在培养期间一定要经常检查挑选，而不可长满后再挑选留用。培养期间一是观察菌种是否生长正常，如菌丝颜色、长势、长速等；二是有无污染，发现有污染的母种应及时拣出。
母种菌丝长满管后，即可选择菌丝生长浓密、粗壮整齐、无杂菌污染的菌种使用或放入冰箱内保存。同时，应计算菌种成品率和检查培养时间，如菌种成品率低，培养时间太长都应查找原因。如需检查菌种长势，可进行再生试验。
其方法是：在母种菌种斜面中部取黄豆大小一块菌种，移植到培养皿中，培养皿内先铺一张滤纸或放数层卫生纸，加少许冷开水使纸湿润，在25℃条件下培养3～5天。若菌种正常萌动，长出旺盛、整齐的菌丝，表示菌种生活力旺盛，质量好。如培养5～7天仍未发菌，原样不动，说明菌种长势弱，再生能力差，不宜利用。