姬松茸的采后管理是指停水养菌、床面清理、补充水分，添加营养物等。姬松茸采后管理做得好，可在不增加投资的情况下提高后几茬的产量，达到提高姬松茸生产的总量水平。因此，采后管理是姬松茸整个栽培中重要的一环。
（1）床面清理。姬松茸采后要及时清理料面，将残菇、杂物清除，有露出料面的地方要补上新土块。
（2）净化消毒。在采后姬松茸转茬之间要对环境进行处理。对床面要保持短时间的干燥，在门、窗、床架上喷洒杀虫剂防止蚊蝇飞入。菇房外堆积的杂物、垃圾要清除，使菇床内外的环境干净卫生。
（3）停水养菌。姬松茸采后床面要停水2～3天，让菌丝恢复生长、积累营养。在采后的凹坑处有白色新菌丝发生时，开始调水，并补充营养，待10～15天后，第二茬菇便可形成，然后进行第二茬菇的管理。
（4）补充营养。姬松茸采后，培养料的养分消耗很多，应及时补充营养物质。