食用菌菌种保藏方法很多，适用于姬松茸的有试管斜面低温保存、矿油保藏和麦粒法保藏。试管斜面低温保存是一种最简单、最常用的方法，但最大的缺点是转管频繁，营养生长过多，易发生退化。
保藏的方法：常用加富PDA培养基，在其中加入0.2％磷酸二氢钾和0.05％硫酸镁等缓冲剂，以中和在保存期间产生的有机酸。为了减少培养基水分散失，延长保藏时间，可将琼脂用量增加到25％。培养基斜面也不宜过长，以高层斜面培养基为好。因高层斜面培养基失水干燥较缓漫，可延长保藏期。培养基接种后，放在25℃温度下培养，待菌丝长满斜面后，贴上标签。注明菌种名称和保藏开始日期，将菌种捆扎好并用牛皮纸或塑料薄膜包好后，放入4℃～6℃下保藏，一般可保藏3～4个月。若将棉塞换成带孔的橡皮塞（塞孔用棉花堵住），可减慢培养基水分蒸发速度，还可防止棉塞因受潮而发霉，可保存6个月。