育苗韭菜因前期生长缓慢，杂草危害严重，一般可在播后苗前进行土壤处理。适用的药剂有33％除草通（施田补）
乳油，每亩100～150毫升或48％地乐胺乳油，每亩200～210毫升，对水40～50千克喷雾土表，可防除一年生禾本科杂草和部分阔叶杂草。
在韭菜出苗后禾本科杂草较多时，可在杂草2～5叶期选用禾本科杂草茎叶处理剂，35％稳杀得（吡氟禾草灵）乳油或15％精稳杀得乳油50～57毫升，或10％禾草克（喹禾灵）乳油、5％精禾草克乳油50～67毫升，或20％拿捕净乳油60～100毫升，加水40～50千克，配成药液喷雾。上述药剂药效迟缓，但除草彻底，对阔叶杂草无效，对韭菜安全。如果韭菜出苗后阔叶草也较多，可每亩用20％使它隆（氟草定）乳油50毫升，配成药液进行茎叶处理。也可将稳杀得、禾草克、盖草能、拿捕净单用的最低量和使它隆单用的最低量混合喷雾。
老根韭菜在割茬后，先松土，清除田间大草，待韭菜伤口愈合长出新叶时浇一次水，然后用除草剂喷洒土表。适宜的除草剂及其用量是：33％除草通乳油每亩100～150毫升，或50％扑草净可湿性粉剂每亩100～150克，或48％地乐胺乳油200～250毫升，或50％乙草胺乳油80～100毫升。