亨利五世本来对教会采取顺从的态度，但是登上皇位后便开始希望继承德意志皇帝们的权利，与罗马教会的斗争仍在持续着。
1110年，亨利五世进军罗马，在次年与教会签署了一个秘密协定中，亨利决定放弃授职权，但条件是：教皇必须命令德意志的主教们交出一切从皇帝那里获得的财产和权力，不服从者将受到绝罚。在随后的加冕典礼中，这些内容才公布于众，马上引起了在场的德意志主教和贵族们的激烈反对。
在这样的形势下，教皇帕斯卡利斯二世拒绝为其加冕，于是亨利五世勃然大怒，将教皇和枢机主教们囚禁了起来。直到两个月后，教皇无奈为其加冕称帝。但是当亨利离开罗马后，教会的改革派否定了这个屈辱的协定，并宣布对皇帝施行绝罚。
1116年，亨利五世再度来到意大利，希望与教会谈判，以解决授职权的争端。但帕斯卡利斯二世深知与德意志人的谈判等于与虎谋皮，根本谈不出什么结果，于是便逃到意大利南部，让亨利无法找不到他。继任者格拉西乌斯二世在教皇位置上没坐几天，也感觉到无法满足德意志人的胃口，索性也跑回了自己的家乡躲了起来。
亨利一看这样的局面，干脆自己册封一位教皇格里高利八世来与自己谈判，这样的作为自然遭到了教会和世俗各方面的强烈反对。1118年，格拉西乌斯二世在家乡宣布绝罚皇帝和对立教皇，但是他也没敢再回由亨利和格里高利八世占据的罗马，而是直接跑到了法国克吕尼修道院，不久后就死在了那里。亨利五世始终找不到真正代表教会利益的教皇，认识到谈判已经不可能获得什么进展，于是扔下罗马，回德意志去了。
教会的改革派此刻都围聚在了克吕尼，他们选举出了新任教皇卡里斯图斯二世，这个人来自勃艮第的皇室，与德意志和法兰西的王族多少有点亲属关系。1120年，新教皇回到罗马，罢免了对立教皇格里高利八世，并将其审判后关进了一座修道院。然后教皇派遣了三位枢机主教前往德意志，经过近两年时间艰苦的谈判，终于在1122年9月23日与亨利五世签署了一份《沃尔姆斯协议》。协议规定：
德意志地方主教、修道院院长和各级神职人员由教会内部选举产生。但皇帝可以出席会议，在杜绝暴力和圣职买卖的前提下，支持自己中意的候选人。当选主教将由皇帝授予其世俗权力，以权杖为象征，主教对皇帝的效忠誓约将得到保护和遵守。协议签署后，教会特使随即宣布，正式收回对亨利五世的绝罚令。
耗时半个世纪之久的“授职权之争”终于在教会和皇帝双方的理智妥协中结束了，虽然皇帝保留了部分传统权力，但与奥托大帝时代皇权跋扈相比，罗马教会无疑获得了这场斗争的胜利。在基本摆脱了世俗权力对宗教事务的操控之后，天主教势力才真正的延伸到德意志境内，并在以后的岁月中不断的去操纵帝国皇帝的选举。而德意志与罗马教会，在紧密结合中所产生出来的矛盾和纷争，却依然没有完结。
在《沃尔姆斯协议》签订的时刻，一场由天主教会发起的，并将西欧地区广大热血青年鼓动起来，向东征服的战争，早已揭开帷幕，并已经浩浩荡荡的进行了二十余年。
这就是绵延两百年之久的“十字军东征”。