磁不但在现代医学上有着重要的应用，如磁共振成像技术，常称磁共振CT（计算机化层析术），以及心磁图和脑磁图的应用，而且还有着悠久的历史。在西汉的《史记》（约公元前90年）书中的“仓公传”便讲到齐王侍医利用5种矿物药（称为五石）治病。这5种矿物药是指磁（Fe3O4）、丹砂（HgS）、雄黄（As2O3）、矾石（硫酸钾铝）和曾青（Cu2Co3）。随后历代都有应用磁石治病的记载。例如，在东汉的《神农本草》（约公元2世纪）药书中便讲到利用味道辛寒的慈（磁）石治疗风湿、关节痛、除热和耳聋等疾病，南北朝陶弘景著的《名医别录》（公元510年）医药书中讲到磁石可以养肾脏、强骨气、通关节、消痈肿等。唐代著名医药学家孙思邈著的《千金方》（公元652年）药书中还讲到用磁石等制成的蜜丸，如经常服用可以对眼力有益。北宋何希影著的《圣惠方》（公元1046年）医药书中又讲到磁石可以医治儿童误吞针的伤害，这就是把枣核大的磁石，磨光钻孔穿上丝线后投入喉内，便可以把误吞的针吸出来。南宋严用和著的《济生方》（公元1253年）医药书中又讲到利用磁石医治听力不好的耳病，这是将一块豆大的磁石用新绵塞入耳内，再在口中含一块生铁，便可改善病耳的听力。总的说来，在各个朝代的医药书中常有用磁石治疗多种疾病的记载。明代著名药学家李时珍著的《本草纲目》关于医药用磁石的记述内容丰富并具总结性，对磁石形状、主治病名、药剂制法和多种应用的描述都很详细，例如磁石治疗的疾病就有耳卒聋闭、肾虚耳聋、老人耳聋、老人虚损、眼昏内障、小儿惊痫、子宫不收、大肠脱肛、金疮肠出、金疮血出、误吞针铁、疔肿热毒、诸般肿毒等10多种疾病，利用磁石制成的药剂有磁朱丸、紫雪丹和耳聋左慈丸等。
对于失眠而言，磁石具有潜阳安神的作用。可用于阴虚阳亢所致的烦躁不宁、失眠等症。用法为10～30克，水煎，睡前顿服。具有潜阳安神的功效。主要用于阴虚阳亢所致的烦躁不宁、失眠等症。