推拿治疗的治疗原则应遵循：治病必求其本，扶正祛邪、调整阴阳，因时、因地、因人制宜的治疗原则。
推拿治疗的治疗原则是在整体观念和辨证论治的基本精神指导下制定的，对临床治疗具有普通性指导意义。由于疾病在证候表现是多种多样的，病理变化是极为复杂的，且病情又有轻重缓急的差别。不同的时间、地点与个体发病，对病情变化也会产不同的影响，因此，只有善于从复杂多变的疾病现象中，抓住病变的本质，治病求本，采取相应的措施扶正祛邪，调整阴阳，并针对病变轻重缓急以及病变个体和时间、地点的不同，而治有先后，因人、因时，因地制宜，才能获得满意的治疗效果。
治病求本就是治病时必须寻求疾病的根本原因，并针对其根本原因进行治疗。这是辨证论治的一个根本原则。如腰腿痛，可由椎骨错位、腰腿风湿、腰肌劳损等多种原因引起，治疗时就不能简单地采取对症止痛的方法，而应针对其本即病因，分别用纠正椎骨错位、祛风除湿、舒筋通络等方法进行治疗，才能取得满意的疗效。又如失眠，根据其病因不同而分别采用补养心脾，滋阴降火、清热化痰等方法治疗。扶正祛邪就是要扶助正气、祛除邪气，改变邪正双方的力量对比，使之有利于疾病向痊愈方面转化。如风寒之邪引起的肩周炎，寒邪使气血管凝滞，组织粘连，进而阻碍气血的运行而伤正。推拿时用扳、摇、抖等手法可以解除粘连即是祛邪，滚、揉、按、搓等手法可以助气血的运行即是扶正。调整阴阳也是临床治疗的根本法则之一，因为疾病的发生从根本上说就是阴阳的相对平衡遭到破坏。如肝阳上亢所致的头痛，常用推桥弓，扫散法，擦涌泉等手法以平肝潜阳，从而使失衡的阴阳得到调整，达以治疗目的。
因时制宜就是指手法操作时要考虑时间和季节因素。如心肾不交的失眠症，多属阴不足以制阳，阳亢而有余，据此，推拿时间如选择在夜间（阴时）进行补阴制阳的手法治疗，则较白天（阳时）用同样的手法治疗效果更好。又如在夏季，天气炎热，病人皮肤多汗而涩滞，手法直接操作，容易使皮肤破损。因此治疗时可在病人皮肤表面涂一些保护性介质，并注意少用摩擦类手法等。
因地制宜是指手法治疗时要根据地理情况灵活运用。如东南沿海地区多热多湿，故应多用清热去湿手法；而西北地区多风多寒，故应多用疏风散寒手法。即地理相异，而治病则考虑实施不同的手法。因人制宜是根据病人年龄、性别、体质等不同而选择不同的治疗方法。如体质强壮者，手法刺激量可以相对大一些，而体质虚弱，手法刺激量亦相对小一些。推拿疗法的实际应用中，要全面地、客现地考虑各方面的情况，才能够更好发挥其作用。