一般来说，牙周病不属于遗传性疾病，但在某些类型（如青少年牙周炎）则常有家族史。青少年牙周炎的发生与患者外周血中多形核白细胞趋化功能减弱和吞噬功能缺陷有关，而这种缺陷具有家族性。患者的同胞也可患病或虽未患病却也存在白细胞功能缺陷。有的学者对青少年牙周炎患者进行家谱分析，证明有遗传因素，为常染色体隐性遗传。
其他一些遗传病也常伴有牙周破坏，如掌跖角化一牙周破坏综合征，为常染色体隐性遗传病。又如综合征为染色体异常所致的智能缺陷和生长迟缓，常伴有多形核白细胞的数目或功能缺陷，降低了身体抵抗力，因此这类病人常伴有较严重的牙周病。