可以把小麦或土豆田、苹果园、甚至人工种植的树林看做农业生态系统。与生物的自然群落相比，它们都是由人的劳动创造的。然而，劳动还创造了工业生态系统。它们的区别在哪里？主要区别在于使用的主要能源不同。
对于农业生态系统而言，主要能源是阳光。依靠这种能，农业生态系统从无机物中创造出其生存所必需的一切。农业生态系统的其他生物吃掉绿色植物所储备的能。在农业生态系统中还有那样一些生物，它们既吃能、还吃来源于动物的食品。在所有这些情况下，对于农业生态系统而言，太阳光的能是最原始的能。进入农业生态系统的其他来源的能（电能、燃料能等等）与被生物所利用的太阳光的能相比就显得很少。
对于工业生态系统而言，它的能源主要是还未恢复本来面目的能源储备：煤、石油、天然气。也可能是核电站和水电站生产的电能。
农业生态系统与城市生态系统有着密切的联系，它们互换自己的产品。另一方面，城市生态系统由于往大气中排放有害物质和污水而污染城市附近的农业生态系统。
农业生态系统与自然生态系统的联系另有不同。它们能够互换生物。因为在两个系统中都可以看到同类的植物和动物。并且，农业生态系统十分稳定。要使农业生态系统长期存在，就必须一直有人的影响，人要施肥，要监控动物和植物的数量，因为它们会降低收成或毁掉一部分产品。