举行茶会，调整国民党
蒋介石是永远不会真正放权的，1950年3月1日“复行视事”，他总结了大陆失败的教训，排斥了元老派和“变节”者，使处于危殆中的国民党站稳了脚跟，为传位蒋经国和台湾的稳定奠定了基础。
3月6日下午4时，蒋介石以国民党总裁的身份，于中山堂举行茶会，招待国民党籍的“立法委员”共260余人，并邀国民党中常委于右任、居正、吴忠信、吴铁城、张群、何应钦等参加。蒋介石在会上故作姿态，征询对于“行政院长”继任者人选的意见。与会者对于蒋氏的心理，当然清楚。于是，会上出现了提议由陈诚“组阁”的一边倒意见。立法委员白大成说：“由于陈诚同志过去一年治台政绩的表现，陈氏出组新阁实为适当人选。”立法委员黄健中列举了陈诚具有“行政院长”所必须具备的4项条件，即“有能、有力、有守、有容”。这次茶会的结果，令蒋介石非常高兴。同日，国民党中常会举行临时会议通过准“行政院长”阎锡山辞职，并提名陈诚为”行政院长”。蒋介石复于3月7日，以“总统”名义，将提名陈诚继任“行政院长”的咨文，送交“立法院”。咨文中对陈诚的能力和“成绩”，作了极高的评价。咨文全文为：
总统咨卅九年台统（一）字第一零一号。
中华民国卅九年三月七日。
行政院院长阎锡山呈请辞职，情词恳挚，已予照准。兹拟以陈诚继任行政院院长。陈君籍隶浙江青田，毕业保定军官学校，忠贞干练，公政勤廉，历任师军长、总指挥、总司令、司令长官、政治部长、军政部长、参谋总长、行辕主任、省政府主席等职，部署周详，绩效彰著。去岁受任东南军政长官兼台湾省政府主席，对于整军御敌，政治经济诸项设施，尤多建树，深为台省人民所爱戴。现值巩固台湾，策划反攻大陆之际，以陈君扬历中外，文武兼资，对于剿匪勘乱，夙具坚定信心，任为行政院长，必能胜任愉快。爰依宪法第五十五条第一项之规定，恳请贵院同意，以便任命。
此咨
立法院
总统蒋中正
“立法院代院长”刘文岛在接到蒋介石咨文后，遂于3月8日下午在台北中山堂大礼堂主持“立法院”临时会议，行使对“行政院长”提名的同意权。经投票，在388票中有306票赞成陈诚出任“行政院长”，获得通过。
陈诚在得悉“立法院”对其出任“行政院长”一案已予同意的消息后，对于蒋介石的信任和提拔深表感激，并决心遵照蒋介石意旨，效忠蒋氏。他在其官邸向记者发表谈话说：“诚此次蒙总统提名，立法院同意，受命出任行政院院长，当此国家艰危之际，不胜临深履薄之惧。台湾为国家存亡世界安危所系，其地位之重要，无待赘述。今后一切措施，当恪遵国父遗教，以台湾为三民主义实验区。遵照总统训示，巩固台湾及其他反共基地，以确保全体民众生命财产之安全，并积极作反攻大陆之准备。同时，根据民众需要，贯彻‘人民至上，民生第一’之主张。并依据宪法规定，实行民主政治，团结一切反共力量，以消灭卖国殃民之共匪，抵抗对我侵略之苏俄。尤其国际间反共民主国家之联系合作，当本自助助人之精神，而力求加强。”陈诚在匆匆结束了向记者发表的讲话以后，于6时半，驱车赶赴蒋介石官邸，向这位授予他“行政院长”大权的领导者致敬。
经过5天的紧张筹划，陈诚新“阁”的班底于3月12日得到蒋介石“总统”的批准。陈诚呈蒋批示的名单共两件，一件为全体“阁员”名单，一件为请准任命黄少谷为行政院秘书长、陈良为主计长。蒋介石于此二件呈文上均批示“照准”、“中正”字样。陈诚“内阁”的“阁员”如下：“行政院副院长”张厉生；“内政部长”余井塘；“外交部长”叶公超；“国防部长”俞大维；“财政部长”严家淦；“教育部长”程天放；“司法行政部长”林彬；“经济部长”郑道儒；“交通部长”贺衷寒；“行政院秘书长”黄少谷；“行政院政务委员”除前列“部长”、“秘书长”外，尚有吴国桢、王师曾、杨毓滋、田炯锦、蔡培火、黄季陆、董文倚。
蒋介石按照惯例，于14日晚，在草山官邸设宴招待即将卸任的“行政院长”阎锡山，以示安慰。出席宴会的还有“行政院副院长”朱家骅、“秘书长”贾景德、“副秘书长”倪炯声。
在蒋介石一手导演下，新旧“内阁”于15日交接。阎锡山双手将黄色锦缎包扎的“院篆”，亲交陈诚。阎氏表示：“锡山出任行政院长，九月于兹，回忆在此期间未能扭转时局，惭愧实深！”“相信新阁为极健全有力的内阁，不只是能益国，而且能补锡山任中不逮之过。”陈诚继之起立致词，称：“本人此次奉命出长政院，本赖总统指示及各方面之鼓励，乃决心担起这个任务。”“阎院长九个月来所遭遇的艰苦，众所周知，其反共剿匪之决心，更足使吾人钦佩。本人学问能力，俱感不足，尚望诸位多多指教和协助，并盼本院同仁一致努力。”
对于蒋介石来说，既然已经组建了得力的“内阁”，7个月前设置的“东南军政长官公署”当属多余。时至今日，“国家”、东南区和台湾省，实际已成一体。于是，蒋介石于3月15日下令：
（一）东南军政长官公署着即撤销，其政务部门归行政院接管，军事部门归国防部接管。
（二）该署军事人员，着编并于国防部，并限三月底以前编并完毕。
（三）该署所辖军事机关、部队、学校，着按国防机构组织系统表分别改隶调整。此令。
陈诚亦从此结束东南军政长官之任职，而专心致力于“行政院长”之供职。他根据蒋介石所定“恢复中华民国，解救大陆同胞”的“复职使命”，循其精神确定“政府当前任务”为：“竭尽一切力量，确保以台湾为中心的基地，准备反攻大陆；而外交内政的一切措施，皆以达成这一中心任务为目的。”陈诚“内阁”以忠诚和顺从于蒋介石而闻名。
对于国民党政权在大陆的失败，蒋介石认识到，“勘乱失败的最后一步，还是在党的失败，而党的失败主因，是在三民主义信仰上的动摇。”惟其如此，他在向国民党“七全大会”所作的政治报告中说：“我从下野到复职的这一期间，经过了深长的考虑，最后决定一定要改造本党，认为这是改革政治和改造风气的动力。”
早在1949年7月18日，那时国民党政权还占据着大陆南方和西北部“半壁江山”，蒋介石便在广州国民党中常会第204次会议上提出了《本党改造案》，并将全案颁发各地党部，组织讨论。9月20日，蒋复于重庆发表《告全党同志书》，阐述国民党改造的意义，提出今后的“革命方针”，号召全体党员研讨改造方案，以求实现“新组织、新纲领、新风气”。后来，随着整个大陆的解放，不仅国民党改造工作未能进行，即连原经国民党中常会通过的《本党改造案》也需重新修订。1950年1月，蒋介石在回顾筹备改造工作时说：“中正又约集中央同志若干人，就原案和各级党部及各地同志提出的意见，综合研究，另订方案，作为审订全案的参考。”在蒋介石直接领导下，研拟改造方案的主要参与者，有张其昀、谷正纲、蒋经国等人。
在酝酿国民党改造的过程中，蒋介石成功地争取了在台中央执、监委的支持。7月中旬在台的国民党中央执行委员111人、中央监察委员65人、候补中执委25人、候补中监委14人、共计215人，联名上书蒋介石，要求其“断然决策，彻底改造本党”，表示“全体同志仅当一致服从，率循努力”。中央常会更推出居正、于右任、邹鲁三位元老，向蒋进言，“党的改造为当今根本之图”。这一舆论的制造，使国民党改造方案的正式出台，具备了必要的条件。
7月22日，经过半年的紧张准备，在蒋介石亲自主持下拟订的《本党改造纲要》及《本党改造之措施及其程序》，经国民党中常会临时会议讨论通过。《纲要》规定：“原有本党党员，对于党的主义、政纲、政策真诚信仰，并愿为党继续工作者，仍准保持党籍。”“本党为淘汰腐恶分子，加强革命阵容，原有本党党员凡有下列情形之一者，应予彻底整肃：
（一）有叛国通敌之行为者；
（二）有跨党变节之行为者；
（三）有毁纪反党之行为者；
（四）有贪污渎职之行为者；
（五）生活腐化，劣迹显著者；
（六）放弃职守，不负责任者；
（七）信仰动摇，工作弛废者；
（八）作不正当经营，以牟取暴利为目的者。”党的制裁为：“
（一）警告；
（二）停止党籍；
（三）开除党籍；
（四）集体违犯党纪者，解散其组织。”党的改造的主要措施为：
1，第六届中央执行委员会暨中央监察委员会，均停止行使职权。
2，成立中央改造委员会，行使中央执行委员会及中央监察委员会之职权。中央改造委员会名额为15人至25人，由总裁挑选。
3，中央改造委员会下设各种工作部门或委员会，其人员由总裁遴选之。
4，设中央评议委员会若干人，对党的改造负督导与监察之责，由总裁聘任之。
5，台湾省各级党部及海外各级党部之执行委员会、监察委员会与特别党部工作人员，暂均照常工作，承中央改造委员会之命，进行党的改造。党的改造之主要程序有：宣布中央评议委员及中央改造委员名单；中央改造委员会宣布成立；中央改造委员会接管中执会、中监会及中执会所经营的事业机构；中央改造委员会订颁原有党员整肃办法及征求新党员办法；中央改造委员会订颁各省市及海外党务改造程序，成立各级改造委员会；完成县区级党部改造工作，成立县区党部，并次第成立省市级党部；召开全国代表大会。
在整个改造方案中，以中央改造委员会代行中执会、中监会的职权，乃是一项关键性的决策。剥夺中央执、监委的权力，非同小可。但是，蒋介石说：鉴于“党的信誉之失坠”。“党的失败之惨痛”，“详审本党当前环境，默察革命客观情势，深觉六届中委如不停止行使职权，则今日党的改造，不能发挥其政治革命性的效能，亦即本党今后将无以负荷革命的责任”。他坦率地承认：“在实施本党改造方案的时候，我乃不顾一切反对，排除万难，这是毅然决然地替国民革命打开了一条生路。”
7月26日，蒋介石宣布了16名中央改造委员名单和25名中央评议委员名单。由蒋介石精心挑选的中央改造委员是：陈诚、张其昀、张道藩、谷正纲、郑彦棻、陈雪屏、胡健中、袁守谦、崔书琴、谷凤翔、曾虚白、蒋经国、萧自诚、沈昌焕、郭澄、连震东。蒋经国踏进这个“事权集中”的“太上内阁”，对于他个人、对于蒋介石、对于国民党来说，都意味深长。从国民党耆宿中产生的评议委员为：吴敬恒、居正、于右任、钮永建、丁惟汾、邹鲁、王宠惠、阎锡山、吴忠信、张群、李文范、吴铁城、何应钦、白崇禧、陈济棠、马超俊、陈果夫、朱家骅、张厉生、刘健群、王世杰、董显光、吴国桢、章嘉、张默君。
中央改造委员会于8月5日正式成立，16名委员由蒋介石亲自盟誓，举行了宣誓仪式。蒋介石在改造委员宣誓后，宣读了孙中山1924年在国民党第一次全国代表大会上的讲词全文，并致训说：
回忆自民十三年迄今，已历二十五年，在此期间，不知牺牲了多少的军民和革命同志，然而我们的革命事，今天却遭遇了空前的失败。我个人固然要负很大的责任，现在痛定思痛，为亡羊补牢，希望大家今后依照总理的训示，就是牺牲个人的自由和贡献个人的能力，然后才能有自由有能力担负起革命的大事业，才能改造国家。时至今日，全党同志必须团结一致，同心合作，彻底改造本党，达成反共抗俄的任务。
在是日举行的改造委员会首次会议上，通过了《中央改造委员会组织大纲》；经蒋介石提名，由张其昀任中央改造委员会秘书长。张氏以其诚恳、勤劳而深得蒋之信任，犹如昔日陈布雷之获蒋信任。该委员会下设党组，分由陈雪屏、谷正纲、郑彦英、曾虚白、袁守谦、唐纵、郭澄任主任；其纪律、干部训练、财务、设计及党支史料编纂委员会，分由李文范、蒋经国、俞鸿钧、陶希圣、罗家伦任主任委员。
蒋介石于8月14日，主持了新成立的中央改造委员会首次联合扩大纪念周，并在会上作了《本党今后努力的方针》的重要讲话。蒋介石在这篇讲话中，着重阐明了国民党的组织方针和作风，他特别强调了党和民众的关系，指出：国民党“要成为民众自己的组织”，“党要集中民众的意见以为主张，综合民众的要求以为政策”，“要痛改形式主义和官僚主义的作风”。他从三个方面论述了党的思想路线：一是自由与纪律的问题，强调党员应“为整个国家、全体人民的自由，而牺牲个人的自由，遵守党的纪律，执行党的决议。”二是斗争与合作的问题，提出“一定要肃清阶级斗争的思想”，“依据大多数民众共同的利益，平衡各阶级、各职业的个别利益，促进其互助合作。”三是科学与道德的问题，主张“一定要维护民族历史文化，发扬以仁爱为中心的伦理和国民道德。”
由蒋介石亲自主持制定的纲领性文件《本党现阶段政治主张》，于8月31日在中央改造委员会会议上获得通过。他在这一文件中，表明了国民党反共和改造的决心。他说：“我们自承本党过去的缺失，我们也自信，此后反共抗俄的重任，必须由本党肩负起来。”“我们誓死达成这神圣的任务，赎回以前的罪愆。所以我们痛下决心，做这一次党的改造。”文件中提出了国民党现阶段的下列各项政治主张：第一，“坚持反共抗俄战争，恢复我中华民国领土主权的完整”；第二，“实行民生主义的经济措施”；第三，“完成三民主义的民主政体”；同时，“在反攻收复时期，对于奸匪的元凶首恶，残暴的重要匪干，以及为虎作伥的无耻败类，决不宽赦；对于一般匪党分子，许他们带罪立功，对于胁从民众，概予宽宥”。
9月29日，中央改造委员会通过《党员归队实施办法》，旋即在全台掀起“党员归队”热潮。通过“党员归队”，一方面将因战乱而脱离国民党组织的党员重新纳入组织，一方面藉以清除贪污腐化、“动摇”、“变节”分子。党员办理登记的时间规定在20日以内，不得延展；主办党部在登记结束后15日内，应将报到党员完全纳入组织；党员接到通知后10日内，若有尚未参加组织者，应受党纪处分。与此同时，10月1日中央改造委员会通过《中国国民党省改造委员会组织章程》及《县（市）改造委员会章程》；20日，国民党台湾省改造委员会组成。台省各地方党部国民党改造工作迅速展开。在党员登记和“整肃”的过程中，一批老资格的国民党员宋庆龄、颜惠庆、邵力子、张治中、傅作义等，因留在大陆参加新中国的建设，而被开除党籍。