既然《水浒传》只是一部文学作品，没有记载什么史实，那就应该说是与历史无关，也就与历史上的农民起义无关了。不！《水浒传》与农民起义密切相关，因为《水浒传》这部文学作品的内容，主要是描述一次农民起义的经过，反映了促成农民起义的一些社会现象，也就是农民起义的起因。中国农民起义的次数很多，但是以农民起义为题材的小说就只有这么一部（在世界上也很少），因此，《水浒传》是研究农民起义问题的重要参考书。
其次，《水浒传》成书之后，又成为明清两代多次农民起义的好教材。在专制王朝时代，起义就是谋反，是杀头灭族的大罪。你就是心怀不轨，有此打算，也无处可学，无处可问。有了一部《水浒传》，既能鼓励你下决心，又能教你如何操作，真是聚义、起义的实用课本。请看第15回中“吴学究说三阮撞筹”的一段话：
吴用道：“我只道你们弟兄心志不坚，原来真个惜客好义。我对你们实说，果有协助之心，我教你们知此一事。我如今现在晁保正庄上住，保正闻知你三个大名，特地教我来请你们说话。”阮小二道：“我弟兄三个，真真实实地并没半点儿假！晁保正敢有件奢遮的私商买卖，有心要带挈我们，一定是烦老兄来。若还端的有这事，我三个若舍不得性命相帮他时，残酒为誓：教我们都遭横事，恶病临身，死于非命！”阮小五和阮小七把手拍着脖项道：“这腔热血，只要卖与识货的！”吴用道：“你们三位弟兄在这里，不是我坏心术来诱你们，这件事非同小可的勾当！目今朝内蔡太师是六月十五日生辰，他的女婿是北京大名府梁中书，即日起解十万贯金珠宝贝与他丈人庆生辰。今有一个好汉姓刘，名唐，特来报知。如今欲要请你们去商议，聚几个好汉，向山凹僻静去处，取此一套富贵不义之财，大家图个一世快活。因此特教小生只做买鱼来请你们三个计较，成此一事，不知你们心意如何？”阮小五听了道：“罢！罢！”叫道：“七哥，我和你说什么来！”阮小七跳起来道：“一世的指望，今日还了愿心！正是搔着我痒处！我们几时去？”吴用道：“请三位即便去来，明日起个五更，一齐都到晁天王庄上去。”阮家三弟兄大喜。有诗为证：
学究知书岂爱财，阮郎渔乐亦悠哉！
只因不义金珠去，致使群雄聚义来。
虽然这种古白话和现代白话还有一定的差距，但是这段话我们都能看懂，而且能体会出每一句话的真实含意。特别是阮小五和阮小七拍着脖项（颈子）说“这腔热血，只要卖与（给）识货的！”真是如见其人，如闻其声。直到现在，有人愿意代别人卖命去做冒险的事，有时候还会说出这样的话来。难怪专制王朝会把《水浒传》看成一部极有煽动性的危险的书。
一部《水浒传》直接推动了明、清两代许多次的农民起义，这是文学作品影响了历史的进程。特别是在清代，有些地方官审理谋反的案子，案犯在供词中坦率地承认，他们的密谋起事就是从《水浒传》里学来的。这是《水浒传》一度成为禁书的主要原因。