、浒关站、船舶修配厂等单位。1978年8月，下属单位调整为轮运站、长途站、短途站、浒关站、航船站、航船修理厂、船舶修理站等7个单位。1988年2月调整为一分公司、二分公司、三分公司、船舶修理厂、综合服务站、中转服务站、采购供应站等7个基层组织。
【苏州市航运公司】位于金门外南侧，系专门从事内河船舶货物运输的中型国有企业。1999年注册资本2853万元，拥有各类船舶221条，共1.77万吨，门类齐全，有700！1200吨的船队，有40！60吨的单机，适合内河大、中、小批量的货物运输。业务网络遍布长江三角洲地区，主要航线有：苏州至上海、苏州至江阴港、张家港、常熟港（兴华码头），苏州至浙江（杭嘉湖地区）、苏州至徐州（在运河苏北段沿线各地）、苏州至安徽铜陵等均可直达，还可代办苏州至全国各地的沿海、长江干线运输及中转，承接苏州铁路西站到发货物的水路中转、换装。年末职工2200余人。
（第二节）公路运输
苏州自秦置驿道起，通省道路渐被沟通，但直至清末裁撤传驿，通关大道仍只宜轿舆、马车、人力车等通行。民国初期，近代工商业兴起，人员、商品流通量增加，苏州开始修筑公路和兴办汽车运输业。
一、客运
民国二十二年（1933）6月，省建设厅苏嘉路办事处正式开办苏州至嘉兴长途汽车客运。苏嘉路办事处汽车总站设在钱万里桥，并在阊门、金门等地设站，为苏州市历史上开办长途汽车运输业务的第一家暨第一个汽车站。
民国二十五年7月1日，苏嘉、湖嘉两公司合并成立湖嘉、苏嘉两路长途汽车股份有限公司，办事处和车站仍在原址。
商办锡沪长途汽车股份有限公司（简称锡沪公司）车站设在阊门，垫款修筑的锡沪、苏常（熟）两线工程，民国二十四年8月通车营业，起自苏州（吴县）途经辛庄等至常熟，全长39公里。
民国二十四年9月1日，苏福长途汽车股份有限公司（简称苏福公司）车站设阊门横马路，苏福公路筑成通车，起自苏州火车站，经阊门等，至木渎灵岩山脚，全长17公里。翌年，木光段通车，延长至31公里。
民国二十六年苏州沦陷后，上述公司均先后停业。苏福公司于民国二十八年4月复业通车，车站改设在大马路（今阊胥路）。其时，日商大直公司亦在苏福线营业。三十年10月，苏福公司发生横塘覆车事故，因损失甚重而停业，日商华中都市公共汽车公司乘机取而代之。日商大直公司于民国二十七年起先后在苏常、苏嘉、苏锡3条线路上开行客运班车，并将锡沪公司的阊门汽车站占为己有，作为各线班车的始发站。二十八年5月，华中铁道股份有限公司成立，接办大直公司行驶线路，并增开苏州至浏河线。
抗日战争胜利后，公路因长期失养，路面坑洼，桥涵多呈险象，交通管理机构还未设置，路权专营未能认真执行，加之各公司损失惨重，一时难以复业，使小汽车行客运得以应运而生。至民国三十五年2月，已发展有11家汽车行，大小客车计116辆。车辆大多集中在石路、火车站、察院场一带闹市区。
民国三十五年5月18日，苏嘉湖公司通过增资后复业。管理处移到阊门丁家巷9号，车辆驻歇在钱万里桥南堍车库，班车发出在阊门横马路。20日，锡沪公司苏常支线恢复通车，公司仍在阊门外大马路779号老站营业。同年，苏福公路客运改由新苏建设公司经营，8月16日通车，办事处和车站仍在原址。
苏州解放后，苏嘉湖公司5月18日恢复通车。苏常线和苏福线亦先后恢复通车。同年9月，锡沪公司由上海迁至苏州金门外大马路，以仅有3辆旧客车维持营业。为不使苏常线中断，由公营苏南汽车运输公司上海分公司与锡沪公司公私合营，共同经营苏常线。1951年10月11日，组成公私合营苏虞汽车运输公司筹备处，清理锡沪公司资产，公股占67%，私股占33%。1952年私股由政府收购，1953年1月1日筹备处撤销，锡沪公司结朿。同时，公营苏南汽车运输公司上海分公司接办苏常线客运业务，苏州站成为苏州市第一个全民汽车运输企业。
1952年12月，市政府清理苏嘉湖公司资产。1954年10月28日，由私营改为公私合营的苏嘉湖汽车运输公司，从横马路119号迁至五福路66号（今留园路苏州动力机器厂厂址）。1955年末，新苏长途汽车公司（原新苏建设公司）职工42人、9辆客车并人公私合营苏嘉湖汽车运输公司。1956年1月1日成立公私合营苏州汽车运输公司，地址在留园路66号。同时，苏州市民营汽车联营处、常熟民营汽车行及永明修理工场、顺记五金材料行、补胎生产小组等私营单位的人员、车辆也并人公私合营苏州汽车运输公司。至此，完成全行业的社会主义改造。时有职工364人，客车46辆，经营苏嘉、苏湖、苏福、常圩（十二圩）等210公里。
1956年7月，国营苏州公路运输管理处在五福路66号成立，接收公私合营苏州汽车运输公司人员、车辆和全部业务，但公私合营汽车运输公司未撤销。1957年5月11日苏州汽车站迁至大马路（爱河桥）756号，实行统一管理。1958年4月8日国营江苏省苏松汽车运输公司在五福路70号成立，并在上海、无锡设2个营业处。苏州公路运输管理处随之撤销。同年10月21日，苏松汽车运输公司由省属改为地方企业，由苏州专员公署领导，改名为江苏省苏州专区汽车运输公司，1959年9月21日苏州车站改为苏州中心站。1962年6月又恢复为省属企业，改名为江苏省交通厅苏州汽车运输处，下设苏州、无锡、上海、常熟4个一等站，并在苏州、无锡、上海设3个客车队和苏州货运站、苏州货车队。1966年9月，改名为江苏省汽车运输公司苏州区公司。1968年5月11日撤销在上海的全部机构。1969年投资31万元在南门人民桥北堍建新车站，总面积2.3万余平方米。1970年4月车站自爱河桥迁人新站营业。但其管理机构仍设在金阊区留园路70号。
【苏州汽车客运总公司】位于留园路70号。创建于1956年1月，原名苏州市汽车运输公司，公司机构几经调整，于80年代后期改用今名。总公司以汽车客运为主业，兼营零担货运和汽车修制，同时广开门路积极拓展多种经营，在苏州市区及所属各县市设有客运总站、运输分公司、客车厂和常熟公司、张家港公司、太仓公司、昆山公司、平望公司等8个二级单位，以及一批控股、参股或委托经营单位和三产部门，形成以客运为龙头，货运、修理、旅游、商贸等多业并举的经营格局。1999年末拥有固定资产2.63亿元，职工3300余人，营运客货车800辆，站场40多万平方米，营运线路680条，长途班线辐射至13省市56个大中城市，日送旅客5.3万人次。
二、货运
民国十四年，苏州已有转运公司及商行20多家，代办托运货物和报关捐税手续，业主发起成立吴县运输业同业公会。抗日战争胜利后，于三十五年改名为吴县运输商业公会，地点在阊门内下塘街314号，三十七年会员为49户，经营运输的塌车485辆，代客运输。
1952年2月，建立国营苏州市搬运公司，下设南区、西区、东北区3个办事处，有大板车101辆，其中租用私车78辆。1956年7月，实行水陆分管，市搬运公司解体，其中码头装卸部分建立港埠管理科；陆路运输部分，于11月成立民间运输工具管理所，下属运输中队和金阊、养育巷等7个板车运输服务社及互助组经营陆运业务，社员1102人。
1957年6月，恢复搬运公司建制，港运两个机构合并，成立市搬运事业管理处，与搬运公司两块牌子，一套班子合署办公。1958年改为市运输公司后，成立板车运输服务站，下设5个营业站，其中钱万里桥、金门2站设于金阊区内。1962年4月，撤销运输公司，建立市运输联社，恢复合作社体制，联社所属的装卸、运输站改组成装卸运输合作社。
1963年7月，实行水陆合并，市运输联社、航运联社撤销，成立苏州市交通运输联社。1970年9月体制改革，水陆再度划开，港运又与水运分开，陆路运输实行市区合并，建立苏州市运输公司革委会，下设运输场。1979年6月实行国营和集体合营，建立苏州市汽车运输公司。1983年12月，建立江苏省苏州市汽车货运公司。1985年，全公司所属8个运输队及2家修理厂，有职工3100人，营运汽车319辆、2007吨位，经营长短途及起重运输业务。
1980年大力推广全国性联运事业。1984年兴建市联运服务公司，地址设在金门口。网点从火车站营业所扩展为金门、南门、白洋湾火车站、人民路及阊胥路5个营业所暨8个业务受理点。
【江苏省苏州市汽车货运公司】位于苏州市金门外城墙南侧。前身是国营苏州市搬运公司，始建于1952年2月9日。1959年2月6日改组为苏州市运输公司，1962年公司撤销，改建为苏州市运输联社。1970年港、陆划分，9月25日又重建苏州市运输公司。1979年8月6日，改为苏州市汽车运输公司；1983年12月21日改用今名。公司为国、集合营的运输企业，所属有8个运输车队及汽车修理厂、轮胎修理厂、交通旅游服务部、综合经销部等单位。1999年末有职工2120人，营运车辆331辆，经营陆运长、短途货物运输、起重安装，兼营汽车修理、轮胎翻新等业务。1998年公司完成运量66.73万吨，周转量2688.76万吨，营业收人2996.62万元。