制作滑菇菌种所需的主要设备有：
1接种室。面积5～6平方米、高2米的房间，要求严密、透光、平整、光滑、清洁。接种室外面设备有一个1～2平方米的缓冲间，供工作人员换衣服鞋帽等用。接种室和缓冲间出入口安装推门，门不宜对开，应对角线安装，以减缓开门时空气流动。门窗与墙面平齐，便于消毒灭菌。接种室也可安装一个小型玻璃推窗，便于内外物品传递，减少进出接种室次数。接种室顶部也可安装小型排风扇，使用后排湿通风。接种室和缓冲间各安装紫外线灭菌灯波长257BF.BFQ3纳米，功率30瓦及日光灯各一支见图3。
2接种箱。接种箱是供菌种分离、移接的专用木制箱，要求封闭严密、操作方便、提供无菌环境，以便进行无菌操作。接种箱分单人或双人操作箱。接种箱的前后两侧框架中安装玻璃，可灵活开闭，便于接种观察和操作。玻璃窗下面木板上开两个直径15厘米的圆洞，洞口上装有40厘米长的布套袖，双手伸入箱内操作时，布套的松紧带能紧套住手腕处防止外界空气中的杂菌进入。洞外面安装可滑动的长方形盖板。箱内顶端装有紫外灯和日光灯各一支见图4。
接种室箱一般一个月左右消毒一次，先用5％石炭酸溶液或0BF.BFQ25％新洁尔灭或2％来苏儿溶液喷雾消毒，再用福尔马林和高锰酸钾熏蒸消毒，使用剂量：每立方米空间甲醛10毫升、高锰酸钾5克。先将甲醛溶液放入容器中，然后倒入高锰酸钾，利用高锰酸钾的氧化作用，使甲醛沸腾，很快蒸发完毕。关闭门窗1天后即可使用，如同时用紫外灯照射30分钟，消毒效果更好。定期检查接种室箱空气中杀菌情况，以了解消毒效果，便于及时改进，提高接种效果。
3培养室。培养室用来培养原种和栽培种，要求清洁、保温、干燥、通风、遮光。室内装有多层培养架，用木头、毛竹、水泥钢管均可，要求平整牢固。培养室不宜过大，面积20～25平方米，培养5000瓶菌种为宜，这样容易控制培养条件。室内安装能开关的地窗，并装有纱窗，以便调节空气，防止害虫进入。为保持室内一定温度，可安装电炉和控温仪，自动控制温度。有条件的可安装空气调节器，以便夏季降温。培养室的消毒和接种室相同。为了杀虫可用敌敌畏原液加热熏蒸，用量是每立方米的培养室用敌敌畏100毫升。
4恒温箱。恒温箱一般用来培养母种，可在医用器材商店购置。
5高压锅。目前工厂生产的高压蒸汽灭菌锅有手提式、直立式、卧式三种。手提式高压锅容量较小，一般用作母种培养基灭菌，立式和卧式高压锅容量较大，用作原种和栽培种培养基灭菌。
6灭菌灶。简易灭菌灶，可利用民用灶，配置相应的蒸笼，叠于锅上进行灭菌。用红砖、水泥建成的专用灭菌灶要注意结构严密，防止漏气，温度能保持100℃以上。也可采用圆形的油桶，去掉盖，用砖架起，桶内放水，在水上用木条作支架，用薄膜把油桶的上端扎实，桶下烧水，蒸汽上升，将塑料薄膜凸起来，蒸汽水沿着桶壁流下，温度可升至100℃，效果很好，方法简单。
7菌种瓶。容量750毫升，口径3BF.BFQ5厘米的玻璃瓶，用于制作原种和栽培种。菌种瓶最好是无色透明的，便于观察瓶内菌丝生长及杂菌污染情况。
8塑料袋。有聚丙烯塑料袋、聚乙烯塑料袋两种。根据制种袋和栽培袋的要求，选用适宜规格的成品袋或桶料及塑料套环。菌种袋的规格很多，根据自己需要选用。聚乙烯袋不耐高温，只适用于100℃常压蒸汽灭菌。聚丙烯袋熔点为165℃，用于高压蒸汽灭菌，但耐低温性能差，柔软性也差，冬季使用不如聚乙烯塑料袋。塑料袋的质量，要求厚薄均匀，无折痕，无砂眼，接缝要牢固。由于聚丙烯薄膜强度较高，一般选择厚度为0BF.BFQ05～0BF.BFQ06毫米，聚乙烯薄膜厚度以0BF.BFQ07～0BF.BFQ08毫米为宜。JP